পিবিআর ৩২২
পিবিআর ৩২২ একটি প্ল্যাসমিড এবং এটি সর্বপ্রথম ব্যবহৃত ই. কোলি ক্লোনিং ভেক্টরগুলির মধ্যে একটি । ক্যালিফোর্নিয়া বিশ্ববিদ্যালয়, সান ফ্রান্সিসকোতে হারবার্ট বয়ার পরীক্ষাগারে ১৯৭৭ সালে নির্মিত, এটি পোস্টডক্টোরাল গবেষক ফ্রান্সিসকো বলিভার জাপাটার এবং রেমন্ড এল. রদ্রিগেজের নামে নামকরণ করা হয়েছে। ''পি'-টির অর্থ দাঁড়ায় "প্ল্যাসমিড," এবং 'বিআর' এর অর্থ যথাক্রমে "বলিভার" এবং "রদ্রিগেজ"।
পিবিআর ৩২২ এর দৈর্ঘ্য ৪৩৬১ বেস জোড়া [১] এবং দুই এন্টিবায়োটিক প্রতিরোধের জিন আছে - জিন বিলএ এনকোডিং এম্পিসিলিন প্রতিরোধের (অ্যাম্প আর) প্রোটিন, এবং জিন টেট আর এনকোডিং টেট্রাসাইক্লিন সহ্য করার ক্ষমতা (টেট আর) প্রোটিন। এটিতে পিএমবি ১-র প্রতিরূপের উৎস এবং রোপ জিন রয়েছে যা প্লাজমিড অনুলিপি সংখ্যার একটি প্রতিরোধককে এনকোড করে। চল্লিশেরও বেশি বিধিনিষেধের এনজাইমগুলির জন্য প্লাজমিডে অনন্য বিধিনিষেধের সাইট রয়েছে । এই চল্লিশটি সাইটের মধ্যে এগারটি টেট আর জিনের মধ্যে রয়েছে। টেট আর জিনের প্রবর্তকের মধ্যে সীমাবদ্ধ এনজাইমগুলি হিন্দ-III এবং ক্লে-I জন্য দুটি সাইট রয়েছে। অ্যাম্প আর জিনের অভ্যন্তরে ছয়টি মূল নিষেধাজ্ঞার সাইট রয়েছে । [২]
বৃত্তাকার ক্রমটি এমনভাবে সংখ্যায়িত করা হয়েছে যে 0 টি অনন্য ইকোআরআই সাইটের মাঝখানে এবং টেট আর জিনের মাধ্যমে গণনা বৃদ্ধি পায়। আম্প আর জিনটি পেনিসিলিন বিটা-ল্যাকটামেস । প্রোমোটার পি১ এবং P3 বিটা-ল্যাকটামেজ জিনের জন্য। P3 প্রাকৃতিক প্রোমোটার এবং পিবিআর ৩২২ তৈরি করতে দুটি ভিন্ন ডিএনএ টুকরার লাইগেশন দ্বারা P1 কৃত্রিমভাবে তৈরি করা হয় । পি 2 P1 এর মত একই অঞ্চলে রয়েছে , তবে এটি বিপরীত স্ট্র্যান্ডে রয়েছে এবং টেট্রাসাইক্লিন প্রতিরোধ জিনের দিকে প্রতিলিপি শুরু করে। [৩]
পটভূমি[সম্পাদনা]
প্রাথমিক ক্লোনিং পরীক্ষাগুলি প্রাকৃতিক প্লাজমিড যেমন ColE1 এবং pSC101 ব্যবহার করে পরিচালিত হতে পারে। এই প্লাজমিডগুলির প্রতিটিটির এর সুবিধা এবং অসুবিধা থাকতে পারে। উদাহরণস্বরূপ, ColE1 প্লাসমিড এবং তার ডেরাইভেটিভসদের উচ্চতর কপি সংখ্যা সুবিধা আছে এবংপ্লাসমিড উচ্চ ফলন উৎপাদন করতে জন্য chloramphenicol প্লাসমিড অনুমতি এর বিকাস, তবে ইমিউনিটি প্রদর্শণের জন্য colicin ই 1 প্রযুক্তিগতভাবে সহজ নয়। [৪] প্লাজমিড পিএসসি ১০১, সালমোনেলা পানামার প্রাকৃতিক প্লাজমিড,[৫] টেট্রাসাইক্লিন প্রতিরোধকে সম্মানিত করে যা অ্যান্টিবায়োটিক নির্বাচনের মাধ্যমে সহজ স্ক্রিনিংয়ের প্রক্রিয়াটিকে অনুমতি দেয় তবে এটি একটি কম কপি নম্বর প্লাজমিড যা প্লাজমিডের উচ্চ ফলন দেয় না। আর একটি প্লাজমিড, আরএসএফ ২১২৪, যা কোলই ১ এর একটি ডেরাইভেটিভ, এম্পিসিলিন প্রতিরোধের প্রস্তাব দেয় তবে এটি আরও বড়।
ক্লোনিংয়ের উদ্দেশ্যে আদর্শ হতে পারে এমন একটি তৈরি করার জন্য অন্যান্য অনেক প্লাজমিডগুলি কৃত্রিমভাবে তৈরি করা হয়েছিল এবং পিবিআর ৩২২ অনেকের কাছে সর্বাধিক বহুমুখী ছিল এবং তাই এটি সবচেয়ে জনপ্রিয়ভাবে ব্যবহৃত হয়েছিল। [৪] এটিতে দুটি অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধের জিন রয়েছে, বাছাইযোগ্য চিহ্নিতকারী হিসাবে এবং বেশ কয়েকটি সুবিধাজনক অনন্য বাধা সাইট রয়েছে যা এটিকে ক্লোনিং ভেক্টর হিসাবে উপযুক্ত করেছে। প্লাসমিডটি জিনগত উপাদানের ৩টি প্রধান উৎস থেকে নির্মাণ করা হয়েছিল pSC101এর টেট্রাসাইক্লিন প্রতিরোধের জিন, আরএসএফ ২১২৪ এর এম্পিসিলিন প্রতিরোধের জিনের , এবং রেপ্লিকেশন উপাদান pMB1, ColE1 প্লাসমিড এর একটি ঘনিষ্ঠ আত্মীয়। [৬][৭]
পিবিআর ৩২২ এর উপর ভিত্তি করে প্রচুর পরিমাণে অন্যান্য প্লাজমিডগুলি তখন থেকে বিভিন্ন উদ্দেশ্যে নির্মিত হয়েছে। [৮] উদাহরণস্বরূপ প্লাজমিডগুলির পিইউসি সিরিজ অন্তর্ভুক্ত। [৯] এক্সট্রা ক্রোমোসোমাল প্রোটিন এক্সপ্রেশন এবং শাটল ভেক্টরগুলির জন্য বেশিরভাগ এক্সপ্রেশন ভেক্টরগুলি পিবিআর৩২২ মূলটির প্রতিরূপ ধারণ করে এবং ক্রোমোজোম থেকে ডিএনএ-এর টার্গেট ইন্টিগ্রেশন এবং এক্সাইজেশন জন্য ইন্ট্রাস্পেসি শাটল বা বাইনারি ভেক্টর এবং ভেক্টর নির্মাণে পিবিআর ৩২২ এর টুকরোগুলো খুব জনপ্রিয়। [১০]
ডিএনএ ক্রম[সম্পাদনা]
পিবিআর ৩২২ এর ক্রমটি হলো [৩]
| pBR322
1 ttctcatgtt tgacagctta tcatcgataa gctttaatgc ggtagtttat cacagttaappa 61 ttgctaacgc agtcaggcac cgtgtatgaa atctaacaat gcgctcatcg tcatcctcgg
121 caccgtcacc ctggatgctg taggcatagg cttggttatg ccggtactgc cgggcctctt
181 gcgggatatc gtccattccg acagcatcgc cagtcactat ggcgtgctgc tagcgctata
241 tgcgttgatg caatttctat gcgcacccgt tctcggagca ctgtccgacc gctttggccg
301 ccgcccagtc ctgctcgctt cgctacttgg agccactatc gactacgcga tcatggcgac
361 cacacccgtc ctgtggatcc tctacgccgg acgcatcgtg gccggcatca ccggcgccac
421 aggtgcggtt gctggcgcct atatcgccga catcaccgat ggggaagatc gggctcgcca
481 cttcgggctc atgagcgctt gtttcggcgt gggtatggtg gcaggccccg tggccggggg
541 actgttgggc gccatctcct tgcatgcacc attccttgcg gcggcggtgc tcaacggcct
601 caacctacta ctgggctgct tcctaatgca ggagtcgcat aagggagagc gtcgaccgat
661 gcccttgaga gccttcaacc cagtcagctc cttccggtgg gcgcggggca tgactatcgt
721 cgccgcactt atgactgtct tctttatcat gcaactcgta ggacaggtgc cggcagcgct
781 ctgggtcatt ttcggcgagg accgctttcg ctggagcgcg acgatgatcg gcctgtcgct
841 tgcggtattc ggaatcttgc acgccctcgc tcaagccttc gtcactggtc ccgccaccaa
901 acgtttcggc gagaagcagg ccattatcgc cggcatggcg gccgacgcgc tgggctacgt
961 cttgctggcg ttcgcgacgc gaggctggat ggccttcccc attatgattc ttctcgcttc
1021 cggcggcatc gggatgcccg cgttgcaggc catgctgtcc aggcaggtag atgacgacca
1081 tcagggacag cttcaaggat cgctcgcggc tcttaccagc ctaacttcga tcactggacc
1141 gctgatcgtc acggcgattt atgccgcctc ggcgagcaca tggaacgggt tggcatggat
1201 tgtaggcgcc gccctatacc ttgtctgcct ccccgcgttg cgtcgcggtg catggagccg
1261 ggccacctcg acctgaatgg aagccggcgg cacctcgcta acggattcac cactccaaga
1321 attggagcca atcaattctt gcggagaact gtgaatgcgc aaaccaaccc ttggcagaac
1381 atatccatcg cgtccgccat ctccagcagc cgcacgcggc gcatctcggg cagcgttggg
1441 tcctggccac gggtgcgcat gatcgtgctc ctgtcgttga ggacccggct aggctggcgg
1501 ggttgcctta ctggttagca gaatgaatca ccgatacgcg agcgaacgtg aagcgactgc
1561 tgctgcaaaa cgtctgcgac ctgagcaaca acatgaatgg tcttcggttt ccgtgtttcg
1621 taaagtctgg aaacgcggaa gtcagcgccc tgcaccatta tgttccggat ctgcatcgca
1681 ggatgctgct ggctaccctg tggaacacct acatctgtat taacgaagcg ctggcattga
1741 ccctgagtga tttttctctg gtcccgccgc atccataccg ccagttgttt accctcacaa
1801 cgttccagta accgggcatg ttcatcatca gtaacccgta tcgtgagcat cctctctcgt
1861 ttcatcggta tcattacccc catgaacaga aatccccctt acacggaggc atcagtgacc
1921 aaacaggaaa aaaccgccct taacatggcc cgctttatca gaagccagac attaacgctt
1981 ctggagaaac tcaacgagct ggacgcggat gaacaggcag acatctgtga atcgcttcac
2041 gaccacgctg atgagcttta ccgcagctgc ctcgcgcgtt tcggtgatga cggtgaaaac
2101 ctctgacaca tgcagctccc ggagacggtc acagcttgtc tgtaagcgga tgccgggagc
2161 agacaagccc gtcagggcgc gtcagcgggt gttggcgggt gtcggggcgc agccatgacc
2221 cagtcacgta gcgatagcgg agtgtatact ggcttaacta tgcggcatca gagcagattg
2281 tactgagagt gcaccatatg cggtgtgaaa taccgcacag atgcgtaagg agaaaatacc
2341 gcatcaggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct gcgctcggtc gttcggctgc
2401 ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa tcaggggata
2461 acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc caggaaccgt aaaaaggccg
2521 cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga gcatcacaaa aatcgacgct
2581 caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata ccaggcgttt ccccctggaa
2641 gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac cggatacctg tccgcctttc
2701 tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg taggtatctc agttcggtgt
2761 aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc cgttcagccc gaccgctgcg
2821 ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag acacgactta tcgccactgg
2881 cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt aggcggtgct acagagttct
2941 tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaaggacagt atttggtatc tgcgctctgc
3001 tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg atccggcaaa caaaccaccg
3061 ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac gcgcagaaaa aaaggatctc
3121 aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca gtggaacgaa aactcacgtt
3181 aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac ctagatcctt ttaaattaaa
3241 aatgaagttt taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac ttggtctgac agttaccaat
3301 gcttaatcag tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt tcgttcatcc atagttgcct
3361 gactccccgt cgtgtagata actacgatac gggagggctt accatctggc cccagtgctg
3421 caatgatacc gcgagaccca cgctcaccgg ctccagattt atcagcaata aaccagccag
3481 ccggaagggc cgagcgcaga agtggtcctg caactttatc cgcctccatc cagtctatta
3541 attgttgccg ggaagctaga gtaagtagtt cgccagttaa tagtttgcgc aacgttgttg
3601 ccattgctgc aggcatcgtg gtgtcacgct cgtcgtttgg tatggcttca ttcagctccg
3661 gttcccaacg atcaaggcga gttacatgat cccccatgtt gtgcaaaaaa gcggttagct
3721 ccttcggtcc tccgatcgtt gtcagaagta agttggccgc agtgttatca ctcatggtta
3781 tggcagcact gcataattct cttactgtca tgccatccgt aagatgcttt tctgtgactg
3841 gtgagtactc aaccaagtca ttctgagaat agtgtatgcg gcgaccgagt tgctcttgcc
3901 cggcgtcaac acgggataat accgcgccac atagcagaac tttaaaagtg ctcatcattg
3961 gaaaacgttc ttcggggcga aaactctcaa ggatcttacc gctgttgaga tccagttcga
4021 tgtaacccac tcgtgcaccc aactgatctt cagcatcttt tactttcacc agcgtttctg
4081 ggtgagcaaa aacaggaagg caaaatgccg caaaaaaggg aataagggcg acacggaaat
4141 gttgaatact catactcttc ctttttcaat attattgaag catttatcag ggttattgtc
4201 tcatgagcgg atacatattt gaatgtattt agaaaaataa acaaataggg gttccgcgca
4261 catttccccg aaaagtgcca cctgacgtct aagaaaccat tattatcatg acattaacct
4321 ataaaaatag gcgtatcacg aggccctttc gtcttcaaga a
|
|---|
আরো দেখুন[সম্পাদনা]
তথ্যসূত্র[সম্পাদনা]
- ↑ Watson, N. (১৯৮৮)। "A new revision of the sequence of plasmid pBR322": 399–403। ডিওআই:10.1016/0378-1119(88)90212-0। পিএমআইডি 3063608।
- ↑ Balbás P, Soberón X, Merino E, Zurita M, Lomeli H, Valle F, Flores N, Bolivar F (১৯৮৬)। "Plasmid vector pBR322 and its special-purpose derivatives--a review": 3–40। ডিওআই:10.1016/0378-1119(86)90307-0। পিএমআইডি 3034735।
- ↑ ক খ "pBR322 Nucleotide Sequences, NCBI Sequence Viewer v2.0"।
- ↑ ক খ R.W. Old; S.B. Primrose। Principles of Gene Manipulation (5th সংস্করণ)। পৃষ্ঠা 53–61।
- ↑ Manen D, Caro L (ফেব্রুয়ারি ১৯৯১)। "The replication of plasmid pSC101": 233–7। ডিওআই:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02103.x। পিএমআইডি 2041467।
- ↑ Bolivar F, Rodriguez RL, Betlach MC, Boyer HW (১৯৭৭)। "Construction and characterization of new cloning vehicles. I. Ampicillin-resistant derivatives of the plasmid pMB9": 75–93। ডিওআই:10.1016/0378-1119(77)90074-9। পিএমআইডি 344136।
- ↑ Bolivar F, Rodriguez RL, Greene PJ, Betlach MC, Heyneker HL, Boyer HW, Crosa JH, Falkow S (১৯৭৭)। "Construction and characterization of new cloning vehicles. II. A multipurpose cloning system": 95–113। ডিওআই:10.1016/0378-1119(77)90000-2। পিএমআইডি 344137।
- ↑ Balbás P, Soberón X, Merino E, Zurita M, Lomeli H, Valle F, Flores N, Bolivar F (১৯৮৬)। "Plasmid vector pBR322 and its special-purpose derivatives--a review.": 3–40। ডিওআই:10.1016/0378-1119(86)90307-0। পিএমআইডি 3034735।
- ↑ Yanisch-Perron C, Vieira J, Messing J (১৯৮৫)। "Improved M13 phage cloning vectors and host strains: nucleotide sequences of the M13mp18 and pUC19 vectors": 103–19। ডিওআই:10.1016/0378-1119(85)90120-9। পিএমআইডি 2985470।
- ↑ Recombinant Gene Expression: Reviews and Protocols (2nd সংস্করণ)। Humana Press Inc.। এপ্রিল ২০০৪। পৃষ্ঠা 77–85। আইএসবিএন 978-1592597741।
বহিঃসংযোগ[সম্পাদনা]
- pBR322 Map
- pBR322 Features
- pBR322 DNA ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ১৭ নভেম্বর ২০১২ তারিখে