এশেরিকিয়া কোলাই

অ্যাশেরিকিয়া কোলাই (//;[১]ই. কোলাই নামেও পরিচিত ) একটি গ্রাম নেগেটিভ,রড-আকৃতির, কোলিফর্ম ব্যাক্টেরিয়া। এটি এশেরেকিয়া গণের অন্তর্ভুক্ত যা সচরাচর উষ্ণ রক্তের প্রাণীর অন্ত্রে পাওয়া যায়। [২] বেশিরভাগ ই.কোলাই ক্ষতিকর নয় তবে কিছু ই.কোলাই তাদের হোস্টের শরীরে মারাত্মক খাদ্য বিষক্রিয়ার কারণ হতে পারে। [৩] ক্ষতিকর নয় এরূপ ই.কোলাই স্ট্রেইন হোস্টের শরীরের বৃহদন্ত্রে বাস করে। এরা ভিটামিন কে২ তৈরি করায় অবদান রাখে ,[৪] এবং অন্ত্রে ক্ষতিকর রোগ সৃষ্টিকারী অনুজীবের দল গঠনে বাধা দিয়ে হোস্টের সাথে পরজীবি হয়েও একটি সিম্বায়োটিক সম্পর্ক বজায় রাখে। সিম্বায়োটিক সম্পর্ক হল, যখন কোন পরজীবি তার আশ্রয়দাতা হোস্টের উপকারে আসে এবং উভয় পক্ষ একে অপরের সান্নিধ্যে লাভবান হয়। ই.কোলাই ব্যাক্টেরিয়া প্রাণীর মলের মাধ্যমে পরিবেশের সংস্পর্শে আসে। অন্তত তিনদিন অবাত শ্বসন দশায় এরা টিকে থাকতে পারে। এধরনের ব্যাক্টেরিয়ামের আদিকোষে কোসমিড নামক প্ল্যাসমিড কস অপেরন নামক অঞ্চলে অবস্থিত ColE1 নামক জিন এনকোডিং এর মাধ্যমে কোলিসিন ,মাইক্রোসিননামক ব্যাক্টেরিওসিন উৎপাদন করতে সক্ষম।
জীববিজ্ঞান ও জৈবরসায়ন
[সম্পাদনা]

প্রকারভেদ ও অঙ্গসংস্থান
[সম্পাদনা]ই.কোলাই একটি গ্রাম নেগেটিভ ব্যাক্টেরিয়া। এরা অক্সিজেনের উপস্থিতিতে সবাত শ্বসন প্রক্রিয়ায় এটিপি তৈরি করে। তবে অক্সিজেনের অনুপস্থিতিতে ফারমেন্টেশন প্রক্রিয়ায় অবাত শ্বসন ঘটাতেও এরা সম্ভবপর।[৫] এদের গঠন রড আকৃতির এবং আকারে প্রায় ২.০μm (মাইক্রোমিটার)লম্বা এবং ০.২৫-১.০μm (মাইক্রোমিটার) প্রশ্বস্ত। ই.কোলাই কোষের ঘনত্ব প্রায় ০.৬-০.৭μm3[৬]
পেপ্টিডোগ্লাইক্যানের তৈরি পাতলা আবরণ ও একটি বর্হি আবরণের উপস্থিতি ই.কোলাইকে গ্রাম নিগেটিভ ব্যাক্টেরিয়া করেছে। কোষ স্টেইনিং এর সময় ই.কোলাই স্যাফ্রানিন এর গোলাপী রঞ্জকে রঞ্জিত হয়। কোষ দেয়ালে বাইরের আবরণ ই.কোলাই প্রতিরক্ষা দেয়। তাই পেনিসিলিয়াম মতো এন্টিবায়োটিক দ্বারাও এরা ক্ষতিগ্রস্ত হয় না।

বিপাক
[সম্পাদনা]ই.কোলাই ভিন্ন পরিবেশে ভিন্ন দশায় টিকে থাকতে পারে। অবাত শ্বসনের সময় মিশ্র এসিড ফার্মেন্টেশনের ক্ষেত্রে ই.কোলাই ল্যাক্টেট, সাক্সিনেট, ইথানল, এসিটেট এবং কার্বন ডাই অক্সাইড উৎপন্ন করে। বেশ কিছু উপায়ে মিশ্র এসিড ফার্মেন্টেশন হাইড্রোজেন গ্যাস উৎপাদন করে। তবে এসব ক্ষেত্রে ই.কোলাই এর নিম্ন মাত্রার হাইড্রোজেনের উপস্থিতি দরকার হয়। তাই সচরাচর ই.কোলাই হাইড্রোজেন গ্রহণ করে এরকম জীবের শরীরে বাস করে। একই কারণে, মেথানোজেন বা সালফেট-ক্ষয়কারী মেথানোজেনেজ নামক এনজাইম ই.কোলাই ব্যাক্টেরিয়াতে পাওয়া যায়। [৭]
কালচারে বৃদ্ধি
[সম্পাদনা]ই.কোলাইয়ের বৃদ্ধি গড়ে ৩৭°সেন্টিগ্রেড (৯৮.৬° ফারেনহাইট) তাপমাত্রায় হয়। তবে গবেষণাগারে কিছু ই.কোলাই ৪৯° সেন্টিগ্রেড ( ১২০° ফারেনহাইট) তাপমাত্রায় পর্যন্ত সংখ্যাবৃদ্ধি করতে পারে। গবেষণাগারে বিভিন্ন ধরনের মাধ্যমে ই.কোলাই এর বৃদ্ধি করানো হয়। গ্লুকোজ, এমোনিয়াম ফসফেট, মনোবেসিক, সোডিয়াম ক্লোরাইড, ম্যাগনেশিয়াম সালফেট, পটাশিয়াম ফসফেট, ডাইবেস এবং পানির সমন্বয়ে [৮] যেকোন মাধ্যমে ই.কোলাই কালচার করা যায়। স্ববাত কিংবা অবাত উভয় ধরনের শ্বসন ই.কোলাই কালচারে ব্যবহার করা যায়। এমনকি পাইরুভিক এসিড, ফরমিক এসিড, হাইড্রোজেন এবং এমিনো এসিডের ব্যবহার করা যেতে পারে। অক্সিজেনের অনুপস্থিতিতেও এই ব্যাক্টেরিয়া সংখ্যা বৃদ্ধি করতে পারে, যা পানিবিহীন পরিবেশেও টিকে থাকতে সাহায্যকারী [৮]
জিনেটিক গ্রহণক্ষমতা
[সম্পাদনা]ই.কোলাই এবং এই ধরনের ব্যাক্টেরিয়াগুলো ব্যাক্টেরিয়াল কনজুগেশন বা ট্রান্সডাকশন পদ্ধতিতে ডিএনএ ট্রান্সফার করতে পারে। এতে জিনেটিক বস্তু অনুভূমিকভাবে একটি পপুলেশনে বিস্তার লাভ করতে পারে। ব্যাক্টেরিওফেজ ভাইরাস ট্রান্সডাকশন প্রক্রিয়া ব্যবহার করে শিগেলা ব্যাক্টেরিয়ার শিগা টক্সিনের জিনেটিক কোড ই.কোলাইয়ে স্থানান্তর করতে সক্ষম হয়।

[৯] যা ই.কোলাই এর স্ট্রেইন ই.কোলাই ০১৫৭:এইচ৭ তৈরিতে ভূমিকা রেখেছে। ই.কোলাই ০১৫৭:এইচ৭ স্ট্রেইন হল শিগা টক্সিন উৎপন্নকারী ই.কোলাই স্ট্রেইন।
ই. কোলাই স্ট্রেনের ফাইলোজেনি
[সম্পাদনা]এই অনুচ্ছেদটি মেয়াদোত্তীর্ণ। |
এই প্রজাতির অন্তর্ভুক্ত বহু স্ট্রেনকে আলাদা করে চিহ্নিত ও তাদের বৈশিষ্ট্য নির্ধারণ করা হয়েছে। সেরোটাইপ (উপরে দেখুন) ছাড়াও, এগুলিকে তাদের ফাইলোজেনি অর্থাৎ অনুমানকৃত বিবর্তনীয় ইতিহাসের ভিত্তিতে শ্রেণীবদ্ধ করা যায়; যেমন নিচে ২০১৪ সালের তথ্য অনুযায়ী প্রজাতিটিকে ছয়টি দলে ভাগ করা হয়েছে।[১০][১১] বিশেষ করে সম্পূর্ণ জিনোম অনুক্রম ব্যবহার করে অত্যন্ত দৃঢ় সমর্থনযুক্ত ফাইলোজেনি পাওয়া যায়।[১২] ফাইলোগোষ্ঠীর কাঠামো নতুন পদ্ধতি ও অনুক্রম ব্যবহার করলেও মজবুত থাকে, যা মাঝে মাঝে নতুন দল যোগ করে; ২০২৩ সাল নাগাদ এর সংখ্যা ৮ বা ১৪টি হয়েছে।[১৩][১৪]
ফাইলোজেনেটিক দূরত্ব ("সম্পর্কিততা") ও রোগ সৃষ্টির ক্ষমতার মধ্যে যোগসূত্র খুবই সামান্য,[১২] উদাহরণস্বরূপ, O157:H7 সেরোটাইপ স্ট্রেনগুলো, যা একটি ক্লেড গঠন করে ("একটি অনন্য গোষ্ঠী")—নিচের দল E—সবগুলোই এন্টেরোহেমোর্যাজিক স্ট্রেন (EHEC), কিন্তু সকল EHEC স্ট্রেনই ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত নয়। বাস্তবে, শিগেলা-র চারটি ভিন্ন প্রজাতি ই. কোলাই স্ট্রেনগুলোর মাঝে অবস্থান করছে (উপরে দেখুন), অন্যদিকে ই. আলবার্টি ও ই. ফার্গুসোনি এই দলের বাইরে। প্রকৃতপক্ষে, একটি ফাইলোজেনোমিক গবেষণায় যেখানে টাইপ স্ট্রেন অন্তর্ভুক্ত ছিল, সকল শিগেলা প্রজাতিকে ই. কোলাই-এর একটি একক উপপ্রজাতির মধ্যে স্থান দেওয়া হয়েছে।[১২] ই. কোলাই-এর সমস্ত সাধারণভাবে ব্যবহৃত গবেষণা স্ট্রেন দল A-এর অন্তর্গত এবং এগুলো প্রধানত ক্লিফটনের K-12 স্ট্রেন (λ+ F+; O16) থেকে এবং কিছুটা হলেও দেরেল-এর "ব্যাসিলাস কোলাই" স্ট্রেন (B স্ট্রেন; O7) থেকে উদ্ভূত।
ফাইলোজেনির সাথে সঙ্গতি রেখে শ্রেণীবিন্যাস সংশোধনের জন্য একাধিক প্রস্তাব করা হয়েছে।[১২] তবে, এই সকল প্রস্তাবকেই এই সত্যের মুখোমুখি হতে হবে যে শিগেলা নামটি এখনও চিকিৎসাবিদ্যায় বহুল ব্যবহৃত এবং নাম পরিবর্তন থেকে উদ্ভূত কোনো বিভ্রান্তি কমানোর উপায় খুঁজতে হবে।[১৫]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
তথ্যসূত্র
[সম্পাদনা]- ↑ "coli"। অক্সফোর্ড ইংলিশ ডিকশনারি (অনলাইন সংস্করণ)। অক্সফোর্ড ইউনিভার্সিটি প্রেস। (Sসাবস্ক্রিপশন বা পার্টিশিপেটিং ইনস্টিটিউট মেম্বারশিপ প্রয়োজনীয়.)(Subscription or UK public library membership ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ৪ ফেব্রুয়ারি ২০১৬ তারিখে required.)
- ↑ Singleton P (১৯৯৯)। Bacteria in Biology, Biotechnology and Medicine (5th সংস্করণ)। Wiley। পৃ. ৪৪৪–৪৫৪। আইএসবিএন ০-৪৭১-৯৮৮৮০-৪।
- ↑ "Escherichia coli"। CDC National Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases। সংগ্রহের তারিখ ২ অক্টোবর ২০১২।
- ↑ Bentley R, Meganathan R (সেপ্টেম্বর ১৯৮২)। "Biosynthesis of vitamin K (menaquinone) in bacteria"। Microbiological Reviews। ৪৬ (3): ২৪১–৮০। পিএমসি 281544। পিএমআইডি 6127606।
- ↑ "E.Coli"। Redorbit। সংগ্রহের তারিখ ২৭ নভেম্বর ২০১৩।
- ↑ "Facts about E. coli: dimensions, as discussed in bacteria: Diversity of structure of bacteria: – Britannica Online Encyclopedia"। Britannica.com। সংগ্রহের তারিখ ২৫ জুন ২০১৫।
- ↑ Brock Biology of microorganisms (11th সংস্করণ)। Pearson। ২০০৬। আইএসবিএন ০-১৩-১৯৬৮৯৩-৯।
- 1 2 Tortora, Gerard (২০১০)। Microbiology: An Introduction। San Francisco, CA: Benjamin Cummings। পৃ. ৮৫–৮৭, ১৬১, ১৬৫, । আইএসবিএন ০-৩২১-৫৫০০৭-২।
{{বই উদ্ধৃতি}}: উদ্ধৃতি শৈলী রক্ষণাবেক্ষণ: অতিরিক্ত বিরামচিহ্ন (লিঙ্ক) - ↑ Brüssow H, Canchaya C, Hardt WD (সেপ্টেম্বর ২০০৪)। "Phages and the evolution of bacterial pathogens: from genomic rearrangements to lysogenic conversion"। Microbiology and Molecular Biology Reviews : MMBR। ৬৮ (3): ৫৬০–৬০২। ডিওআই:10.1128/MMBR.68.3.560-602.2004। পিএমসি 515249। পিএমআইডি 15353570।
- ↑ Sims GE, Kim SH (মে ২০১১)। "Whole-genome phylogeny of Escherichia coli/Shigella group by feature frequency profiles (FFPs)"। Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America। ১০৮ (20): ৮৩২৯–৩৪। বিবকোড:2011PNAS..108.8329S। ডিওআই:10.1073/pnas.1105168108। পিএমসি 3100984। পিএমআইডি 21536867।
- ↑ Brzuszkiewicz E, Thürmer A, Schuldes J, Leimbach A, Liesegang H, Meyer FD, এবং অন্যান্য (ডিসেম্বর ২০১১)। "Genome sequence analyses of two isolates from the recent Escherichia coli outbreak in Germany reveal the emergence of a new pathotype: Entero-Aggregative-Haemorrhagic Escherichia coli (EAHEC)"। Archives of Microbiology। ১৯৩ (12): ৮৮৩–৯১। বিবকোড:2011ArMic.193..883B। ডিওআই:10.1007/s00203-011-0725-6। পিএমসি 3219860। পিএমআইডি 21713444।
- 1 2 3 4 উদ্ধৃতি ত্রুটি:
<ref>ট্যাগ বৈধ নয়;Meier-Kolthoff14নামের সূত্রটির জন্য কোন লেখা প্রদান করা হয়নি - ↑ Koh XP, Shen Z, Woo CF, Yu Y, Lun HI, Cheung SW, এবং অন্যান্য (২০২২)। "Genetic and Ecological Diversity of Escherichia coli and Cryptic Escherichia Clades in Subtropical Aquatic Environments"। Frontiers in Microbiology। ১৩ 811755। ডিওআই:10.3389/fmicb.2022.811755। পিএমসি 8891540। পিএমআইডি 35250929।
- ↑ Abram K, Udaondo Z, Bleker C, Wanchai V, Wassenaar TM, Robeson MS, Ussery DW (জানুয়ারি ২০২১)। "Mash-based analyses of Escherichia coli genomes reveal 14 distinct phylogroups"। Communications Biology। ৪ (1) 117। ডিওআই:10.1038/s42003-020-01626-5। পিএমসি 7838162। পিএমআইডি 33500552।
- ↑ Cobo-Simón M, Hart R, Ochman H (জানুয়ারি ২০২৩)। "Escherichia Coli: What Is and Which Are?"। Molecular Biology and Evolution। ৪০ (1) msac273। ডিওআই:10.1093/molbev/msac273। পিএমসি 9830988। পিএমআইডি 36585846।
আরোও পড়ুন
[সম্পাদনা]- Jann K, Jann B (Jul 1992). "Capsules of Escherichia coli, expression and biological significance". Canadian Journal of Microbiology. 38 (7): 705–710. doi:10.1139/m92-116. PMID 1393836.
বহিঃসংযোগ
[সম্পাদনা]- E. coli: Protecting yourself and your family from a sometimes deadly bacterium
- E. coli statistics ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ১৭ জুলাই ২০০৬ তারিখে
- Spinach and E. coli Outbreak – U.S. FDA
- E. coli Outbreak From Fresh Spinach – U.S. CDC
- Current research on Escherichia coli at the Norwich Research Park
- E. coli gas production from glucose video demonstration ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ২৪ নভেম্বর ২০১২ তারিখে
- E. coli Infection | Causes & Risk Factors[স্থায়ীভাবে অকার্যকর সংযোগ]
ডাটাবেইস
[সম্পাদনা]- Bacteriome ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ২৬ নভেম্বর ২০১০ তারিখে E. coli interaction database
- coliBASE (subset of the comparative genomics database xBASE)
- EcoGene[স্থায়ীভাবে অকার্যকর সংযোগ] (genome database and website dedicated to Escherichia coli K-12 substrain MG1655)
- EcoSal Continually updated Web resource based on the classic ASM Press publication Escherichia coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology
- ECODAB The structure of the O-antigens that form the basis of the serological classification of E. coli
- Coli Genetic Stock Center ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ১১ মার্চ ২০১০ তারিখে Strains and genetic information on E. coli K-12
- EcoCyc – literature-based curation of the entire genome, and of transcriptional regulation, transporters, and metabolic pathways
- PortEco (formerly EcoliHub) – NIH-funded comprehensive data resource for E. coli K-12 and its phage, plasmids, and mobile genetic elements
- EcoliWiki ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ২৮ আগস্ট ২০০৮ তারিখে is the community annotation component of PortEco
- RegulonDB ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ১৯ নভেম্বর ২০১৭ তারিখে RegulonDB is a model of the complex regulation of transcription initiation or regulatory network of the cell E. coli K-12.
- Uropathogenic Escherichia coli (UPEC)