প্লাসমিড: সংশোধিত সংস্করণের মধ্যে পার্থক্য

উইকিপিডিয়া, মুক্ত বিশ্বকোষ থেকে
বিষয়বস্তু বিয়োগ হয়েছে বিষয়বস্তু যোগ হয়েছে
ট্যাগ: মোবাইল সম্পাদনা মোবাইল ওয়েব সম্পাদনা
লিঙ্কের ঠিকানা
ট্যাগ: মোবাইল সম্পাদনা মোবাইল ওয়েব সম্পাদনা
৪ নং লাইন: ৪ নং লাইন:
প্লাসমিড হচ্ছে ছোট [[ডিএনএ]] অণু, যা একটি কোষে থাকে কিন্তু [https://en.m.wikipedia.org/wiki/GDNA| ক্রোমোজমাল ডিএনএ]থেকে আলাদা থাকে। এটি নিজে নিজেকে প্রতিলিপন করতে পারে। এগুলোকে সাধারণত পাওয়া যায় [[ব্যাকটেরিয়া]]তে। ছোট বৃত্তাকার,দুইটা ছাচ বিশিষ্ট ডিএনএ অণুরূপে। কখনো কখনো একে [[archaea]] এবং [[eukaryote|ইউক্যারিওটিক জীবেও]] পাওয়া যায়। সাধারণত প্লাসমিড যেসব জীন ধারণ করে সেগুলো জীবকে টিকে থাকতে সহায়তা করে। যখন ক্রোমোজোম বড় হয় তখন সে যে সকল প্রয়োজনীয় জীন ধারণ করে তার মাধ্যমে জীব সাধারণ পরিস্থিতিতে বেচে থাকে। কিন্তু প্লাসমিড ছোট হলেও যেসব অতিরিক্ত জীন ধারণ করে সেগুলো জীবকে প্রতিকূল পরিস্থিতি মোকাবেলা করতে সহায়তা করে। প্লাসমিড [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Vector_(molecular_biology)| vector] হিসেবে [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Molecular_cloning| molecular cloning] এ ব্যবহার করা হয।
প্লাসমিড হচ্ছে ছোট [[ডিএনএ]] অণু, যা একটি কোষে থাকে কিন্তু [https://en.m.wikipedia.org/wiki/GDNA| ক্রোমোজমাল ডিএনএ]থেকে আলাদা থাকে। এটি নিজে নিজেকে প্রতিলিপন করতে পারে। এগুলোকে সাধারণত পাওয়া যায় [[ব্যাকটেরিয়া]]তে। ছোট বৃত্তাকার,দুইটা ছাচ বিশিষ্ট ডিএনএ অণুরূপে। কখনো কখনো একে [[archaea]] এবং [[eukaryote|ইউক্যারিওটিক জীবেও]] পাওয়া যায়। সাধারণত প্লাসমিড যেসব জীন ধারণ করে সেগুলো জীবকে টিকে থাকতে সহায়তা করে। যখন ক্রোমোজোম বড় হয় তখন সে যে সকল প্রয়োজনীয় জীন ধারণ করে তার মাধ্যমে জীব সাধারণ পরিস্থিতিতে বেচে থাকে। কিন্তু প্লাসমিড ছোট হলেও যেসব অতিরিক্ত জীন ধারণ করে সেগুলো জীবকে প্রতিকূল পরিস্থিতি মোকাবেলা করতে সহায়তা করে। প্লাসমিড [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Vector_(molecular_biology)| vector] হিসেবে [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Molecular_cloning| molecular cloning] এ ব্যবহার করা হয।


প্লাসমিডকে [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Replicon_(genetics) replicon]s হিসেবে বিবেচনা করা হয়। ডিএনএ-এর ইউনিট,যার মাধ্যমে ডিএনএ বাহকের অভ্যন্তরে স্বয়ংক্রিয়ভাবে নিজের প্রতিলিপি গঠন করতে সক্ষম হয়। যাইহোক, প্লাসমিডকে ভাইরাসের মতই জীব হিসেবে গণ্য করা হয় না।<ref>{{cite journal|last=Sinkovics|first=J|author2=Harvath J |author3=Horak A. |year=1998|title=The Origin and evolution of viruses (a review)|journal=Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica |volume=45 | issue = 3–4|pages=349–90 |pmid=9873943}}</ref> প্লাসমিডকে এক ব্যাকটেরিয়াম থেকে আরেক ব্যাকটেরিয়ামে প্রতিস্থাপন করা যায়(এমনকি অন্য প্রজাতিতেও) এই প্রতিস্থাপন করা যায় তিনটি গঠন প্রকৃয়ার উপর নির্ভর করে। সেগুলো হল: [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Transformation_(genetics) transformation], [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Transduction_(genetics) Transduction] এবং [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Bacterial_conjugation conjugation]।এই যে বাহক থেকে বাহকে জেনেটিক উপাদানের এই প্রতিস্থাপন, একে বলা হয় [[horizontal gene transfer]], এবং প্লাসমিডকে [[mobilome]] এর অংশ হিসেবে বিবেচনা করা হয়।ভাইরাস(যারা তাদের জেনেটিক উপাদানসমূহকে রক্ষাদায়ী প্রোটিন; (যাকে [[capsid]] বলা হয়) দিয়ে আবদ্ধ করে রাখে)। কিন্তু প্লাসমিডের ডিএনএ অনাবৃতই থাকে।কিছু কিছু শ্রেণির প্লাসমিড [[pilus#Conjugative pili|conjugative "sex" pilus]] কে এনকোড করে, যা তার প্রয়োজন। প্লাসমিডের আকার ১ থেকে ২০০ k [[base pair|bp]](বেস পেয়ার) এর বেশি হতে পারে। <ref name="ThomasSummers2008">{{cite journal|last1=Thomas|first1=Christopher M|last2=Summers|first2=David|title=Bacterial Plasmids|year=2008|doi=10.1002/9780470015902.a0000468.pub2|journal=Encyclopedia of Life Sciences|isbn=0470016175}}</ref><!--অনুবাদ??? and the number of identical plasmids in a single [[cell (biology)|cell]] can range anywhere from one to thousands under some circumstances.
প্লাসমিডকে [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Replicon_(genetics) replicon]s হিসেবে বিবেচনা করা হয়। ডিএনএ-এর ইউনিট,যার মাধ্যমে ডিএনএ বাহকের অভ্যন্তরে স্বয়ংক্রিয়ভাবে নিজের প্রতিলিপি গঠন করতে সক্ষম হয়। যাইহোক, প্লাসমিডকে ভাইরাসের মতই জীব হিসেবে গণ্য করা হয় না।<ref>{{cite journal|last=Sinkovics|first=J|author2=Harvath J |author3=Horak A. |year=1998|title=The Origin and evolution of viruses (a review)|journal=Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica |volume=45 | issue = 3–4|pages=349–90 |pmid=9873943}}</ref> প্লাসমিডকে এক ব্যাকটেরিয়াম থেকে আরেক ব্যাকটেরিয়ামে প্রতিস্থাপন করা যায়(এমনকি অন্য প্রজাতিতেও) এই প্রতিস্থাপন করা যায় তিনটি গঠন প্রকৃয়ার উপর নির্ভর করে। সেগুলো হল: [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Transformation_(genetics) transformation], [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Transduction_(genetics) Transduction] এবং [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Bacterial_conjugation conjugation]।এই যে বাহক থেকে বাহকে জেনেটিক উপাদানের এই প্রতিস্থাপন, একে বলা হয় [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Horizontal_gene_transfer horizontal gene transfer] এবং প্লাসমিডকে [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Mobilome mobilome] এর অংশ হিসেবে বিবেচনা করা হয়।ভাইরাস(যারা তাদের জেনেটিক উপাদানসমূহকে রক্ষাদায়ী প্রোটিন; (যাকে [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Capsid capsid] বলা হয়) দিয়ে আবদ্ধ করে রাখে)। কিন্তু প্লাসমিডের ডিএনএ অনাবৃতই থাকে।কিছু কিছু শ্রেণির প্লাসমিড [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Pilus#Conjugative_pili conjugative sex] কে এনকোড করে, যা তার প্রয়োজন। প্লাসমিডের আকার ১ থেকে 200k [https://en.m.wikipedia.org/wiki/Base_pair bp](বেস পেয়ার) এর বেশি হতে পারে। <ref name="ThomasSummers2008">{{cite journal|last1=Thomas|first1=Christopher M|last2=Summers|first2=David|title=Bacterial Plasmids|year=2008|doi=10.1002/9780470015902.a0000468.pub2|journal=Encyclopedia of Life Sciences|isbn=0470016175}}</ref><!--অনুবাদ??? and the number of identical plasmids in a single [[cell (biology)|cell]] can range anywhere from one to thousands under some circumstances.


The relationship between microbes and plasmid DNA is neither parasitic nor mutualistic, because each implies the presence of an independent species living in a detrimental or commensal state with the host organism. Rather, plasmids provide a mechanism for horizontal gene transfer within a population of microbes and typically provide a selective advantage under a given environmental state. Plasmids may carry genes that provide [[antibiotic resistance|resistance]] to naturally occurring [[antibiotics]] in a competitive [[environmental niche]], or the proteins produced may act as [[toxin]]s under similar circumstances, or allow the organism to utilize particular organic compounds that would be advantageous when nutrients are scarce.<ref name="Schumann2008">{{cite book | title = Plasmids: Current Research and Future Trends | editors=Georg Lipps | publisher=Caister Academic Press | year = 2008 | author=Wolfgang Schumann |chapter=Chapter 1 - ''Escherichia coli'' Cloning and Expression Vectors | pages=1–2 | isbn = 978-1-904455-35-6 }}</ref>-->
The relationship between microbes and plasmid DNA is neither parasitic nor mutualistic, because each implies the presence of an independent species living in a detrimental or commensal state with the host organism. Rather, plasmids provide a mechanism for horizontal gene transfer within a population of microbes and typically provide a selective advantage under a given environmental state. Plasmids may carry genes that provide [[antibiotic resistance|resistance]] to naturally occurring [[antibiotics]] in a competitive [[environmental niche]], or the proteins produced may act as [[toxin]]s under similar circumstances, or allow the organism to utilize particular organic compounds that would be advantageous when nutrients are scarce.<ref name="Schumann2008">{{cite book | title = Plasmids: Current Research and Future Trends | editors=Georg Lipps | publisher=Caister Academic Press | year = 2008 | author=Wolfgang Schumann |chapter=Chapter 1 - ''Escherichia coli'' Cloning and Expression Vectors | pages=1–2 | isbn = 978-1-904455-35-6 }}</ref>-->

১৬:০৪, ২৭ সেপ্টেম্বর ২০১৬ তারিখে সংশোধিত সংস্করণ

ব্যাক্টেরিয়াদেহে প্লাসমিড ও ক্রোমোসোমাল ডিএনএ

প্লাসমিড হচ্ছে ছোট ডিএনএ অণু, যা একটি কোষে থাকে কিন্তু ক্রোমোজমাল ডিএনএথেকে আলাদা থাকে। এটি নিজে নিজেকে প্রতিলিপন করতে পারে। এগুলোকে সাধারণত পাওয়া যায় ব্যাকটেরিয়াতে। ছোট বৃত্তাকার,দুইটা ছাচ বিশিষ্ট ডিএনএ অণুরূপে। কখনো কখনো একে archaea এবং ইউক্যারিওটিক জীবেও পাওয়া যায়। সাধারণত প্লাসমিড যেসব জীন ধারণ করে সেগুলো জীবকে টিকে থাকতে সহায়তা করে। যখন ক্রোমোজোম বড় হয় তখন সে যে সকল প্রয়োজনীয় জীন ধারণ করে তার মাধ্যমে জীব সাধারণ পরিস্থিতিতে বেচে থাকে। কিন্তু প্লাসমিড ছোট হলেও যেসব অতিরিক্ত জীন ধারণ করে সেগুলো জীবকে প্রতিকূল পরিস্থিতি মোকাবেলা করতে সহায়তা করে। প্লাসমিড vector হিসেবে molecular cloning এ ব্যবহার করা হয।

প্লাসমিডকে replicons হিসেবে বিবেচনা করা হয়। ডিএনএ-এর ইউনিট,যার মাধ্যমে ডিএনএ বাহকের অভ্যন্তরে স্বয়ংক্রিয়ভাবে নিজের প্রতিলিপি গঠন করতে সক্ষম হয়। যাইহোক, প্লাসমিডকে ভাইরাসের মতই জীব হিসেবে গণ্য করা হয় না।[১] প্লাসমিডকে এক ব্যাকটেরিয়াম থেকে আরেক ব্যাকটেরিয়ামে প্রতিস্থাপন করা যায়(এমনকি অন্য প্রজাতিতেও) এই প্রতিস্থাপন করা যায় তিনটি গঠন প্রকৃয়ার উপর নির্ভর করে। সেগুলো হল: transformation, Transduction এবং conjugation।এই যে বাহক থেকে বাহকে জেনেটিক উপাদানের এই প্রতিস্থাপন, একে বলা হয় horizontal gene transfer এবং প্লাসমিডকে mobilome এর অংশ হিসেবে বিবেচনা করা হয়।ভাইরাস(যারা তাদের জেনেটিক উপাদানসমূহকে রক্ষাদায়ী প্রোটিন; (যাকে capsid বলা হয়) দিয়ে আবদ্ধ করে রাখে)। কিন্তু প্লাসমিডের ডিএনএ অনাবৃতই থাকে।কিছু কিছু শ্রেণির প্লাসমিড conjugative sex কে এনকোড করে, যা তার প্রয়োজন। প্লাসমিডের আকার ১ থেকে 200k bp(বেস পেয়ার) এর বেশি হতে পারে। [২]

Properties and characteristics

There are two types of plasmid integration into a host bacteria: Non-integrating plasmids replicate as with the top instance, whereas episomes, the lower example, can integrate into the host chromosome.

যুক্তরাষ্ট্রের আণবিক জীববিজ্ঞানী জোসুয়া লেডারবার্গ ১৯৫২ সালে প্রথম প্লাসমিড শনাক্ত করেন।[৩] ১৯৬৮ সালে এই সিদ্ধান্ত নেওয়া হল যে প্লাসমিডকে অতিরিক্ত জেনেটিক উপাদান হিসেবে আলাদা বাহকে সংযুক্ত করা যায়। [৪] এবং এটাই তাকে ভাইরাস থেকে পৃথক করেছে এবং এর সংজ্ঞায় পরিবর্তন আসল, বুঝা গেল প্লাসমিড ক্রোমোজোমের বাইরেও টিকে থাকতে পারে ও স্বয়ংক্রিয়ভাবে নিজের প্রতিলিপি গঠন করতে পারে।[৫]

কোষের অভ্যন্তরে স্বাধীনভাবে প্লাসমিড নিজের প্রতিলিপন করতে চাইলে তাকে অবশ্যই ডিএনএ এর ছাচ তৈরী করতে হবে,যা সূচনা বিন্দু(origin of species হিসেবে কাজ করবে। যেহেতু এটি নিজে নিজে প্রতিলিপি গঠন করতে পারে তাই এই এই দৃষ্টিকোণ থেকে প্লাসমিডকে replicon বলা হয়।[৬] ক্ষুদ্রাকৃতির প্লাসমিড তাদের বাহকের প্রতিলিপন উৎসেচক ব্যবহার করে নিজেদের প্রতিলিপি করে থাকে। কিন্তু বড় প্লাসমিডগুলো নিজেদের প্রতিলিপির জন্য সুনির্দিষ্ট জীন ধারণ করতে পারে। কিছু কিছু প্লাসমিড নিজেদেরকে বাহক ক্রোমোজোমে অভ্যন্তরে সংযুক্ত করতে পারে। এই ধরনের বিশেষ প্লাসমিডকে বলা হয় এপিজোম[৭]

যতই ক্ষুদ্র হোক নানা কেন প্লাসমিড অন্ততপক্ষে একটা হলেও জিন বহন করে। প্লাসমিড যে সকল জীন বহন করে তার অধিকাংশই বাহক কোষের জন্য উপকারী। উদাহরণ স্বরুপ: প্রতিকূল পরিস্থিতিতে বাহক কোষকে টিকে থাকার জন্য প্লাসমিড সহায়তা করে। কিছু জীন অ্যান্টিবায়োটিকের বিরুদ্ধে প্রতিরোধ গড়ে তুলতে সাহায্য করে। আবার কিছু জীন ভারী পদার্থ যেগুলো প্রতিরোধ করে while others may produce virulence factor that enable a bacterium to colonize a host and overcome its defences, or have specific metabolic functions that allow the bacterium to utilize a particular nutrient, including the ability to degrade recalcitrant or toxic organic compounds.[৫] প্লাসমিড সক্ষম ব্যাকটেরিয়া দিয়ে nitrogefix nitrogen(নাইট্রোজেন সংবন্ধন) করাতে। কিছু কিছু প্লাসমিডের কোষে কোনো প্রভাব দেখা যায় না।অথবা বাহকে তাদের উপকার কী সেটা এখনো নির্ণয় করা যায় নি। এইধরনের প্লাসমিডকে বলা হয় ক্রিপটিক প্লাসমিড (cryptic plasmids) [৮]

তথ্যসূত্র

  1. Sinkovics, J; Harvath J; Horak A. (১৯৯৮)। "The Origin and evolution of viruses (a review)"। Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica45 (3–4): 349–90। পিএমআইডি 9873943 
  2. Thomas, Christopher M; Summers, David (২০০৮)। "Bacterial Plasmids"। Encyclopedia of Life Sciencesআইএসবিএন 0470016175ডিওআই:10.1002/9780470015902.a0000468.pub2 
  3. Lederberg J (১৯৫২)। "Cell genetics and hereditary symbiosis"। Physiol. Rev.32 (4): 403–430। পিএমআইডি 13003535 
  4. Stanley Falkow। "Microbial Genomics: Standing on the Shoulders of Giants"Microbiology Society 
  5. উদ্ধৃতি ত্রুটি: <ref> ট্যাগ বৈধ নয়; finbarr নামের সূত্রটির জন্য কোন লেখা প্রদান করা হয়নি
  6. Finbarr Hayes (২০০৩)। "Chapter 1 - The Function and Organization of Plasmids"। Nicola Casali, Andrew Preston। E. Coli Plasmid Vectors: Methods and Applications। Methods in Molecular Biology, Vol. 235। Humana Press। পৃষ্ঠা 5–6। আইএসবিএন 978-1-58829-151-6 
  7. T. A. Brown (২০১০)। "Chapter 2 - Vectors for Gene Cloning: Plasmids and Bacteriophages"। Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction (6th সংস্করণ)। Wiley-Blackwell। আইএসবিএন 978-1405181730 
  8. David Summers (১৯৯৬)। "Chapter 1 - The Function and Organization of Plasmids"। The Biology of Plasmids। Wiley-Blackwell; First Edition। পৃষ্ঠা 21–22। আইএসবিএন 978-0632034369