ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস
এই নিবন্ধে একাধিক সমস্যা রয়েছে। অনুগ্রহ করে নিবন্ধটির মান উন্নয়ন করুন অথবা আলাপ পাতায় বিষয়গুলো নিয়ে আলোচনা করুন।
|
ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস(ইংরেজি: Diazotrophic nodule Morphogenesis) হল একটি জটিল জৈবপ্রক্রিয়া যার মাধ্যমে ডায়াজোট্রোফিক (নাইট্রোজেন-স্থিরকারী) ব্যাকটেরিয়াগুলোর সাথে উদ্ভিদের রাইজোস্ফিয়ারীয় রাইজোরিমিডিয়েশনের পারস্পরিক ক্রিয়ার ফলে শিকড়ে নডিউল (নডিউল = গ্রন্থি সদৃশ গঠন) গঠিত হয়। এই প্রক্রিয়াটি উদ্ভিদের জন্য পরিবেশ থেকে নাইট্রোজেন সংগ্রহ করার একটি বিকল্প ব্যবস্থা প্রদান করে এবং কৃষিতে জৈব সার বিকল্প হিসেবে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।একটি জৈব প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে কিছু উদ্ভিদের শিকড়ে নাইট্রোজেন-স্থিরকারী ব্যাকটেরিয়ার সাথে সহাবস্থানের মাধ্যমে বিশেষ ধরনের গঠন, যাকে নডিউল বলা হয়, সৃষ্টি হয়। এই প্রক্রিয়ার ফলে উদ্ভিদ বায়ুমণ্ডলীয় নাইট্রোজেনকে গ্রহণযোগ্য অ্যামোনিয়ায় রূপান্তর করে, যা উদ্ভিদের বৃদ্ধির জন্য অপরিহার্য।এ পদ্ধতির অপর নাম হলো নডিউল অর্গানোজেনেসিস (Nodule organogenesis) বলা যায়।এ পদ্ধতির অংশগ্রহণকারী রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ কে ডায়াজোট্রোফ বা সিম্বোয়োন্ট (Diazotroph Or Symbiont) বলা যায়।ডায়াজোট্রোফ জাতীয় রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ গোত্র হলো রাইজোবিয়াসিয়াই (Rhizobiaceae) ও এর অপর নাম হলো (Azotroph) অ্যাজোট্রোফ বা বায়োট্রোফ (Biotroph) বলা হয়।ডায়াজোট্রোফ জাতীয় রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ যে লিগিউমিনাস উদ্ভিদ কে হোস্ট করে তাকে নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদ (Nodulated host plant) বলা হয়।উদ্ভিদের শিকড়ে অবস্থিত বিশেষ নডিউল বা গাঁঠ গঠনের জৈব ও আণবিক প্রক্রিয়া, যার মাধ্যমে ডায়াজোট্রোফিক (নাইট্রোজেন-স্থিতিসূচক) ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের সঙ্গে সহজীবী বা সহাবস্থান স্থাপন করে। এই প্রক্রিয়ার মাধ্যমে গাছগুলো বায়ুমণ্ডলীয় নাইট্রোজেনকে গ্রহণযোগ্য যৌগে রূপান্তর করে, যা উদ্ভিদের বৃদ্ধি ও পুষ্টির জন্য অপরিহার্য।ডায়াজোট্রোফিক ব্যাকটেরিয়া, যেমন Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium প্রভৃতি মাইক্রোবরা উদ্ভিদের শিকড়ে অনুপ্রবেশ করে এবং সিমবায়োটিক সম্পর্ক গঠন করে। এই সম্পর্কের ফলে উদ্ভিদের শিকড়ে বিশেষ ধরণের গাঁঠ (নডিউল) সৃষ্টি হয়। এই নডিউলগুলোতে নাইট্রোজেন ফিক্সেশন প্রক্রিয়া সম্পন্ন হয়, যা উদ্ভিদের জন্য নাইট্রোজেন সরবরাহ করে। নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদের গোত্র নাম হলো Fabaceae,Leguminosae,Caesalpinioideae (সেসালপিনিওইডি),Mimosoideae (মিমোসোইডি),Faboideae / Papilionoideae (ফ্যাবয়েডি বা প্যাপিলিওনয়েডি),রোসিওইডি (Rosoideae),রোসাসিয়াই (Rosaceae),Spiraeoideae,Dryadoideae,Amygdaloideae (বা Maloideae) ও ইত্যাদি।এ পদ্ধতির অপর নাম হলো অ্যাজোট্রোফিক অ্যান্ডোবায়োসিম্বোসিস (Azotrophic Endobiosymbiosis) ও এ পদ্ধতিটিকে এমন একটি পারস্পরিক উপকারী সম্পর্ক (Mutualistic Relationship) বলা হয়।ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস একটি জটিল, বহুস্তরবিশিষ্ট প্রক্রিয়া, যেখানে জিনতত্ত্ব, সেলুলার সংকেত, ও ব্যাকটেরিয়া-উদ্ভিদ পারস্পরিক সম্পর্ক একত্রে কাজ করে উদ্ভিদকে পরিবেশ থেকে নাইট্রোজেন গ্রহণের অক্ষমতা কাটিয়ে তুলতে সাহায্য করে। অন্যান্য গণসমূহ হচ্ছেঃ
| পরিবার: গণ
Betulaceae (বার্চ পরিবার): Alnus — অ্যাল্ডার গাছ Cannabaceae (গাঁজা পরিবার): Trema — ত্রেমা Casuarinaceae (কাসুয়ারিনা পরিবার):
|
...... |
Coriariaceae (কোরিয়ারিয়া পরিবার): Coriaria — কোরিয়ারিয়া Datiscaceae (ডাটিস্কা পরিবার): Datisca — ডাটিস্কা Elaeagnaceae (এলিয়াগনাস পরিবার):
|
...... |
Myricaceae (বে-বেরি পরিবার): |
...... |
Rhamnaceae (র্যামনাসি পরিবার): |
...... |
Rosaceae (গোলাপ পরিবার):
|
| এই নিবন্ধটি অসম্পূর্ণ। আপনি চাইলে এটিকে সম্প্রসারিত করে উইকিপিডিয়াকে সাহায্য করতে পারেন। |
জিনতত্ত্ব ও জৈবপদার্থবিদ্যা
[সম্পাদনা]প্রক্রিয়া
[সম্পাদনা]নডিউল গঠনের প্রক্রিয়াটি প্রধানত নিচের ধাপগুলোতে সংঘটিত হয়:
১. সংকেত বিনিময়(Signal Recognition): উদ্ভিদ তার শিকড়ের নিঃসরণ দ্বারা ব্যাকটেরিয়াকে আকর্ষণ করে। ব্যাকটেরিয়া ‘নোড ফ্যাক্টর’ নামক সংকেত পাঠিয়ে উদ্ভিদকে সাড়া দিতে প্ররোচিত করে।উদ্ভিদের শিকড় ফ্ল্যাভোনয়েড নির্গত করে, যা ব্যাকটেরিয়াকে উদ্দীপিত করে Nod ফ্যাক্টর তৈরি করতে।উদ্ভিদ শিকড় থেকে নির্গত ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ ডায়াজোট্রোফিক ব্যাকটেরিয়াকে আকৃষ্ট করে।রাইজোবিয়াম-লিগুমিনাস সিম্বোসিসের সূচনায় কেমোট্যাক্সিসের মডেল (Chemotactic model) কাজ করে।
(ক) মূল এবং বীজের নির্গমন ছড়িয়ে পড়ে এবং রাসায়নিক পথ তৈরি করে। দ্রবণীয় নির্গমনের (লাল❤️) গ্রেডিয়েন্টগুলি সবচেয়ে দূরে ভ্রমণ করে এবং কেমোঅ্যাট্র্যাক্ট্যান্ট (Chemoattractant) হিসাবে কাজ করে। হাইড্রোফোবিক অ্যাক্সুডেট উপাদানগুলি (হলুদ 💛) উৎসের কাছাকাছি থাকে।
(খ) নির্দিষ্ট নির্গমনিত যৌগগুলি ব্যাকটেরিয়া মিথাইল-গ্রহণকারী কেমোট্যাক্সিস (Chemotaxis)প্রোটিন (এমসিপি:-মনোক্যালসিয়াম ফসফেট{Ca(H₂PO₄)₂}) দ্বারা সনাক্ত করা হয়, যা আকর্ষকদের (attractors) নিবেদিত কোমোসেন্সর। কেমোসেন্সরি সিস্টেম (Chemosensory system) এবং মোটরের মধ্যে সংকেত ব্যাকটেরিয়াকে আকর্ষক উৎসের দিকে পরিচালিত করে। রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ কোষঝিল্লিতে থাকা NodD protein (কোমোসেন্সর {Chemosensor}) হিসেবে কাজ করে।এটি একটি ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটর (Transcriptional Regulator) যা ব্যাকটেরিয়ার কোষে ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগগুলো শনাক্ত করে।ফ্ল্যাভোনয়েডের সাথে যুক্ত হয়ে এটি nod box genes গুলোর অ্যাক্সোপ্রেশন ট্রিগার করে, যা Nodulative factors উৎপন্ন করে।এটি প্রোক্যারিওটিক চলন অঙ্গাণু, যা ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদের রাইজোস্ফিয়ারে (Rhizosphere) দ্রুতগতিতে পৌঁছাতে সাহায্য করে।ফ্ল্যাজেলাম নড়াচড়ার নির্দেশনা পায় কোমোসেন্সিং সিস্টেম (Chemosensing system) থেকে, যার মধ্যে কোমোসেন্সর, কোমোসিগনালিং পথ (Chemosignaling Pathway) এবং মোটর অংশ থাকে।
(গ) রাইজোবিয়াল NodD দ্বারা উদ্ভিদ ফ্ল্যাভোনয়েডের উপলব্ধি সঠিক হোস্টকে সংক্রামিত করার জন্য জড়িত জিনের প্রতিলিপি শুরু করে। ব্যাকটেরিয়া নোড ফ্যাক্টর (lipochitooligosaccharide) নিঃসরণ করে, যা উদ্ভিদের শিকড় কোষে সংকেত পৌঁছে দেয়।লিগিউমিনাস (Leguminous) গাছের মূল থেকে নির্গত কিছু ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার NodD প্রোটিন সক্রিয় করে নোড জিন (nod genes) গুলোর কার্যক্রম শুরু করে। এই যৌগগুলো সংকেত-আণবিক (signaling molecule) হিসেবে কাজ করে এবং ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস প্রক্রিয়া শুরু করতে সাহায্য করে।লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদের মূল থেকে নিঃসৃত ফ্ল্যাভোনয়েড (Flavonoids) যৌগ nodD জিন সক্রিয় করে। এরপর nodABC গোষ্ঠী মূল GlcNAc ব্যাকবোন গঠন করে এবং অন্যান্য nod জিনগুলোর সাহায্যে মোডিফিকেশন সম্পন্ন হয়। ফলস্বরূপ উৎপন্ন Nodulative Factor উদ্ভিদের মূল কোষে সংকেত প্রেরণ করে এবং সেলুলার প্রতিক্রিয়া শুরু হয়, যার মাধ্যমে নডিউল মরফোজেনেসিস প্রক্রিয়া শুরু হয়।এ ধাপে নোড অপেরন(Operon) এ থাকা নোড ক্লাস্টারে নোড জিনসমূহ ত্বরান্বিত করতে মূখ্য ভূমিকা পালন করে সহায়ক হিসেবে। [১]
ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগসমূহের তালিকা
[সম্পাদনা]| ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগের ইংরেজি নাম | বাংলা নাম | শ্রেণি (Class) | রাসায়নিক সংকেত (Chemical Formula) | উৎস উদ্ভিদ (Host Plant) |
|---|---|---|---|---|
| Luteolin | লুটিওলিন | Flavone | C15H10O6 | Medicago sativa (আলফালফা) |
| Genistein | জেনিস্টেইন | Isoflavone | C15H10O5 | Glycine max (সয়াবিন) |
| Daidzein | ডাইডোজেইন | Isoflavone | C15H10O4 | Glycine max (সয়াবিন) |
| Naringenin | নারিন্জেনিন | Flavanone | C15H12O5 | Phaseolus vulgaris (সাধারণ শিম) |
| Eriodictyol | অ্যারিওডিক্টিওল | Flavanone | C15H12O6 | Phaseolus spp. (বিভিন্ন শিম প্রজাতি) |
| Apigenin | অ্যাপিজেনিন | Flavone | C15H10O5 | Trifolium spp. (ক্লোভার) |
| Chrysin | ক্রাইসিন | Flavone | C15H10O4 | বিভিন্ন লিগিউমিনাস উদ্ভিদ |
| Formononetin | ফর্মোনোনেটিন | Isoflavone | C16H12O4 | Trifolium pratense (লাল ক্লোভার) |
| Biochanin A | বায়োক্যানিন এ | Isoflavone | C16H12O5 | Cicer arietinum (ছোলা) |
| Liquiritigenin | লিকুইরিটিজেনিন | Flavanone | C16H12O4 | Glycyrrhiza spp. (যষ্টিমধু) |
| 7,4'-Dihydroxyflavone | ৭,৪'-ডাইহাইড্রক্সিফ্ল্যাভোন | Flavone | C15H10O4 | বিভিন্ন লিগিউমিনাস উদ্ভিদ |
| 7-Hydroxyflavone | ৭-হাইড্রক্সিফ্ল্যাভোন | Flavone | C15H10O3 | বহু লিগিউমিনাস উদ্ভিদ |
নোড ফ্যাক্টরের (Nodulative Factor) গঠন
[সম্পাদনা]নোড ফ্যাক্টর সাধারণত নিম্নলিখিত রাসায়নিক উপাদানসমূহ দ্বারা গঠিত হয়:
| যৌগ/উপাদান | রাসায়নিক সংকেত | কাজ ও ভূমিকা |
|---|---|---|
| বিটা-১,৪-সংযুক্ত এন-অ্যাসিটাইলগ্লুকোসামিন | β-1,4-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) | Nod factor-এর মূল ব্যাকবোন গঠন করে |
| ফ্যাটি অ্যাসাইল শৃঙ্খল | Fatty acyl chain (R-CO-) | হাইড্রোফোবিক অংশ; প্রজাতিভেদে পরিবর্তিত হয় |
| অ্যাসিটাইল গ্রুপ | –COCH3 (Acetyl group) | গঠনগত মোডিফিকেশন ঘটায় ও জৈব সংকেত প্রেরণে সাহায্য করে |
| সালফেট গ্রুপ | –SO42⁻ (Sulfate group) | সিগন্যাল শক্তি ও কার্যকারিতা বৃদ্ধি করে |
| কার্বাময়েল গ্রুপ | –CONH2 (Carbamoyl group) | নির্দিষ্ট উদ্ভিদের মূল কোষে গ্রহণযোগ্যতা বাড়ায় |
| ফিউকোজ / আরাবিনোজ শর্করা | Fucose / Arabinose (–O-Sugar) | শর্করা সংযোজনের মাধ্যমে প্রজাতি-নির্দিষ্টতা নির্ধারণ করে |
২. ইনফেকশন থ্রেড গঠন(Formation of Inflection thread): ব্যাকটেরিয়া শিকড়ের মূলরোম কোষে প্রবেশ করে ইনফেকশন থ্রেড তৈরি করে, যাকে ইনফেকশন থ্রেডিং পদ্ধতি বলে।ব্যাকটেরিয়া শিকড়ের রোমে প্রবেশ করে এবং ইনফেকশন থ্রেড নামক টিউবুলার স্ট্রাকচার (Tabular Structure) তৈরি করে যার মাধ্যমে ব্যাকটেরিয়া শিকড়ের অভ্যন্তরে প্রবেশ করে।এ ধাপে ব্যাকটেরিয়াল টাইপ সিক্রেশন সিস্টেমিক, ইপিএস,টিটিএস,অ্যাক্সো, ফ্ল্যাগ,ফ্ল্যাজ,ফ্রিম ইত্যাদি অপেরন এ থাকা এসব ক্লাস্টারে ব্যাকটেরিয়াল টাইপ সিক্রেশন সিস্টেমিক, ইপিএস,টিটিএস,অ্যাক্সো,ফ্ল্যাগ,ফ্ল্যাজ,ফ্রিম জিনসমূহ ত্বরান্বিত করতে মূখ্য ভূমিকা পালন করে সহায়ক হিসেবে।এ ধাপে ইনফেকশন পকেট, ইনফেকশন থ্রেড ও ইনফেক্টোসোম তৈরি হয় অতিদ্রুততে নডিউল প্রাইর্মোডিয়াম কোষে প্রবেশ করার পূর্বে।
৩. হাইপারপ্লাসিয়া কোষ বিভাজন ও নডিউল গঠন(Formation of Nodule and Hyperplasia Cell division): ইনফেকশন থ্রেডিং পদ্ধতির সময় ইনফেকশন থ্রেডটি থেকে হাইপারপ্লাসিয়া কোষ বিভাজনের মাধ্যমে বিভাজিত লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদের শিকড়ের কর্টেক্স কোষের সাইটোপ্লাজমে রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ প্রবেশ করে এবং সেখানে রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ অ্যামাইটোসিস ও ক্যারিওস্টেনোসিস প্রোক্যারিওটিক কোষ বিভাজনের মাধ্যমে বিভাজিত হয়ে বংশবিস্তার করে।উদ্ভিদের কর্টেক্স ও পেরিসাইকেল কোষ বিভাজনের মাধ্যমে নডিউলের অবকাঠামো গঠিত হয়।উদ্ভিদের পেরিসাইকেল ও কর্টেক্স হাইপারপ্লাসিয়া পদ্ধতিতে কোষ বিভাজনের মাধ্যমে নতুন টিস্যু গঠন করে এবং একটি গঠনগত নডিউল সৃষ্টি করে যেখানে NCR পেপটাইড ও অন্যান্য জিন প্রোটিন দ্বারা (Bacteroides Differentiation:- Dedifferentiation & Redifferentiation) পদ্ধতি [২] রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ ব্যাক্টোরোয়েড (Bacteroides) রূপান্তরিত হয়। নাইট্রোজেন স্থিরকরণ এবং নাইট্রোজেন সরবরাহের জন্য পরিবেশ তৈরি করা সংক্রমণের থ্রেডটি নডিউল প্রাইমোর্ডিয়ামে পৌঁছানোর পর, সংক্রমণের থ্রেডগুলি ব্যাকটেরিয়া ধারক কোষে ফোঁটা ছেড়ে দেয়, যা সর্বদা একটি উদ্ভিদ-উদ্ভূত ঝিল্লি দ্বারা বেষ্টিত থাকে। এই কাঠামোগুলি, তথাকথিত সিম্বোসোমগুলি, অর্গানেলের মতো। সিম্বোসোমগুলি বিভাজন অব্যাহত রাখতে পারে এবং ব্যাক্টেরিয়াগুলি ব্যাক্টোরোয়েডে বিভক্ত হতে পারে। DNF1-ক্লিভড N-NCR মেমব্রেন ভেসিকেল ট্র্যাফিকিংয়ের মাধ্যমে সিম্বোসোমে সরবরাহ করা হয় এবং ব্যাক্টোরোয়েড পার্থক্যকে প্ররোচিত করে। DNF1 প্রোটিওলাইটিকভাবে NIN প্রোটিনকে বিচ্ছিন্ন করে এবং একটি C-NIN তৈরি করে, যা টার্মিনাল পার্থক্য এবং নাইট্রোজেন স্থিরকরণে জড়িত জিনগুলিকে সক্রিয় করে।

৪. নাইট্রোজেন ফিক্সেশন (Nitrogen fixation): ব্যাকটেরিয়া নাইট্রোজেনেজ (Nitrogenase) এনজাইমের মাধ্যমে বায়বীয় নাইট্রোজেনকে অ্যামোনিয়ায় রূপান্তর করে।ব্যাকটেরিয়া নডিউলের ভিতরে নাইট্রোজেনেজ এনজাইমের মাধ্যমে বায়ুমণ্ডলের নাইট্রোজেন (N₂) কে উদ্ভিদের গ্রহণযোগ্য অ্যামোনিয়া (NH₃)-তে রূপান্তর করে। রাইজোবিয়ামের নাইট্রোজেনেজ এনজাইম কমপ্লেক্স N₂ কে অ্যামোনিয়াতে (NH₃) রূপান্তরিত করে যা ব্যাক্টোরোয়েড থেকে প্রসারণ বা অজানা চ্যানেলের মাধ্যমে নির্গত হয়।সিম্বোসোম [৩](Symbosome) ঝিল্লিতে H+-ATPases একটি অ্যাসিডিক পেরিব্যাক্টোরোয়েড স্থান তৈরি করে, যা অ্যামোনিয়া প্রোটোনেট করে এবং অ্যামোনিয়াম(NH₄⁺) ক্যাটেশন তৈরি করে অ্যামোনিয়ামকে (NH₄⁺) আটকে রাখে। অ্যামোনিয়াম ক্যাটেশনগুলি উদ্ভিদ কোষের সাইটোপ্লাজমে রপ্তানি করা হয় এবং তারপর GS এবং GOGAT দ্বারা Gln এবং Glu-তে আত্তীকরণ করা হয়, যা অ্যামাইড গ্রুপকে Gln থেকে AKG-তে স্থানান্তর করে। লিগুমিনাসের প্রজাতি এবং নডিউলের ধরণের উপর নির্ভর করে, Gln এবং Glu জাইলেমের মাধ্যমে দীর্ঘ দূরত্বের পরিবহনের জন্য Asn বা ureides-এ রূপান্তরিত হয়। শেষ পর্যন্ত, নডিউলটি বার্ধক্য এবং ব্যাক্টোরোয়েডের লিসের মধ্য দিয়ে যায়। বার্ধক্য পর্যায়ে নডিউলগুলিতে বিভিন্ন CP অত্যন্ত উচ্চ মাত্রায় প্রকাশিত হয়, বিশেষ করে একটি প্যাপেইন পেপ্টিডেজ (CP6) এবং একটি VPE, যা একটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর NAC969 দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়।এ ধাপে নিফ অপেরন এ থাকা নিফ ক্লাস্টারে নিফ জিনসমূহ ত্বরান্বিত করতে মূখ্য ভূমিকা পালন করে সহায়ক হিসেবে।




উল্লেখযোগ্য তথ্য
[সম্পাদনা]- EPS I (Succinoglycan:- C56H92O46) নডিউল গঠনে উদ্ভিদের ইমিউন প্রতিক্রিয়া দমন করে।[৪]
- Exo জিনগুলোর মিউটেশনের ফলে নডিউল গঠন বিঘ্নিত হয়।
- এগুলো সাধারণত একসঙ্গে একটি জিন ক্লাস্টারে অবস্থান করে।
- উদ্ভিদের ফাইটোহরমোনসমূহ (Phytohormones)
উদ্ভিদের বিকাশ, বৃদ্ধি, সিগন্যাল সংবেদন, পরিবেশ প্রতিক্রিয়া এবং সিমবায়োসিস প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালনকারী প্রধান ফাইটোহরমোনসমূহ নিম্নরূপ:
- ১. IAA (Indole-3-Acetic Acid)
- **রাসায়নিক সংকেত**: C10H9NO2
- **ধরন**: অক্সিন (Auxin)
- **প্রধান কার্যাবলী**:- শিকড় ও কান্ড বৃদ্ধিতে সহায়তা,Root hair curling ও নোড গঠনে প্রাথমিক ভূমিকা,কোষ প্রসারণ ও ভিন্নকরণে সহায়ক হিসেবে কাজ করে।
২. CK (Cytokinin)
- **প্রতিনিধিত্বকারী যৌগ**: Zeatin
- **রাসায়নিক সংকেত (Zeatin)**: C10H13N5O
- **ধরন**: সাইটোকাইনিন
- **প্রধান কার্যাবলী**:- কোষ বিভাজন বৃদ্ধি,নডিউল গঠনে Cortex কোষকে সক্রিয় করে,NIN, CRE1 pathway উদ্দীপিত করে
৩. ET (Ethylene)
- **রাসায়নিক সংকেত**: C2H4
- **ধরন**: গ্যাসীয় হরমোন
- **প্রধান কার্যাবলী**:- ফল পাকা ও পত্রপাত ঝরা ঘটায়,উচ্চমাত্রায় নোড গঠন বাধাগ্রস্ত করে,কিছু মাত্রায় নোড সংবেদনশীলতা নিয়ন্ত্রণ করে।
৪. GA (Gibberellic Acid)
- **রাসায়নিক সংকেত (GA3)**: C19H22O6
- **ধরন**: জিব্বেরেলিন
- **প্রধান কার্যাবলী**:- শিকড় ও কান্ডের কোষ প্রসারণ,নডিউলের বিকাশ ত্বরান্বিত করে,বীজ অঙ্কুরোদগমের সহায়তা করে।
৫. BR (Brassinosteroids)
- **প্রতিনিধি যৌগ**: Brassinolide - **রাসায়নিক সংকেত (Brassinolide)**: C28H48O6
- **ধরন**: স্টেরয়েড জাতীয় হরমোন
- **প্রধান কার্যাবলী**:- কোষ বিভাজন ও প্রসারণে সহায়ক,সিমবায়োটিক সিগন্যাল প্রতিক্রিয়া সমন্বয় করে,শারীরবৃত্তীয় প্রতিক্রিয়া সক্রিয় রাখে।
৬. JA (Jasmonic Acid)
- **রাসায়নিক সংকেত**: C12H18O3
- **ধরন**: অক্সিলিপিন
- **প্রধান কার্যাবলী**:- পরিবেশগত স্ট্রেসে প্রতিক্রিয়া প্রদান,অতিমাত্রায় নোড গঠনে প্রতিবন্ধক হতে পারে,সুরক্ষা সিগন্যাল ও জিন অণুব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে।
৭. ABA (Abscisic Acid)
- **রাসায়নিক সংকেত**: C15H20O4
- **ধরন**: টেরপেনয়েড
- **প্রধান কার্যাবলী**:- জলঘাটতির সময় স্টোমাটা বন্ধ করে,পরিপক্ব নোডিউলে নাইট্রোজেন ফিক্সেশন বজায় রাখে,বীজ সুপ্তাবস্থায় রাখে।
কৃষিতে প্রয়োগ
[সম্পাদনা]এই প্রক্রিয়া টেকসই কৃষি ব্যবস্থার জন্য গুরুত্বপূর্ণ, কারণ এটি রাসায়নিক সারের ব্যবহার কমিয়ে পরিবেশবান্ধব কৃষি নিশ্চিত করে।
অংশগ্রহণকারী নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদের জিনসমূহ
[সম্পাদনা]নডিউল মরফোজেনেসিসে অনেক উদ্ভিদ ও ব্যাকটেরিয়াল জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এর মধ্যে রয়েছে:
- NIN (Nodule Inception)
- ENOD (Early Nodulin)
- NSP1 ও NSP2
- SYMRK (Symbiosis Receptor-like Kinase) – সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন প্রক্রিয়া শুরু করে।
- CCaMK (Calcium and Calmodulin-dependent protein Kinase) – ক্যালসিয়াম সংকেতের মাধ্যমে প্রতিক্রিয়া দেয়।
- ক্যালসিয়াম স্পাইকিং ও সাইটোকাইনিন সংকেত পথ এই প্রক্রিয়ার অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ অংশ।
ফ্ল্যাভোনয়েড সংশ্লেষণ-সম্পর্কিত জিনসমূহ (লিগুমিনাস উদ্ভিদে)
[সম্পাদনা]লিগুমিনাস (Leguminous) জাতীয় উদ্ভিদে ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ তৈরিতে নিচের জিনসমূহ গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে:
১. CHS (Chalcone Synthase/polyketide synthase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: পলিকেটাইড পথের(Polyketide pathway) এ এনজাইম মাধ্যমে চ্যালকোন তৈরি করে, যা ফ্ল্যাভোনয়েড সংশ্লেষণের প্রাথমিক পদার্থ।
- মন্তব্য: এটি ফ্ল্যাভোনয়েড বায়োসিন্থেসিসের প্রথম ও নিয়ন্ত্রক এনজাইম।
২. CHI (Chalcone Isomerase/lsomochalonase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: চ্যালকোনকে ফ্ল্যাভানোনে রূপান্তর করে।
- মন্তব্য: এটি ফ্ল্যাভোনয়েড অণুর রিং গঠনে সহায়তা করে।
৩. F3H (Flavanone 3-Hydroxylase/Naringenin 3-dioxygenase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: ফ্ল্যাভানোন থেকে ডাইহাইড্রোফ্ল্যাভোনল তৈরি করে।
- মন্তব্য: এটি পরবর্তী ধাপে অ্যান্থোসায়ানিন সংশ্লেষণের জন্য প্রস্তুত করে।
৪. F3'H (Flavonoid 3'-Hydroxylase/Naringenin 3′-hydroxylase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: ফ্ল্যাভোনয়েড অণুর B-রিং-এ হাইড্রক্সিল গ্রুপ যোগ করে।
- মন্তব্য: বিভিন্ন রঙের অ্যান্থোসায়ানিন উৎপাদনে ভূমিকা রাখে।
৫. DFR (Dihydroflavonol 4-Reductase/Leucocyanidin reductase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: ডাইহাইড্রোফ্ল্যাভোনলকে লিউকোকায়ানিডিনে রূপান্তর বা রিডাক্টেড করে।
- মন্তব্য: এটি রঞ্জক সংশ্লেষণে অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ।
৬. ANS (Anthocyanidin Synthase/Leucocyanidin dioxygenase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: লিউকোকায়ানিডিন থেকে অ্যান্থোসায়ানিডিন তৈরি করে।
- মন্তব্য: এটি রঞ্জক অ্যান্থোসায়ানিনের মূল উপাদান।
৭. UFGT (Uridine Diphosphate-Glucose:flavonoid 3-O-Glucosyltransferase/Anthocyanidin 3-O-Glucosyltransferase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: অ্যান্থোসায়ানিডিন অণুকে গ্লুকোজ সংযুক্ত করে অ্যান্থোসায়ানিনে রূপান্তর করে।
- মন্তব্য: গ্লাইকোসাইলেশন পদ্ধতির মাধ্যমে রঞ্জকের স্থিতিশীলতা বৃদ্ধি করে।
৮. IFS (Isoflavone Synthase/2-hydroxyisoflavanone synthase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: ফ্ল্যাভানোন থেকে আইসোফ্ল্যাভোন তৈরি করে।
- মন্তব্য: লিগুমিনাস উদ্ভিদে বিশেষভাবে গুরুত্বপূর্ণ এনজাইম।
৯. IFR (Isoflavone Reductase/Cytochrome P450 monooxygenase)
[সম্পাদনা]- কার্যাবলি: আইসোফ্ল্যাভোন সংশ্লেষণের পরবর্তী ধাপে কাজ করে।
- মন্তব্য: উদ্ভিদের প্রতিরক্ষা প্রক্রিয়ায় সহায়তা করে।
ব্যবহার
[সম্পাদনা]এই জিনসমূহ লিগুমিনাস উদ্ভিদের বিভিন্ন প্রজাতিতে যেমন সয়াবিন (Glycine max), মেডিকাগো (Medicago truncatula), ও লোটাস (Lotus japonicus)-এ গবেষণায় ব্যবহৃত হয়েছে।
অংশগ্রহণকারী রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া
[সম্পাদনা]| ক্রমিক নাম্বার | রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহের নাম | নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদ বা (Nodulation host) (উদাহরণস্বরূপ) | শ্রেণিবিন্যাস (Taxonomic classification) |
|---|---|---|---|
| ১ | Rhizobium leguminosarum | মটর, মসুর | গামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২ | Bradyrhizobium japonicum | সয়াবিন | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩ | Sinorhizobium meliloti | আলফালফা (মেদিকাগো),Melilotus officinalis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪ | Mesorhizobium loti | লোটাস | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫ | Azorhizobium caulinodans | সেশনিয়া,Sesbania rostrata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬ | Ensifer fredii | সয়াবিন, মিমোসা | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭ | Rhizobium etli | ফেজিওলাস (সাধারণ বিন) | গামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮ | Rhizobium tropici | Trifolium alexandrinum,Trifolium grandiflorum,Trifolium campestre,Trifolium hirtum,Trifolium hybridum,Trifolium incarnatum,Trifolium nigrescens,Trifolium pratense,Trifolium repens,Trifolium resupinatum,Trifolium subterraneum | গামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯ | Mesorhizobium ciceri | ছোলা | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০ | Bradyrhizobium elkanii | সয়াবিন | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১১ | Sinorhizobium kummerowiae | Kummerowia striata (এক প্রকার legume) এশিয়ায় পাওয়া যায় | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২ | Rhizobium phaseoli | বিন Leucaena leucocephala,Phaseolus vulgaris | গামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩ | Rhizobium bangladeshense | Cicer arietinum (ছোলা উদ্ভিদ) | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪ | Rhizobium acidisoli | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫ | Rhizobium aegyptiacum | Vigna unguiculata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬ | Rhizobium aethiopicum | Cajanus cajan | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭ | Rhizobium alamii | Arachis hypogaea | গামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৮ | Rhizobium album | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৯ | Rhizobium albus | Arachis hypogaea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২০ | Rhizobium alkalisoli | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২১ | Rhizobium altiplani | Mimosa pudica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২২ | Rhizobium alvei | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৩ | Rhizobium anhuiense | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৪ | Rhizobium aquaticum | Aeschynomene indica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৫ | Rhizobium arachis | Arachis hypogaea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৬ | Rhizobium arenae | Arachis hypogaea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৭ | Rhizobium arsenicireducens | Medicago Sativa | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৮ | Rhizobium azibense | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ২৯ | Rhizobium azooxidifex | Vigna angularis,Vigna aconitifolia,Vigna subterranea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩০ | Rhizobium binae | Vigna unguiculata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩১ | Bradyrhizobium betae | beta vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩২ | Rhizobium retamae | Retama raetam | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৩ | Bradyrhizobium Huanghuaihaiense | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৪ | Rhizobium yuanmingens | Corollina varia,Amphicarpaea bracteata,Reutealis trisperma,Gueldenstaedtia Fisch,Gueldenstaedtia verna,Rosa multiflora,Fockea multiflora | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৫ | Rhizobium calliandrae | Calliandra calothyrsus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৬ | Rhizobium capsici | Chili Pepper (Capsicum annuum) | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৭ | Rhizobium cauense | Cajanus Cajan | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৮ | Rhizobium cellulosilyticum | Glycine max,Medicago sativa,Pisum sativum,Lupinus albus,Lupinus polyphyllus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৩৯ | Rhizobium changzhiense | Cicer arietinum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪০ | Rhizobium chutanense | Cicer reticulatum,Cicer echinospermum,Cicer bijugum,Cicer judaicum,Cicer microphyllum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪১ | Rhizobium cremeum | Phaseolus lunatus,Phaseolus coccineus,Phaseolus acutifolius,Phaseolus polystachios, Phaseolus filiformis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪২ | Rhizobium croatiense | Phaseolus coccineus,Phaseolus acutifolius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৩ | Rhizobium deserti | Vachellia pachyceras | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৪ | Rhizobium dioscoreae | Dioscorea villosa,Dioscorea cayenensis, Dioscorea bulbifera,Dioscorea oppositifolia | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৫ | Rhizobium ecuadorense | Phaseolus Vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৬ | Rhizobium endophyticum | Phaseolus angularis,Phaseolus polystachios,Phaseolus coccineus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৭ | Rhizobium esperanzae | Crotalaria juncea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৮ | Rhizobium pisi | Pisum Sativum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৪৯ | Rhizobium favelukesii | Cajanus platycarpus,Cajanus indicus,Cajanus cajanifolius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫০ | Rhizobium flavescens | Cajanus platycarpus,Cajanus cajanifolius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫১ | Rhizobium freirei | Glycine max,Trifolium alexandrinum,Trifolium grandiflorum, Pisum sativum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫২ | Rhizobium gei | Cajanus cajan | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৩ | Rhizobium glycinendophyticum | Glycine soja,Glycine tomentella,Glycine clandestina,Glycine hispidula | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৪ | Rhizobium grahamii | Cajanus scarabaeoides | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৫ | Rhizobium hainanense | Centrosema brasilianum,Desmodium podocarpum,Stylosanthes venezuelensis,Tephrosia virginiana | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৬ | Rhizobium halophytocola | Salicornia virginica,Salicornia europaea,Salicornia dolichostachya,Salicornia perennis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৭ | Rhizobium halotolerans | Vigna radiata, Medicago polymorpha,Medicago arabica,Vigna subterranea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৮ | Rhizobium hedysari | Hedysarum coronarium,Hedysarum grandiflorum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৫৯ | Rhizobium hedysarum | Hedysarum boreale,Hedysarum sulphureum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬০ | Rhizobium helianthi | Helianthus annuus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬১ | Rhizobium hidalgonense | Phaseolus polystachios | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬২ | Rhizobium indicum | Cajanus volubilis,Cajanus sericeus,Cajanus rhomboideus,Cajanus confertiflorus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৩ | Rhizobium jaguaris | Calliandra grandiflora,Calliandra haematocephala,Calliandra californica,Calliandra tweedii,Calliandra houstoniana | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৪ | Rhizobium kunmingense | Phaseolus angustissimus,Phaseolus atropurpureus,Phaseolus brevicalyx, Phaseolus leptostachyus,Phaseolus maculatifolius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৫ | Rhizobium laguerreae | Lens culinaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৬ | Rhizobium lemnae | Lemna minor | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৭ | Rhizobium lentis | Lens culinaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৮ | Rhizobium leucaenae | Leucaena leucocephala,Leucaena cultivars,Leucaena psyllid | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৬৯ | Rhizobium lusitanum | Phaseolus maculatifolius,Phaseolus leptostachyus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭০ | Rhizobium massiliense | Phaseolus vulgaris,Phaseolus maculatifolius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭১ | Rhizobium mayense | Phaseolus mollis, Phaseolus Pachyrrizoides, Phaseolus Esperanzae | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭২ | Rhizobium mesoamericanum | Phaseolus Vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৩ | Rhizobium mesosinicum | Medicago lupulina | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৪ | Rhizobium miluonense | phaseolus maculatifolius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৫ | Rhizobium mongolense | Medicago ruthenica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৬ | Rhizobium multihospitium | Lotus corniculatus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৭ | Rhizobium oryzicola | Oryza longistaminata,Oryza australiensis,Oryza brachyantha,Oryza grandiglumis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৮ | Rhizobium oryzihabitans | Oryza australiensis,Oryza longistaminata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৭৯ | Rhizobium pakistanense | Vigna mungo | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮০ | Rhizobium panacihumi | Panax ginseng | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮১ | Rhizobium paranaense | Proteus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮২ | Rhizobium phenanthrenilyticum | Medicago sativa | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৩ | Rhizobium pongamiae | Pongamia pinnata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৪ | Rhizobium populi | Populus tomentosa | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৫ | Rhizobium populisoli | Populus alba | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৬ | Rhizobium puerariae | Pueraria phaseoloides | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৭ | Rhizobium qilianshanense | Astragalus membranaceus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৮ | Rhizobium quercicola | Quercus robur | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৮৯ | Rhizobium redzepovicii | Phaseolus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯০ | Rhizobium rhizogenes | Parasponia seramensis,Leucaena leucocephala,Phaseolus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯১ | Rhizobium rhizolycopersici | Solanum lycopersicum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯২ | Rhizobium rhizoryzae | Oryza Sativa | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৩ | Rhizobium ruizarguesonis | Phaseolus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৪ | Rhizobium smilacinae | Smilacina japonica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৫ | Rhizobium soli | Phaseolus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৬ | Rhizobium sophorae | Sophora japonica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৭ | Rhizobium sophoriradicis | Sophora flavescens | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৮ | Rhizobium straminoryzae | Streptanthus polygaloides | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ৯৯ | Rhizobium sullae | Hedysarum coronarium | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০০ | Rhizobium terrae | Glycine max,Pisum sativum,Phaseolus vulgaris,Lens culinaris, Cicer arietinum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০১ | Rhizobium tibeticum | Trifolium repens | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০২ | Rhizobium tubonense | Cajanus cajan | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৩ | Rhizobium tumorigenes | Solanum lycopersicum,Solanum tuberosum,Nicotiana tabacum,Brassica oleracea,Gossypium hirsutum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৪ | Rhizobium vallis | Vicia faba | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৫ | Rhizobium viscosum | Vigna radiata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৬ | Rhizobium wenxiniae | Medicago truncatula | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৭ | Rhizobium zeae | Zea mays | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৮ | Ciceribacter daejeonensis | Cicer arietinum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১০৯ | Bradyrhizobium diazoefficiens | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২০ | Bradyrhizobium agreste | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২১ | Bradyrhizobium glycinis | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২২ | Bradyrhizobium diversitatis | Cajanus cajan,Phaseolus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৩ | Bradyrhizobium algeriense | Medicago Sativa | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৪ | Bradyrhizobium americanum | Lespedeza cuneata (Sericea lespedeza) | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৫ | Bradyrhizobium amphicarpaeae | Amphicarpaea bracteata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৬ | Bradyrhizobium arachidis | Arachis hypogaea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৭ | Bradyrhizobium archetypum | sericea lespedeza | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৮ | Bradyrhizobium australiense | Macroptilium atropurpureum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১২৯ | Bradyrhizobium cajani | Cajanus cajan | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩০ | Bradyrhizobium centrosematis | Centrosema pubescens | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩১ | Bradyrhizobium cosmicum | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩২ | Bradyrhizobium cytisi | Cytisus scoparius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৩ | Bradyrhizobium daqingense | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৪ | Bradyrhizobium denitrificans | Aeschynomene indica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৫ | Bradyrhizobium embrapense | Stylosanthes guianensis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৬ | Bradyrhizobium erythrophlei | Erythrophleum fordii | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৭ | Bradyrhizobium ferriligni | Acacia melanoxylon,Acacia nilotica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৮ | Bradyrhizobium ganzhouense | Glycine clandestina, Glycine latifolia | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৩৯ | Bradyrhizobium guangdongense | Arachia hypogaea & Lablab purpureus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪০ | Bradyrhizobium guangxiense | Acacia mangium | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪১ | Bradyrhizobium hipponense | Arachis stenosperma,Arachis monticola | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪২ | Bradyrhizobium pachyrhizi | Glycine latifolia | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৩ | Bradyrhizobium liaoningense | Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৪ | Bradyrhizobium stylosanthis | Stylosanthes guianensis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৫ | Bradyrhizobium lablabi | Lablab purpureus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৬ | Azorhizobium doebereinerae | Sesbania virgata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৭ | Cupriavidus necator | Mimosa caesalpiniaefolia,Leucaena leucocephala,Proteus vulgaris,Vigna unguiculata | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৮ | Methylobacterium nodulans | Crotalaria glaucoides,Crotalaria podocarpa,Crotalaria perrottetii | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৪৯ | Paraburkholderia mimosarum | Mimosa pigra | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫০ | Paraburkholderia nodosa | Phaseolus vulgaris | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫১ | Paraburkholderia piptadeniae | Piptadenia gonoacantha | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫২ | Paraburkholderia tuberum | Aspalathus carnosa | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৩ | Devosia neptuniae | Neptunia natans | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৪ | Devosia yakushimensis | Pueraria lobata | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৫ | Agrobacterium salinitolerans | Sesbania cannabina | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৬ | Agrobacterium deltaense | Sesbania cannabina | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৭ | Ensifer sojae | Vigna unguiculata,Glycine max | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৮ | Ensifer medicae | Medicago polymorpha | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৫৯ | Mesorhizobium shangrilense | Caragana microphylla | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬০ | Mesorhizobium robiniae | Robinia pseudoacacia | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬১ | Mesorhizobium loti | Lotus japonicus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬২ | Microvirga lupini | Lupinus texensis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৩ | Microvirga lotononidis | Listia angolensis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৪ | Microvirga zambiensis | Listia angolensis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৫ | Ochrobactrum lupini | Lupinus albus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৬ | Ochrobactrum cytisi | Proteus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৭ | Pararhizobium giardinii | Proteus vulgaris | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৮ | Pararhizobium herbae | Albizia julibrissin | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৬৯ | Phyllobacterium trifolii | Trifolium repens,Lupinus albus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭০ | Phyllobacterium sophorae | Sophora flavescens | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭১ | Rhizobium xinjiangensis | Trigonella adscendens,Trigonella foenum-graecum | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭২ | Rhizobium huakuii | Astragalus sinicus | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭৩ | Rhizobium huautlense | Sesbania herbacea | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭৪ | Rhizobium galegue | Galega officinalis,Galega orientalis | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭৫ | Rhizobium viciae | pisum sativum,Vicia sativa | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭৬ | Rhizobium indigoferae | Indigofera tinctoria | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭৮ | Rhizobium undicola | Neptunia natans | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৭৯ | Ensifer abri | Sesbania rostrata, Abrus precatorius | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৮০ | Rhizobium loessense | Lespedeza virginica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৮১ | Azorhizobium oxalatiphilum | Tamarindus indica | আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৮২ | Ciceribacter naphthalenivorans | Vicia faba | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৮৩ | Cieribacter selenitireducens | Cicer arietinum | বিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া |
| ১৮৪ | Ensifer arboris |
নাইট্রোজেফিক্স প্লাসমিড
[সম্পাদনা]এই জিনসমূহ সাধারণত একটি বা একাধিক **Sym plasmid (pSym)** এ অবস্থান করে। উদাহরণস্বরূপ:
- Sinorhizobium meliloti তে দুটি প্রধান প্লাসমিড থাকে: **pSymA** (nif/nod বহনকারী) এবং **pSymB**
- Rhizobium leguminosarum এ pRL10, pRL11, In-fusion pMWnifVSU GluDH,pHY NifB-hesA,pRHB470,pRHB506,qRT-PCR-,pRP30,pDOA9,pRSF1010,pBCJ2315,HI2424,pBVIE01,pBVIE05, প্রভৃতি ভেক্টরধারী প্লাসমিড দেখা যায়।
অংশগ্রহণকারী ডায়াজোট্রোফ ব্যাকটেরিয়াল জিন অপেরন
[সম্পাদনা]Hya জিনসমূহ এবং তাদের কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]| জিন | সংশ্লিষ্ট প্রোটিন | কার্যপ্রণালী |
|---|---|---|
| hyaA | হাইড্রোজেনেজ বড় সাবইউনিট | ইলেকট্রন পরিবহন এবং হাইড্রোজেন গ্যাসের অক্সিডেশন |
| hyaB | হাইড্রোজেনেজ ছোট সাবইউনিট | ইলেকট্রন পরিবহন এবং হাইড্রোজেন গ্যাসের অক্সিডেশন |
| hyaC | সাইটোক্রোম b উপাদান | ইলেকট্রন পরিবহন চেইনে অংশগ্রহণ |
| hyaD | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaE | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaF | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaG | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaH | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaI | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaJ | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaK | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaL | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaM | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaN | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaO | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaP | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaQ | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaR | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaS | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaT | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaU | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaV | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaW | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaX | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaY | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
| hyaZ | পরিপক্বতা সহকারী প্রোটিন | হাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে |
Nif (Nitrogen Fixation) জিনসমূহ
[সম্পাদনা]রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়ায় নাইট্রোজেন ফিক্সেশন প্রক্রিয়ার জন্য দায়ী জিনগুচ্ছকে Nif জিন বলা হয়। NifA থেকে শুরু করে NifZ পর্যন্ত প্রতিটি জিন নির্দিষ্ট ভূমিকা পালন করে। নিচে তাদের নাম ও কাজ উল্লেখ করা হলো:
| জিনের নাম | কাজের সংক্ষিপ্ত বর্ণনা |
|---|---|
| nifA | Transcriptional activator; অন্যান্য Nif জিনগুলোর কার্যক্রম শুরু করে |
| nifB | FeMo-cofactor (FeMo-co) এর প্রাথমিক ধাপের গঠন নিশ্চিত করে |
| nifC | Cofactor সংশ্লেষণে সহায়তা করে; কিছু রাইজোবিয়ামে দেখা যায় |
| nifD | Nitrogenase এর MoFe-protein এর α-subunit তৈরি করে |
| nifE | Cofactor assembly complex গঠন করে (nifN-এর সাথে মিলে) |
| nifF | Electron carrier হিসেবে কাজ করে, electron পরিবহন করে nitrogenase-এ |
| nifG | Cofactor সংশ্লেষণে ভূমিকা রাখে (FeMo-co সংশ্লেষণ) |
| nifH | Nitrogenase এর Fe-protein গঠন করে; ATP দ্বারা চালিত ইলেকট্রন ট্রান্সফার নিশ্চিত করে |
| nifI | Regulatory function পালন করে; O₂ গ্যাস নাইট্রোজেনেজ এনজাইম সংবেদনশীলতা সুরক্ষা করে |
| nifJ | Pyruvate:flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase (ফ্ল্যাভোডোক্সিনেজ/ফেরোডোক্সিনেজ) এনজাইম উৎপন্ন করে |
| nifK | Nitrogenase MoFe-protein এর β-subunit তৈরি করে (nifD-এর সাথে জোড়ায় কাজ করে) |
| nifL | Negative regulator; উচ্চ অক্সিজেন বা নাইট্রোজেন কনসেনট্রেশনে nifA বন্ধ রাখে |
| nifM | Fe-protein সঠিকভাবে ভাঁজ (folding) নিশ্চিত করে (chaperone protein) |
| nifN | FeMo-co তৈরিতে জড়িত; nifE-এর সাথে কাজ করে |
| nifO | Cofactor সংযোজন ও নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রাখে |
| nifP | Phosphatase এনজাইম; ফসফেট সমন্বয় করে |
| nifQ | Molybdenum পরিবহন ও সংযোজনে ভূমিকা রাখে |
| nifR(NifR1 & NifR2) | নিয়ন্ত্রক (regulator) ও Transcriptional Repression জিন; সংবেদনশীলতা ও প্রতিক্রিয়াশীলতা বজায় রাখে |
| nifS | Fe-S cluster সংশ্লেষণে জড়িত |
| nifT | Cofactor সংশ্লেষণে ভূমিকা; কিছু রাইজোবিয়ামে থাকে |
| nifU | Fe-S cluster assembly এবং সংরক্ষণে সহায়তা করে |
| nifV | Homocitrate synthase তৈরি করে, FeMo-cofactor অংশ হিসেবে কাজ করে |
| nifW | Nitrogenase এর সুরক্ষা দেয়; স্থিতিশীলতা নিশ্চিত করে |
| nifX | FeMo-cofactor পরিবহন ও সংরক্ষণে জড়িত |
| nifY | FeMo-cofactor পরিপক্বতায় সহায়তা করে |
| nifZ | Nitrogenase প্রোটিনের সমাপ্তি ও সঠিক জটিল গঠনে সাহায্য করে |
Nod জিনসমূহ ও কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]| জিনের নাম | কাজ/ফাংশন | ব্যাখ্যা |
|---|---|---|
| nodA | N-acylation | Nod ফ্যাক্টরে ফ্যাটি অ্যাসিড যুক্ত করে যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে গুরুত্বপূর্ণ |
| nodB | Deacetylation | চিটোবিওজের ডি-অ্যাসিটাইলেশন করে Nod ফ্যাক্টর প্রস্তুতিতে অংশগ্রহণ করে |
| nodC | Chitin oligosaccharide synthesis | চিটিন ওলিগোস্যাকারাইড চেইন তৈরি করে, যা Nod ফ্যাক্টরের মূল কঙ্কাল |
| nodD:-(nodD1,nodD2,nodD3 & NodD4) | Transcriptional activation & Regulator protein | উদ্ভিদের ফ্ল্যাভোনয়েড শনাক্ত করে এবং অন্যান্য nod জিনগুলো চালু করে |
| nodE | Fatty acid modification | ফ্যাটি অ্যাসিডের গঠন পরিবর্তনের মাধ্যমে হোস্ট নির্দিষ্টতা বাড়ায় (বিশেষত ব্র্যাডিরাইজোবিয়াম-এ) |
| nodF | Fatty acid biosynthesis | নির্দিষ্ট ফ্যাটি অ্যাসিড সংশ্লেষণ করে Nod ফ্যাক্টর সংশোধনে সাহায্য করে |
| nodG | NADPH-dependent reductase | ফ্যাটি অ্যাসিড সংশ্লেষণে রিডাকশন এনজাইম হিসেবে কাজ করে |
| nodH | Sulfation | Nod ফ্যাক্টরের টার্মিনাল রেস্টিডিউতে সালফেট যুক্ত করে |
| nodI | Efflux protein | Nod ফ্যাক্টর রুট এক্সসিউডে রপ্তানিতে ভূমিকা রাখে |
| nodJ | Efflux transporter | nodI-এর সাথে মিলিতভাবে Nod ফ্যাক্টর পরিবহনে সাহায্য করে |
| nodL | O-acetylation | Nod ফ্যাক্টরের চেইনে অ্যাসেটিল গ্রুপ যুক্ত করে, হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সহায়ক |
| nodM | Glucosamine synthesis | ফ্রুক্টোজ-৬-ফসফেট থেকে গ্লুকোসামিন-৬-ফসফেট তৈরি করে (প্রি-কার্সার উৎপাদনে সহায়ক) |
| nodN | Function not clearly defined | সম্ভাব্যভাবে Nod ফ্যাক্টর সংশোধন বা রেগুলেশনে জড়িত |
| nodO | Calcium-binding protein | হোস্টের ক্যালসিয়াম সংকেত ব্যবস্থায় প্রতিক্রিয়া জানায় |
| nodP | Sulfate activation | Nod ফ্যাক্টরে সালফেশন চালু করার জন্য সালফেট এক্টিভেশন করে |
| nodQ | ATP sulfurylase subunit | সালফেট এক্টিভেশনে সহায়ক ATP সালফারাইলেজ এনজাইম গঠনে কাজ করে |
| nodR:-(nodR1 & nodR2) | Regulator protein & Transcriptional Repression | nod জিনের রেগুলেটরি ফ্যাক্টর হিসেবে কাজ করে |
| nodS | Methyltransferase | Nod ফ্যাক্টরের O-মিথাইলেশন করে |
| nodT | Efflux pump | Nod ফ্যাক্টরের স্রোত নিয়ন্ত্রণে সহায়ক |
| nodU | Carbamoyltransferase | Nod ফ্যাক্টরে কার্বাময়েল গ্রুপ যুক্ত করে |
| nodV | Sensor kinase | ফ্ল্যাভোনয়েড সংবেদন করে signal transduction pathway চালু করে |
| nodW | Response regulator | nodV এর সাথে জোড়ায় কাজ করে জিন অ্যাক্টিভেশন ঘটায় |
| nodX | Fucosylation | Nod ফ্যাক্টরের fucose যুক্ত করে (বিশেষত *Rhizobium leguminosarum* bv. *viciae* তে) |
| nodY | Hypothetical protein | বর্তমানে কাজ অস্পষ্ট, ধারণা করা হয় nodO সম্পর্কিত |
| nodZ | Fucosyltransferase | α-1,6-fucose যুক্ত করে Nod ফ্যাক্টরে হোস্ট নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে |
Noe (Nodulation Outer Envelope) জিনসমূহ
[সম্পাদনা]রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়ায় NoeA থেকে NoeZ পর্যন্ত বিভিন্ন জিন বিদ্যমান, যেগুলো নোড ফ্যাক্টরের গঠন ও সংশ্লেষণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। নিচে এই জিনসমূহের নাম ও কার্যপ্রণালী তালিকাভুক্ত করা হলো:
| জিনের নাম | কার্যপ্রণালী | সংশ্লিষ্ট ব্যাকটেরিয়া প্রজাতি |
|---|---|---|
| noeA | Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করে | Rhizobium leguminosarum |
| noeB | Nod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িত | Sinorhizobium meliloti |
| noeC | Nod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে | Bradyrhizobium japonicum |
| noeD | Nod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Mesorhizobium loti |
| noeE | Nod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করে | Rhizobium etli |
| noeF | Nod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Sinorhizobium fredii |
| noeG | Nod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িত | Bradyrhizobium elkanii |
| noeH | Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করে | Rhizobium tropici |
| noeI | Nod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে | Mesorhizobium ciceri |
| noeJ | Nod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Azorhizobium caulinodans |
| noeK | Nod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করে | Ensifer fredii |
| noeL | Nod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Rhizobium phaseoli |
| noeM | Nod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িত | Bradyrhizobium japonicum |
| noeN | Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করে | Sinorhizobium meliloti |
| noeO | Nod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে | Rhizobium leguminosarum |
| noeP | Nod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Mesorhizobium loti |
| noeQ | Nod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করে | Rhizobium etli |
| noeR | Nod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Sinorhizobium fredii |
| noeS | Nod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িত | Bradyrhizobium elkanii |
| noeT | Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করে | Rhizobium tropici |
| noeU | Nod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে | Mesorhizobium ciceri |
| noeV | Nod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Azorhizobium caulinodans |
| noeW | Nod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করে | Ensifer fredii |
| noeX | Nod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলে | Rhizobium phaseoli |
| noeY | Nod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িত | Bradyrhizobium japonicum |
| noeZ | Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করে | Sinorhizobium meliloti |
Nol জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]Nol (Nodulation Outer Layer) জিনসমূহ হল রাইজোবিয়াম প্রজাতির অতিরিক্ত জিন, যেগুলো nod জিনসমূহের পরিপূরক হিসেবে কাজ করে। এরা হোস্ট নির্দিষ্টতা, nod জিনের প্রকাশ, লাইপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ ও সংবেদনশীলতা বৃদ্ধিতে সহায়তা করে।
| জিনের নাম | প্রধান কার্যপ্রণালী | ব্যাখ্যা / মন্তব্য |
|---|---|---|
| NolA | ট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ | NodD-এর বিকল্প; ফ্ল্যাভোনয়েডে প্রতিক্রিয়াশীল nod জিনগুলোর নিয়ন্ত্রক |
| NolB | লিপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ | LPS পরিবর্তন করে হোস্ট প্রতিক্রিয়া কমায় |
| NolC | লিপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ | LPS biosynthesis pathway এ অংশগ্রহণ করে |
| NolD | সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন প্রোটিন | Nod সংকেত প্রক্রিয়াজাতকরণে সাহায্য করে |
| NolE | সেক্রেশন প্রোটিন | Nod ফ্যাক্টরের বহিঃনিঃসরণ (efflux) সম্পাদন করে |
| NolF | হোস্ট নির্দিষ্টতা | Nod ফ্যাক্টরের মডিফিকেশন করে নির্দিষ্ট উদ্ভিদের সঙ্গে সঙ্গতিপূর্ণ করে |
| NolG | অজানা / সন্দেহভাজন ফাংশন | এখনও বিশ্লেষণাধীন |
| NolH | ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন | Nod ফ্যাক্টর বা সংশ্লিষ্ট লিপিড বহিঃনিঃসরণে সাহায্য করে |
| NolI | ট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ | Nod / Nol pathway নিয়ন্ত্রণে জড়িত |
| NolJ | ট্রান্সক্রিপশন সহায়ক | Nod pathway-তে সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন সহায়ক |
| NolK | হোস্ট নির্দিষ্টতা সংশোধনকারী | স্পেসিফিক লেগিউমের Nod ফ্যাক্টর নির্ধারণে সাহায্য করে |
| NolL | সেক্রেশন সংশ্লিষ্ট প্রোটিন | Nod উপাদান বহিঃনিঃসরণ সহজতর করে |
| NolM | পরিবহন ও সংশ্লেষণ | অ্যানকিলোমাইসিনজাতীয় যৌগ সংশ্লেষণ |
| NolN | এনজাইম্যাটিক সংশ্লেষণ | Nod ফ্যাক্টরের চেইন মডিফাই করে |
| NolO | অজানা / গবেষণাধীন | তথ্য সীমিত |
| NolP | রেগুলেটরি প্রোটিন | Nod সিগন্যাল ও ফ্ল্যাভোনয়েড সংকেত মিলানে সাহায্য করে |
| NolQ | সিগন্যাল সংবেদনশীলতা | হোস্ট উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে অংশগ্রহণ |
| NolR | repressing regulator | NodD রেগুলেশন বন্ধ করে, যাতে বেশি nod gene না প্রকাশ পায় |
| NolS | অজানা / সন্দেহভাজন এনজাইম | আরও গবেষণার প্রয়োজন |
| NolT | ATP-binding কাসেট (ABC) ট্রান্সপোর্টার | Nod উপাদান পরিবহন |
| NolU | সেক্রেশন সিস্টেম প্রোটিন | Nod ফ্যাক্টর বহিঃনিঃসরণ |
| NolV | অজানা প্রোটিন | নতুনভাবে আবিষ্কৃত; কাজ নির্দিষ্ট নয় |
| NolW | হোস্ট নির্দিষ্টতা মডিফায়ার | Nod ফ্যাক্টরের সুনির্দিষ্টতা বাড়ায় |
| NolX | সিগন্যাল ফ্যাক্টর সংশ্লেষণ | Nod ফ্যাক্টরের কার্যকারিতা বৃদ্ধি করে |
| NolY | লাইপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ | ব্যাকটেরিয়াল পৃষ্ঠের গঠন উন্নত করে |
| NolZ | হোস্ট ইন্টারঅ্যাকশন সাপোর্টার | হোস্ট উদ্ভিদের অভ্যন্তরে সফল উপনিবেশ গঠনে সহায়তা |
Nop জিনসমূহ
[সম্পাদনা]রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়াগুলোর মধ্যে Nop (Nodulation outer proteins) এবং Nol (Nodulation locus) নামক জিনগুলো হোস্ট উদ্ভিদের সাথে যোগাযোগ স্থাপন, প্রতিক্রিয়া সৃষ্টি এবং সফল ইনফেকশন নিশ্চিতকরণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।
| জিন | পূর্ণরূপ/নাম | কাজ / কার্যপ্রণালী | মন্তব্য |
|---|---|---|---|
| NopA | Nodulation outer protein A | টাইপ III সিক্রেশন সিস্টেমের pilus গঠন করে | হোস্ট উদ্ভিদের সাথে সংযুক্তি ও সংকেত প্রেরণ |
| NopB | Nodulation outer protein B | টাইপ III সিস্টেম pilus-এ অংশগ্রহণকারী একাধিক রূপ | সংযুক্তির জন্য প্রোটিন রূপান্তর |
| NopC | Nodulation outer protein C | হোস্ট কোষে প্রবেশ করে জিন এক্সপ্রেশন প্রভাবিত করে | হোস্ট রেসপন্স সক্রিয় করে |
| NopD | Nodulation outer protein D | ইউবিকুইটিন লিগেস অ্যাক্টিভিটি সম্পন্ন effector | হোস্ট প্রতিরক্ষা হ্রাস করে |
| NopE | Nodulation outer protein E | ইনফেকশন ও নডিউল গঠনের সহায়ক | হোস্ট নির্ভর প্রতিক্রিয়া সৃষ্টি করে |
| NopF | Nodulation outer protein F | অজানা কার্যপ্রণালী | কিছু রাইজোবিয়ামে উপস্থিত |
| NopG | Nodulation outer protein G | হোস্টের মধ্যে সংক্রমণ ও সংশ্লেষ প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করে | পরিপূর্ণ ব্যাখ্যা অনুপস্থিত |
| NopH | Nodulation outer protein H | টাইপ III সিক্রেশন সিস্টেমের সহায়ক উপাদান | সিগন্যাল রেগুলেশন সম্পন্ন |
| NopI | Nodulation outer protein I | হোস্ট সেল ওয়ালে প্রভাব ফেলে | ইনফেকশন থ্রেড গঠনে অংশগ্রহণ |
| NopJ | Nodulation outer protein J | সেরিন প্রোটিজ অ্যাক্টিভিটি সম্পন্ন effector | হোস্ট প্রতিরক্ষা সংকেত দমন করে |
| NopL | Nodulation outer protein L | হোস্ট ম্যাপ কাইনেজ পথ প্রতিরোধ করে | ইমিউন প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে সহায়ক |
| NopM | Nodulation outer protein M | ইউবিকুইটিন E3 লিগেস কার্য সম্পন্ন করে | হোস্ট প্রতিরক্ষা দমন করে |
| NopP | Nodulation outer protein P | হোস্ট ফসফোরাইলেশন সাইটের সাথে সংশ্লেষ | হোস্ট নির্ভর nod কার্যক্রম প্রভাবিত |
| NopT | Nodulation outer protein T | সিরিন প্রোটেজ ও এক্সটেনশন এনজাইম হিসেবে কাজ করে | হোস্ট সেল মেমব্রেনে প্রভাব ফেলে |
| NopX | Nodulation outer protein X | টাইপ III সিক্রেশন সিস্টেমের পোর গঠন করে | প্রোটিন ইনজেকশন নিশ্চিত করে |
| NopZ | Nodulation outer protein Z | হোস্ট প্রোটিন কাটে (cysteine protease) | ইমিউন প্রতিক্রিয়া হ্রাস করে |
LPS সংশ্লিষ্ট জিনসমূহ (LpsA–LpsZ)
[সম্পাদনা]লাইপোপলিস্যাকারাইড (LPS) হলো রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার বাইরের পর্দার একটি গুরুত্বপূর্ণ উপাদান, যা নডিউল গঠনে গাছের সাথে সংযোগে সহায়তা করে। নিচে LpsA থেকে LpsZ পর্যন্ত জিনসমূহের তালিকা ও কার্যপ্রণালী দেয়া হলো:
| জিনের নাম | কার্যপ্রণালী/ফাংশন | শ্রেণিবিন্যাস |
|---|---|---|
| LpsA | O-antigen গঠন এবং LPS কোর শৃঙ্খলে চিনি সংযোজন | গ্লাইকোসিল ট্রান্সফারেজ |
| LpsB | কোর অলিগোস্যাকারাইড গঠনের জন্য প্রাথমিক চিনি সংযুক্তি | গ্লাইকোসিল ট্রান্সফারেজ |
| LpsC | র্যামনোজ (rhamnose) সংযোজনের জন্য দায়ী | চিনির পরিবাহী এনজাইম |
| LpsD | O-antigen পরিবহন ও বহির্মুখী স্থানান্তর | ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন |
| LpsE | কোর অঞ্চল সম্পূর্ণকরণে সহায়তা করে | অ্যানজাইমেটিক সংশ্লেষণ |
| LpsF | হাইড্রোফোবিক গঠন রক্ষণে ভূমিকা রাখে | ঝিল্লি-সম্পর্কিত প্রোটিন |
| LpsG | স্যালফেটেড চিনি যুক্ত করে যা হোস্ট নির্ধারণে ভূমিকা রাখে | স্যালফোট্রান্সফারেজ |
| LpsH | LPS biosynthesis pathway-এ মধ্যবর্তী পদার্থকে রূপান্তর করে | এনজাইম |
| LpsI | বহির্মুখী শৃঙ্খল তৈরির প্রাথমিক ধাপে যুক্ত | চিনির সংশ্লেষক |
| LpsJ | LPS কে স্থায়িত্ব প্রদান করে | স্ট্রাকচারাল প্রোটিন |
| LpsK | ঝিল্লি পারমিয়েজ ট্রান্সপোর্টারে অংশগ্রহণ করে | পরিবাহক প্রোটিন |
| LpsL | দীর্ঘ চেইনযুক্ত O-antigen সংশ্লেষে কাজ করে | পলিস্যাকারাইড সিনথেসিস |
| LpsM | বিশেষ শর্করা সংযোজন করে (উদাহরণস্বরূপ ফুকোজ) | চিনির সংশ্লেষক |
| LpsN | শিকড়ের ইমিউন প্রতিক্রিয়া এড়াতে সাহায্য করে | লিপিড সংশ্লেষক |
| LpsO | O-antigen পুনর্গঠন করে | পলিস্যাকারাইড সংশ্লেষক |
| LpsP | ঝিল্লি স্থিতিশীলতা রক্ষা করে | ঝিল্লি প্রোটিন |
| LpsQ | ক্যালসিয়াম-নির্ভর সংকেতের মাধ্যমে নিয়ন্ত্রণ | রেগুলেটরি প্রোটিন |
| LpsR | ট্রান্সক্রিপশন রেগুলেটর | নিয়ন্ত্রণ জিন |
| LpsS | সিগন্যাল রিসিভার হিসেবে কাজ করে | সিগন্যালিং প্রোটিন |
| LpsT | ট্রান্সপোর্টার হিসেবে কাজ করে | পরিবাহী প্রোটিন |
| LpsU | তাপমাত্রা বা পরিবেশগত চাপের প্রতিক্রিয়ায় সক্রিয় হয় | উত্তেজনা সাড়া প্রদানকারী জিন |
| LpsV | বহির্মুখী শৃঙ্খল প্রতিরক্ষা কাঠামো | পলিস্যাকারাইড প্রোটিন |
| LpsW | ওলিগোমার ফর্ম করে | স্ট্রাকচারাল উপাদান |
| LpsX | বাইরের আবরণ গঠনে সহায়তা করে | আবরণ সংশ্লেষক |
| LpsY | অ্যান্টিজেন উপস্থাপনে ভূমিকা রাখে | রিসেপ্টর সম্পর্কিত প্রোটিন |
| LpsZ | সম্পূর্ণ LPS biosynthesis pathway এর শেষ ধাপে কাজ করে | টার্মিনাল এনজাইম |
Nol জিনসমূহ (NolR থেকে NolZ)
[সম্পাদনা]ডায়াজোট্রোফিক নডিউল অর্গানোজেনেসিস প্রক্রিয়ায় কিছু Nol (nodulation-related) জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে। এগুলি সাধারণত রাইজোবিয়াম প্রজাতির জিনোম বা প্লাসমিডে থাকে এবং নডিউল গঠনের সময় বিশেষত Nod ফ্যাক্টর সংশ্লেষণ, নিয়ন্ত্রণ ও হোস্ট-ব্যাকটেরিয়া মিথষ্ক্রিয়ায় কাজ করে।
| জিনের নাম | প্রজাতি (উদাহরণস্বরূপ) | প্রধান কাজ / ফাংশন |
|---|---|---|
| NolR | Rhizobium leguminosarum, Sinorhizobium meliloti | Nod জিন ট্রান্সক্রিপশন রেপ্রেসর; NodD দ্বারা সক্রিয়করণকে দমন করে, Nod ফ্যাক্টর উৎপাদন নিয়ন্ত্রণ করে |
| NolA | Bradyrhizobium japonicum | ট্রান্সক্রিপশন অ্যাক্টিভেটর, nodD2 ও nodW নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রাখে; হোস্ট-নির্দিষ্ট প্রতিক্রিয়ায় জড়িত |
| NolB | Bradyrhizobium spp. | সম্ভাব্য এক্সোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ বা পরিবহন সংশ্লিষ্ট; এখনও বিস্তারিতভাবে অনিশ্চিত |
| NolC | Bradyrhizobium japonicum | প্রোটিন পরিবহন বা LPS সংশ্লেষণে সম্ভাব্য ভূমিকা |
| NolD | Bradyrhizobium japonicum | Nod ফ্যাক্টর সংশ্লেষণে জড়িত এনজাইম; হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে ভূমিকা |
| NolE | Bradyrhizobium japonicum | LPS সংশ্লেষণে অংশগ্রহণ করে; নডিউল সংক্রমণে সহায়তা করে |
| NolF | Bradyrhizobium spp. | LCO গঠন বা সংশ্লেষণে সম্ভাব্য ভূমিকা; বিস্তারিত অজানা |
| NolG | Bradyrhizobium japonicum | সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন সংশ্লিষ্ট |
| NolH | Bradyrhizobium spp. | Nod ফ্যাক্টরের গ্লাইকোসাইলেশন বা এক্সটেনশন মডিফিকেশন |
| NolI | Bradyrhizobium japonicum | Nod ফ্যাক্টরের গঠন পরিবর্তনে ভূমিকা |
| NolJ | Bradyrhizobium spp. | হোস্ট নির্দিষ্টতা ও Nod ফ্যাক্টর পরিবহণ সংশ্লিষ্ট |
| NolK | Rhizobium spp. | Nod ফ্যাক্টর পরিবহন ও মডিফিকেশন |
| NolL | Bradyrhizobium spp. | এনজাইম মডিফায়ার হিসেবে কাজ করে |
| NolN | Bradyrhizobium japonicum | Nod ফ্যাক্টর পরিবহন ও এক্সটেনশন |
| NolO | Rhizobium spp. | এক্সোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণে জড়িত |
| NolT | Bradyrhizobium spp. | ফ্যাক্টর পরিবহন; সংক্রমণ ফিলামেন্টে ভূমিকা |
| NolU | Bradyrhizobium spp. | Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট রূপান্তর বা পরিবহন |
| NolV | Bradyrhizobium spp. | হোস্ট নির্দিষ্ট পরিবেশে গঠনীয় পরিবর্তন আনে |
| NolW | Bradyrhizobium spp. | বায়োকেমিক্যাল রেগুলেটরি ভূমিকা পালন করে |
| NolX | Bradyrhizobium japonicum | Nod ফ্যাক্টর পরিবহনে অংশগ্রহণ |
| NolY | Bradyrhizobium spp. | হোস্ট নির্দিষ্ট সংকেত আদান-প্রদান সংক্রান্ত |
| NolZ | Bradyrhizobium spp. | সংশ্লেষণ উপশমকারী প্রোটিন বা এনজাইম |
EPS সংশ্লিষ্ট জিনসমূহ (EpsA - EpsZ)
[সম্পাদনা]Rhizobium প্রজাতির ব্যাকটেরিয়াগুলোর বহিঃকোষীয় পলিস্যাকারাইড (EPS) সংশ্লেষণ ও নির্গমনে EpsA থেকে EpsZ পর্যন্ত বিভিন্ন জিন জড়িত। এই বহিঃকোষীয় উপাদান উদ্ভিদের শিকড়ে সংযুক্তি, ইনফেকশন থ্রেড গঠন ও নডিউল অর্গানোজেনেসিসে সহায়তা করে।
| জিনের নাম | কাজ/ফাংশন |
|---|---|
| EpsA | ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটর, eps জিন অপেরন নিয়ন্ত্রণ করে |
| EpsB | ফসফোরাইলেশনযুক্ত রেগুলেটরি প্রোটিন; EpsA-এর সাথে কাজ করে |
| EpsC | সাইটোপ্লাজমিক গ্লাইকোসাইল ট্রান্সফারেজ; মূল কাঠামো নির্মাণে জড়িত |
| EpsD | মেমব্রেন-বাউন্ড ট্রান্সফারেজ, লিপিড লিংকেজে সহায়তা করে |
| EpsE | এক্সোপলিস্যাকারাইড এক্সপোর্টে সহায়তাকারী |
| EpsF | রিপিটার ইউনিটে শাখা যুক্ত করে |
| EpsG | মেমব্রেন চ্যানেল প্রোটিন (Wzx টাইপ ফ্লিপেজ) |
| EpsH | পলিস্যাকারাইড সাবইউনিট পলিমারাইজ করে |
| EpsI | পলিমার চেইনের দৈর্ঘ্য নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রাখে |
| EpsJ | বহিঃনির্গমন প্রোটিন, বহিঃপ্রকাশ নিশ্চিত করে |
| EpsK | সুগার মডিফাইং এনজাইম |
| EpsL | গ্লাইকোসিড লিংক তৈরি করে |
| EpsM | মেমব্রেন সংলগ্ন ট্রান্সপোর্ট সিস্টেম |
| EpsN | এক্সপোর্ট সিগন্যাল শনাক্তকরণে কাজ করে |
| EpsO | পলিস্যাকারাইড প্রক্রিয়াকরণ এনজাইম |
| EpsP | বহিঃপ্রকাশ কমপ্লেক্সের অংশ |
| EpsQ | গ্লাইকান সাইক্লিং প্রোটিন |
| EpsR | ট্রান্সক্রিপশনাল রিপ্রেসার |
| EpsS | পরিবেশগত সংকেত শনাক্তকারী সেন্সর কাইনেজ |
| EpsT | ATP-binding ক্যাসেট প্রোটিন (ABC Transporter) |
| EpsU | বহিঃচাপ শনাক্তকারী এনজাইম |
| EpsV | শৃঙ্খলা নির্ধারক প্রোটিন |
| EpsW | পলিস্যাকারাইড বাইন্ডিং ডোমেইন |
| EpsX | বহিঃপ্রকাশ চ্যানেল প্রোটিন |
| EpsY | স্ট্রাকচারাল স্ট্যাবিলাইজার |
| EpsZ | সর্বশেষ ধাপে পলিমার এক্সপোর্টে সহায়তাকারী |
Exo (ExoA–ExoZ) জিনসমূহ ও কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]Sinorhizobium meliloti এবং অন্যান্য Rhizobium প্রজাতিতে, **ExoA থেকে ExoZ পর্যন্ত জিনসমূহ** এক্সোপলিস্যাকারাইড (EPS I বা succinoglycan) সংশ্লেষণের জন্য দায়ী, যা নডিউল অর্গানোজেনেসিস ও ইনফেকশন থ্রেড গঠনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।
| জিনের নাম | কাজের বর্ণনা |
|---|---|
| ExoA | UDP-গ্লুকোজ ডিহাইড্রোজেনেজ – প্রাথমিকভাবে শর্করার অ্যাক্টিভেশন ঘটায় |
| ExoB | গ্যালাক্টোজ মিউটেজ – EPS মনোমার শর্করার পরিবর্তন ঘটায় |
| ExoC | গ্লুকোজ-১-ফসফেট ইউরিডাইল ট্রান্সফারেজ – UDP-glucose সংশ্লেষণ করে |
| ExoD | সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক প্রোটিন – EPS সংশ্লেষণের ওপর প্রভাব ফেলে |
| ExoE | পলিস্যাকারাইড শৃঙ্খল বৃদ্ধিতে অংশগ্রহণকারী এনজাইম |
| ExoF | সাইক্লিক বা শাখাবিশিষ্ট EPS গঠন নিয়ন্ত্রণ করে |
| ExoG | এক্সোপলিস্যাকারাইড পরিবহন সংশ্লিষ্ট প্রোটিন |
| ExoH | এক্সোপলিস্যাকারাইডের অ্যাসিটাইলেশন এনজাইম |
| ExoI | Glycosyl transferase – মনোমার যোগ করে |
| ExoJ | Glycosyl transferase – বিশেষ করে গ্যালাক্টোজ সংযুক্ত করে |
| ExoK | এক্সোপলিস্যাকারাইড ডিগ্রেডেশন এনজাইম – EPS এর দৈর্ঘ্য নিয়ন্ত্রণ করে |
| ExoL | স্থানান্তর সংশ্লিষ্ট প্রোটিন |
| ExoM | মূল EPS কোর গঠন করে |
| ExoN | গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড যুক্ত করে EPS শৃঙ্খলে |
| ExoO | স্থানান্তর ও বহির্গমন সংশ্লিষ্ট |
| ExoP | সেক্রেশন কমপ্লেক্সের অংশ |
| ExoQ | লিপিড আংটিতে সংযুক্তি ঘটাতে সাহায্য করে |
| ExoR | নিয়ন্ত্রণকারী প্রোটিন – EPS সংশ্লেষণকে উপনিয়ন্ত্রিত করে |
| ExoS | সেন্সর কাইনেজ – রেগুলেটরি সিস্টেমে অংশগ্রহণ করে |
| ExoT | সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন |
| ExoU | অ্যান্টিজেনিক নির্ধারক |
| ExoV | সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন সংশ্লিষ্ট |
| ExoW | রেজিস্ট্রি ও সিগন্যালিং মডুলে কাজ করে |
| ExoX | অজানা কার্যসম্পন্ন (সম্ভবত রেগুলেটরি) |
| ExoY | গ্লাইকান সুনির্দিষ্ট এনজাইম |
| ExoZ | সুনির্দিষ্ট ফাংশন অজ্ঞাত, তবে EPS সংশ্লেষণে অংশ নিতে পারে |
PraA to PraZ জিনসমূহ
[সম্পাদনা]ডায়াজোট্রোফিক নডিউল অর্গানোজেনেসিসে, **PraA থেকে PraZ** পর্যন্ত বিভিন্ন জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এই জিনগুলো সাধারণত **Rhizobium** প্রজাতির ব্যাকটেরিয়াগুলির মধ্যে নাইট্রোজেন স্থিরীকরণের প্রক্রিয়াকে নিয়ন্ত্রণ করে। নীচে প্রতিটি জিনের নাম, ফাংশন এবং কাজের প্রণালী দেওয়া হলো:
| ক্রমিক | জিনের নাম | ফাংশন | কাজের প্রণালী |
|---|---|---|---|
| ১ | **PraA** | প্রোটিন কোয়ালিটি কন্ট্রোল এবং এনজাইম সংশ্লেষণ | এটি রাইজোবিয়াম প্রজাতির মধ্যে প্রোটিনের সঠিক গঠন নিশ্চিত করতে সাহায্য করে। |
| ২ | **PraB** | প্রোটিন অঙ্গবিন্যাস নিয়ন্ত্রণ | প্রোটিনগুলোর সঠিক মলিকুলার গঠন নিশ্চিত করে, যাতে তারা তাদের নির্দিষ্ট কাজ সঠিকভাবে করতে পারে। |
| ৩ | **PraC** | রিজোলাইট প্রস্তুতির জন্য গুরুত্বপূর্ণ | এটি রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া নডিউল গঠনের জন্য সাহায্য করে এবং নোড ফ্যাক্টর উৎপাদন নিয়ন্ত্রণ করে। |
| ৪ | **PraD** | সেলুলার বিভাজন এবং স্কেলিং নিয়ন্ত্রণ | এটি সেলুলার বিভাজন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে সাহায্য করে, যা নডিউল গঠন এবং শিকড়ে ব্যাকটেরিয়া ইনফেকশন বৃদ্ধি করতে সহায়ক। |
| ৫ | **PraE** | পদার্থের পরিবহন নিয়ন্ত্রণ | এটি বিভিন্ন পদার্থের পরিবহন নিয়ন্ত্রণে সহায়ক এবং এনার্জি স্থানান্তরের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। |
| ৬ | **PraF** | নাইট্রোজেন স্থিরীকরণ সাহায্যকারী এনজাইম প্রোটিন | এটি নাইট্রোজেন স্থিরীকরণে ব্যবহৃত নাইট্রোজেনেজ এনজাইমের সংশ্লেষণে সাহায্য করে। |
| ৭ | **PraG** | হোস্ট নির্দিষ্টতা নিয়ন্ত্রণ | এটি ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদের শিকড়ে প্রবেশ করতে সাহায্য করে এবং এনজাইমের সক্রিয়করণের মাধ্যমে ইনফেকশন থ্রেড গঠন পরিচালনা করে। |
| ৮ | **PraH** | লিপিড সাইথেসিস এবং গ্র্যাম-নেগেটিভ প্রোটিন | এটি ব্যাকটেরিয়া কোষের ভেতরে গঠন এবং পারমিয়াবিলিটি নিয়ন্ত্রণে সাহায্য করে। |
| ৯ | **PraI** | নডিউল গঠন পরবর্তী পর্যায়ে গুরুত্বপূর্ণ প্রোটিন | এটি নডিউল গঠনের পরবর্তী পর্যায়ে, বিশেষভাবে ব্যাকটেরিয়ার জীবনচক্রের জন্য গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে। |
| ১০ | **PraJ** | ব্যাকটেরিয়া শিকড়ে প্রবেশের জন্য সহায়ক প্রোটিন | এটি ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদের শিকড়ে প্রবেশ করার জন্য সাহায্য করে এবং ইনফেকশন থ্রেড গঠন করতে সহায়ক। |
| ১১ | **PraK** | সেলুলার কোষমembrane সন্নিবেশ ও অনুপ্রবেশ প্রক্রিয়া | এটি সেলুলার কোষের মেমব্রেনের সংমিশ্রণ নিয়ন্ত্রণ করে এবং কোষের অনুপ্রবেশ প্রক্রিয়া সহায়ক হয়। |
| ১২ | **PraL** | পিপিডি (পেপটাইড) ফ্যাক্টর সংশ্লেষণ | এটি পিপিডি নামক ফ্যাক্টর সংশ্লেষণের জন্য প্রয়োজনীয় এবং নডিউল গঠন প্রক্রিয়া সহায়ক। |
| ১৩ | **PraM** | মেটাবলিক প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ | এটি ব্যাকটেরিয়া কোষের শক্তির উৎপাদন ও স্থানান্তর নিয়ন্ত্রণ করে, যা ব্যাকটেরিয়া ইনফেকশন গঠনের জন্য প্রয়োজনীয়। |
| ১৪ | **PraN** | এনজাইম নিয়ন্ত্রণ এবং প্রোটিন সংযোজন | এটি এনজাইম এবং প্রোটিনের গঠন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ করে, যা নাইট্রোজেন স্থিরীকরণের প্রক্রিয়ায় সহায়ক। |
| ১৫ | **PraO** | কোষীয় প্রবাহ নিয়ন্ত্রণ | এটি কোষের অভ্যন্তরে প্রবাহ নিয়ন্ত্রণ করে, যার মাধ্যমে ব্যাকটেরিয়া বিভিন্ন স্তরের কার্যক্রম পরিচালনা করতে পারে। |
| ১৬ | **PraP** | লিপিড সংশ্লেষণ সহায়ক প্রোটিন | এটি লিপিড সংশ্লেষণ প্রক্রিয়ায় সহায়ক, যা ব্যাকটেরিয়ার কোষের স্ট্রাকচার গঠন করে। |
| ১৭ | **PraQ** | এনজাইম সংশ্লেষণ নিয়ন্ত্রণ | এটি বিভিন্ন এনজাইমের সংশ্লেষণ নিয়ন্ত্রণ করে, যা নডিউল গঠনে গুরুত্বপূর্ণ। |
| ১৮ | **PraR** | নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের জন্য প্রয়োজনীয় | এটি নাইট্রোজেন ফিক্সেশন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। |
| ১৯ | **PraS** | পরিবেশগত সংকেত সনাক্তকরণ এবং রিসেপ্টর | এটি পরিবেশের সংকেত সনাক্ত করে, যা ব্যাকটেরিয়া শিকড়ে প্রবেশের সময় প্রয়োজন। |
| ২০ | **PraT** | সংক্রমণ থ্রেড গঠন প্রক্রিয়া | এটি সংক্রমণ থ্রেড গঠন করতে সাহায্য করে, যা ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদ কোষে প্রবেশ করতে সক্ষম করে। |
| ২১ | **PraU** | সেলুলার বৃদ্ধি নিয়ন্ত্রণ | এটি কোষের বৃদ্ধি এবং বিভাজন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে সহায়ক। |
| ২২ | **PraV** | শিকড়ে ইনফেকশন থ্রেডের গঠন ও সম্প্রসারণ | এটি শিকড়ে ইনফেকশন থ্রেড গঠন ও তার সম্প্রসারণে সহায়ক। |
| ২৩ | **PraW** | পরিবহন সিস্টেম নিয়ন্ত্রণ | এটি ব্যাকটেরিয়া কোষের মাধ্যমে পদার্থ পরিবহন নিয়ন্ত্রণে সাহায্য করে। |
| ২৪ | **PraX** | কোষের স্থিতিশীলতা নিয়ন্ত্রণ | এটি কোষের স্থিতিশীলতা বজায় রাখে এবং সঠিকভাবে বিভাজন করতে সহায়ক। |
| ২৫ | **PraY** | প্রোটিন ফোল্ডিং এবং কোষীয় পরিবেশের জন্য উপযুক্ত | এটি কোষের অভ্যন্তরীণ প্রোটিন গঠনের প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ করে। |
| ২৬ | **PraZ** | কোষীয় সংকেত সৃষ্টির জন্য প্রয়োজনীয় | এটি কোষের সংকেত সৃষ্টি প্রক্রিয়া এবং ফাংশনালাইজেশনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে। |
Rhizobium প্রজাতিতে Allantoin catabolism সংশ্লিষ্ট জিনসমূহ
[সম্পাদনা]| জিনের নাম | এনজাইমের নাম | ফাংশন / রাসায়নিক রূপান্তর | ধারক প্রজাতি |
|---|---|---|---|
| allA | Ureidoglycolate urea-lyase | Ureidoglycolate → Glyoxylate + Urea | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allB | Allantoinase | Allantoin → Allantoate | Rhizobium leguminosarum bv. trifolii (strain WSM1325) |
| allC (সম্ভাব্য) | Allantoate amidohydrolase | Allantoate → Ureidoglycine + NH₃ | Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841) |
| allD | Allantoate amidohydrolase | Allantoate → Ureidoglycine + NH₃ | Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841) |
| allE | Ureidoglycine aminohydrolase | Ureidoglycine → Ureidoglycolate + NH₃ | Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841) |
| allF | Ureidoglycolate amidohydrolase | Ureidoglycolate → Glyoxylate + NH₃ | Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841) |
| allG | Ureidoglycolate urea-lyase | Ureidoglycolate → Glyoxylate + Urea | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allH | Glyoxylate reductase | Glyoxylate → Glycolate | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allI | Urease | Urea → 2 NH₃ + CO₂ | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allJ | Urea transporter | Urea পরিবহন কোষে | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allK | Allantoin permease | Allantoin পরিবহন কোষে | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allL | Allantoate transporter | Allantoate পরিবহন কোষে | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allM | Ureidoglycine transporter | Ureidoglycine পরিবহন কোষে | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allN | Ureidoglycolate transporter | Ureidoglycolate পরিবহন কোষে | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allO | Glyoxylate transporter | Glyoxylate পরিবহন কোষে | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allP | Glycolate oxidase | Glycolate → Glyoxylate + H₂O₂ | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allQ | Transcriptional regulator (AllR) | Allantoin catabolism জিনসমূহের নিয়ন্ত্রণ | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allR | Transcriptional regulator (AllS) | Allantoin catabolism জিনসমূহের নিয়ন্ত্রণ | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allS | Transcriptional regulator | Allantoin catabolism pathway নিয়ন্ত্রণ | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allT | Hypothetical protein | সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক ভূমিকা | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allU | Hypothetical protein | সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allV | Hypothetical protein | সম্ভাব্য এনজাইমেটিক ভূমিকা | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allW | Hypothetical protein | সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allX | Hypothetical protein | সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক ভূমিকা | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allY | Hypothetical protein | সম্ভাব্য এনজাইমেটিক ভূমিকা | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
| allZ | Hypothetical protein | সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন | Rhizobium etli (strain ATCC 51251) |
ygeA-ygeZ জিনসমূহের তালিকা ও কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]| জিনের নাম | পরিচিত কার্যপ্রণালী (অন্যান্য ব্যাকটেরিয়ায়) |
|---|---|
| ygeA | L- ও D-homoserine বিপাকের সাথে জড়িত একটি অ্যামাইনো অ্যাসিড রেসেমেজ; *E. coli* তে বায়োফিল্ম গঠনে ভূমিকা রাখে। |
| ygeB | ygeB একটি এনজাইম যা কোএনজাইম A এর সাথে সম্পর্কিত এবং পেন্টোজ ফসফেট রুটে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এটি সেলুলোজের বিপাককে সমর্থন করে এবং ব্যাকটেরিয়ার বৃদ্ধি ও উন্নয়নে সহায়ক। |
| ygeC | ygeC একাধিক বায়োফিল্ম গঠন প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে। এটি কোষের বাইরের স্তরে কাজ করে এবং বিভিন্ন পরিবেশে জীবিত থাকতে সহায়ক ভূমিকা পালন করে। |
| ygeD | ygeD ব্যাকটেরিয়াল কেলোলোসিস বা কোষের মধ্যে ক্যালসিয়াম শোষণের প্রক্রিয়ায় যুক্ত। এটি সেলুলোজ সমৃদ্ধ খাদ্যসূত্রের প্রতি প্রতিক্রিয়া দেখায়। |
| ygeE | ygeE একটি ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন যা জীবাণু কোষের আয়নাগুলি প্রবাহিত করতে সাহায্য করে, বিশেষত আয়নাগুলির বিপাকের জন্য ব্যবহৃত। |
| ygeF | ygeF একাধিক শারীরিক প্রতিক্রিয়া নির্ণয়ে সহায়ক ভূমিকা পালন করে, বিশেষ করে কোষের অভ্যন্তরে শর্করা শক্তি সঞ্চয়ের জন্য। |
| ygeG | ygeG ক্যালসিয়াম আয়নাসহ মেটাল আয়নাগুলির পরিবহন প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ। এটি জীবাণু কোষের বৃদ্ধি সমর্থন করতে সহায়ক। |
| ygeH | ygeH গ্লাইকোলাইসিসের সঙ্গে সম্পর্কিত, এবং এটি ব্যাকটেরিয়ার এনার্জি বিপাক প্রক্রিয়াতে অংশগ্রহণ করে। |
| ygeI | ygeI একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিয়ার মেমব্রেন স্ট্রাকচার সঠিক রাখতে সহায়ক। এটি বায়োফিল্ম গঠন প্রক্রিয়ায় অবদান রাখে। |
| ygeJ | ygeJ ডিএনএ রিপ্লিকেশন এবং রিকম্বিনেশন প্রক্রিয়ায় ভূমিকা রাখে এবং সেলুলোজ উৎপাদনের জন্য গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে। |
| ygeK | ygeK ব্যাকটেরিয়ার সেলুলোজ প্রোটিন স্তরের সমন্বয় করতে সহায়ক ভূমিকা রাখে, এবং এটি শর্করা বিপাকের জন্য গুরুত্বপূর্ণ। |
| ygeL | ygeL হল একটি ক্যালসিয়াম সক্রিয় ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন, যা ব্যাকটেরিয়ার বৃদ্ধির জন্য প্রয়োজনীয় মিনারেলগুলি পরিবহনে সহায়ক। |
| ygeM | ygeM গ্লাইকোলাইটিক প্রবাহের নিয়ন্ত্রণ করতে সহায়ক একটি প্রোটিন, যা কোষে শক্তি সরবরাহের জন্য ব্যবহৃত হয়। |
| ygeN | ygeN একটি ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন যা আয়নাগুলির শোষণ এবং সেলুলোজ উৎপাদনের প্রক্রিয়াতে সহায়ক। |
| ygeO | ygeO কোষের বাইরের শর্করা প্রতিক্রিয়া নিশ্চিত করতে সহায়ক এবং কোষের উন্নয়নে ভূমিকা রাখে। |
| ygeP | ygeP গ্লাইকোলাইসিসের সাথে সম্পর্কিত এবং এনার্জি প্রবাহের সমন্বয়ে ভূমিকা রাখে। |
| ygeQ | ygeQ কোষের মেমব্রেনে শক্তির পরিমাপের জন্য ব্যবহৃত হয় এবং মাইক্রোবিয়াল জীবনের জন্য অপরিহার্য। |
| ygeR | ygeR ব্যাকটেরিয়া কোষের চাপ সহনশীলতার উন্নতির জন্য গুরুত্বপূর্ণ একটি প্রোটিন। |
| ygeS | ygeS একটি গুরুত্বপূর্ণ কোষীয় প্রোটিন, যা জীবাণু কোষের জীবিত থাকাকে দীর্ঘস্থায়ী করতে সহায়ক। |
| ygeT | ygeT প্রোটিন টপোলজির সঠিক নিয়ন্ত্রণ নিশ্চিত করতে সহায়ক। |
| ygeU | ygeU কোষের কোয়ালিটি নিয়ন্ত্রণ এবং মেমব্রেনের পরিবহন ব্যবস্থার জন্য গুরুত্বপূর্ণ। |
| ygeV | ygeV ব্যাকটেরিয়া মেমব্রেনের পরিবর্তন এবং শক্তি পুনরায় সৃষ্টি নিশ্চিত করে। |
| ygeW | *E. coli* তে ক্যাটাবলিক প্রক্রিয়ায় জড়িত; ATP উৎপাদনে ভূমিকা রাখে। |
| ygeX | ygeX কোষীয় শক্তির অগ্রগতি এবং বিপাকীয় ভারসাম্যকে সমর্থন করে। |
| ygeY | ygeY একটি ব্যাকটেরিয়া কোষের গঠন পরিবর্তন এবং বায়োফিল্ম গঠন প্রক্রিয়ায় ভূমিকা রাখে। |
| ygeZ | ygeZ কোষের জীবিত থাকার জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ প্রোটিন। |
arcA থেকে arcD পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]| জিন | সংশ্লিষ্ট এনজাইম | কার্যপ্রণালী | মন্তব্য |
|---|---|---|---|
| arcA | আর্জিনিন ডিইমিনেজ | আর্জিনিনকে সাইট্রুলিন ও অ্যামোনিয়াতে রূপান্তর করে | অক্সিজেন-নিম্ন পরিবেশে সক্রিয়; arcA-র অভাবে নাইট্রোজেন স্থিরীকরণ কমে যায় |
| arcB | ক্যাটাবলিক অর্নিথিন কার্বাময়েলট্রান্সফারেজ (cOTCase) | সাইট্রুলিনকে অর্নিথিন ও কার্বাময়েল ফসফেটে রূপান্তর করে | arcA-র অভাবে cOTCase কার্যকারিতা হ্রাস পায় |
| arcC | কার্বামেট কিনেজ | কার্বাময়েল ফসফেটকে অ্যামোনিয়া ও CO₂-এ রূপান্তর করে ATP উৎপাদন করে | arcC প্রোটিনের আকার ~৩৪ কিলোডালটন; কার্যপ্রণালী Pseudomonas aeruginosa-এর অনুরূপ |
| arcD | আর্জিনিন/অর্নিথিন এক্সচেঞ্জার | আর্জিনিন ও অর্নিথিনের মধ্যে ইলেকট্রোনিউট্রাল বিনিময় সম্পন্ন করে | শক্তি রূপান্তরে সহায়তা করে; ArcD প্রোটিন একটি বহুপাস ঝিল্লি প্রোটিন |
GltA থেকে GltZ পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যাবলি
[সম্পাদনা]GltA থেকে GltZ পর্যন্ত বিভিন্ন জিন TCA চক্র ও অ্যামাইনো অ্যাসিড সংশ্লেষণ প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে, বিশেষ করে নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময়। নিচে প্রতিটি জিনের নাম ও ফাংশন উল্লেখ করা হলো:
- GltA – সাইট্রেট সিনথেজ: অ্যাসিটাইল-CoA ও অক্সালোঅ্যাসেটেটের বিক্রিয়ার মাধ্যমে সাইট্রেট তৈরি করে।
- GltB – গ্লুটামিন সিনথেটেজের বড় সাবউনিট: অ্যামোনিয়া থেকে গ্লুটামিন তৈরিতে সহায়তা করে।
- GltC – গ্লুটামিন সিনথেটেজ নিয়ন্ত্রক প্রোটিন: gltAB অপারনের ট্র্যান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ করে।
- GltD – গ্লুটামেট সিঙ্কথেজের ছোট সাবইউনিট: গ্লুটামিন থেকে গ্লুটামেট তৈরি করে NADPH এর সহায়তায়।
- GltF – সংশ্লিষ্ট প্রোটিন, তবে অনেক সময় এটি ছদ্মজিন হিসেবে বিবেচিত হয়; কার্যকারিতা এখনও অস্পষ্ট।
- GltG – ABC পরিবাহক সিস্টেমের ATP-বাইন্ডিং সাবইউনিট: অ্যামিনো অ্যাসিড পরিবহনে জড়িত।
- GltH – ABC পরিবাহক সিস্টেমের পারমিয়েজ সাবউনিট: গ্লুটামেট পরিবহনের জন্য ঝিল্লিতে ছিদ্র সৃষ্টি করে।
- GltI – গ্লুটামেট/অ্যাস্পার্টেট পরিবাহক প্রোটিনের পেরিপ্ল্যাজমিক লিগ্যান্ড-বাইন্ডিং সাবইউনিট।
- GltJ – একই ABC পরিবহন ব্যবস্থার অংশ: গ্লুটামেট পরিবহনে সহায়তা করে।
- GltK – পরিবহন ব্যবস্থার সমন্বয়ক সাবইউনিট: পরিবহন কাঠামোর স্থায়িত্ব বজায় রাখে।
- GltL – গ্লুটামেট সংশ্লেষণের সহায়ক প্রোটিন: পরিবাহক এনজাইমের কার্যকারিতা উন্নত করে।
- GltM – পরিবাহী প্রোটিন কমপ্লেক্সের সহায়ক উপাদান হিসেবে কাজ করে।
- GltS – সোডিয়াম-সামঞ্জস্যপূর্ণ গ্লুটামেট/অ্যাস্পার্টেট পরিবাহক, কো-ট্রান্সপোর্ট সিস্টেমে অংশগ্রহণ করে।
- GltT – পরিবাহক সিস্টেমের সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক উপাদান।
- GltX – গ্লুটামেট-টিআরএনএ লাইগেজ: গ্লুটামেটকে tRNA(Glu)-এর সঙ্গে যুক্ত করে।
- GltZ – অনিশ্চিত কার্যকারিতা; কিছু ক্ষেত্রে এটি ছদ্মজিন হিসেবে পরিগণিত হয়, তবে গ্লুটামেট সংশ্লেষণ ব্যবস্থায় সংশ্লিষ্ট বলে ধারণা করা হয়।
AcnA থেকে AcnZ পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]| জিন | সংশ্লিষ্ট এনজাইম | কার্যপ্রণালী | মন্তব্য |
|---|---|---|---|
| acnA | আকোনিটেজ A | সাইট্রেটকে আইসোসাইট্রেটে রূপান্তর করে (reversible) | আয়রন সালফার ক্লাস্টারযুক্ত এনজাইম; TCA চক্রে গুরুত্বপূর্ণ |
| acnB | আকেোনিটেজ B | একইভাবে সাইট্রেটকে আইসোসাইট্রেটে রূপান্তর করে | পরিবেশভেদে acnA/acnB একে অপরকে পরিপূরকভাবে কাজ করে |
| acnC | ফার্মাকোলজিক্যাল কার্যকারিতার জন্য চিন্হিত (কমন নয়) | সম্ভবত অক্সিডেটিভ স্ট্রেসে অপ্রত্যক্ষ ভূমিকা পালন করে | Rhizobium-এ প্রকাশ খুব সীমিত; গবেষণার অধীন |
| acnD | হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন | TCA চক্র বা সংশ্লিষ্ট বিপাকীয় পথে সম্ভাব্য ভূমিকা | বর্তমানে অনির্দিষ্ট কার্যপ্রণালী; জিনোম প্রেডিকশনের মাধ্যমে শনাক্ত |
| acnE | TCA সহায়ক ফ্যাক্টর E | আকেোনিটেজের কার্যকারিতায় সহায়তা করে | Cofactor হিসেবে কাজ করতে পারে; Escherichia coli-তে গবেষণা হয়েছে |
| acnF | আয়রন-সালফার ক্লাস্টার সংশ্লেষ প্রোটিন | আকেোনিটেজে Fe-S ক্লাস্টার স্থাপন ও রক্ষণাবেক্ষণে সহায়তা করে | নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময় Fe-S প্রোটিনগুলো গুরুত্বপূর্ণ |
| acnG | হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন | সম্ভবত আকেোনিটেজ সংশ্লিষ্ট কোনো উপ-একক বা সহায়ক ফ্যাক্টর | গবেষণাধীন; কিছু প্রজাতিতে TCA চক্র সহায়ক হিসেবে উল্লেখ আছে |
| acnH | অক্সোগ্লুটারেট ডিকার্বক্সিলেজ সংশ্লিষ্ট প্রোটিন | TCA বাইপাসে সংশ্লিষ্ট ভূমিকা পালন করতে পারে | বিভিন্ন Rhizobium প্রজাতির জিনোমে অনুজ্ঞাত |
| acnI | ফিউমারেট সংশ্লিষ্ট প্রোটিন | TCA চক্রে ফিউমারেট-সংশ্লিষ্ট এনজাইমগুলোর সহায়তায় কাজ করতে পারে | সেকেন্ডারি মেটাবোলাইট নিয়ন্ত্রণেও ভূমিকা থাকতে পারে |
| acnJ | আয়রন সালফার প্রোটিন সংশ্লিষ্ট | আকেোনিটেজে Fe-S ক্লাস্টার ইনসার্শনে ভূমিকা | নাইট্রোজেন ফিক্সেশনে এই ধরণের প্রোটিন গুরুত্বপূর্ণ |
| acnK | রিডাক্টেজ/অক্সিডোরিডাক্টেজ ধরনের প্রোটিন | TCA চক্রে NADH/NAD+ ভারসাম্য বজায় রাখতে সহায়তা করে | শক্তি বিপাক ও ইলেকট্রন পরিবহণ চেইনের সাথে সম্পর্কিত |
| acnL | হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন | সম্ভাব্যভাবে TCA চক্রের সহায়ক বিপাকপথে ভূমিকা | গবেষণাধীন; বিভিন্ন soil bacterium এ শনাক্ত হয়েছে |
| acnM | ফিউমারেজ সংশ্লিষ্ট সহ-প্রোটিন | ফিউমারেট থেকে ম্যালেট উৎপাদনে ফিউমারেজকে সহায়তা করে | কিছু Rhizobium ও Sinorhizobium sp. এ দেখা যায় |
| acnN | ম্যালেট সংশ্লিষ্ট বিপাকীয় প্রোটিন | ম্যালেট ডিহাইড্রোজেনেজ কার্যকারিতায় সহায়ক | শক্তি উৎপাদন চক্রে গৌণ ভূমিকা পালন করে |
| acnO | সম্ভাব্য এনজাইম ইনহিবিটার | TCA চক্রে বিপাকীয় প্রবাহ নিয়ন্ত্রণে অংশ নিতে পারে | রেগুলেটরি প্রোটিন হিসেবে বিবেচিত |
| acnP | ফসফোএনোলপাইরুভেট/অক্সালোসেটেট সংশ্লিষ্ট প্রোটিন | বিপাকীয় রূপান্তরে সহায়তা করে | প্রাইমারি মেটাবোলিক ফ্লাক্সে ভূমিকা থাকতে পারে |
| acnQ | হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন | অজানা কার্যপ্রণালী | জিনোম অ্যানোটেশনভিত্তিক জিন; পরীক্ষামূলক প্রমাণ প্রয়োজন |
| acnR | ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটর | acn অপারনের জিন এক্সপ্রেশন নিয়ন্ত্রণ করে | নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময় জিন নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ |
| acnS | ম্যালেট সংশ্লিষ্ট হেল্পার প্রোটিন | ম্যালেট সংশ্লিষ্ট প্রক্রিয়াকে প্রভাবিত করে | শক্তি উৎপাদন ও NAD(P)H ভারসাম্যে ভূমিকা থাকতে পারে |
| acnT | ফিউমারেট ট্রান্সপোর্টার | ফিউমারেট ট্রান্সপোর্টে সহায়তা করে | সেলুলার পরিবেশে মেটাবোলাইট পরিবহণে কার্যকর |
| acnU | হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন | TCA চক্রের বাইপাসে সম্ভাব্য অংশগ্রহণকারী | কিছু soil bacterium-এ প্রেডিক্টেড |
| acnV | সাইট্রেট বাইন্ডিং প্রোটিন | সাইট্রেট সংশ্লিষ্ট বিপাকে সহায়ক | নাইট্রোজেনেস কার্যকলাপে অপ্রত্যক্ষ ভূমিকা |
| acnW | ট্রান্সপোর্টার/চ্যানেল প্রোটিন | TCA সংশ্লিষ্ট উপাদানগুলোর পরিবহণে অংশ নিতে পারে | বহুপাস ঝিল্লি প্রোটিন হিসেবে বিবেচিত |
| acnX | হাইপোথেটিক্যাল রিডাক্টেজ প্রোটিন | সম্ভবত NAD(P)+ এর রিসাইক্লিং-এ সহায়তা করে | শক্তি রূপান্তরে গৌণ ভূমিকা পালন করতে পারে |
| acnY | আকেোনিটেজ-সম্পর্কিত সম্ভাব্য সহায়ক জিন | TCA চক্রে কার্যকারিতা বৃদ্ধিতে অংশগ্রহণ | গবেষণাধীন; TCA রেগুলেশন প্রোটিন হিসেবে চিহ্নিত |
| acnZ | সংশ্লিষ্টতা অনিশ্চিত | সম্ভাব্যভাবে TCA বাইপাস বা অন্য বিপাকীয় পথে অংশগ্রহণ করে | গবেষণাধীন জিন; Rhizobium sp. বা অনুরূপ প্রজাতিতে শনাক্ত |
icdA থেকে icdZ পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী
[সম্পাদনা]| জিন | সংশ্লিষ্ট এনজাইম | কার্যপ্রণালী | মন্তব্য |
|---|---|---|---|
| icdA | আইসোসাইট্রেট ডিহাইড্রোজেনেজ (NADP⁺ নির্ভর) | আইসোসাইট্রেটকে α-কেটোগ্লুটারেট, CO₂ এবং NADPH-এ রূপান্তর করে | TCA চক্রে শক্তি উৎপাদনের জন্য গুরুত্বপূর্ণ; এনজাইমটি Mg²⁺ বা Mn²⁺ সহকারে সক্রিয় হয় |
| icdB | NAD⁺ নির্ভর আইসোসাইট্রেট ডিহাইড্রোজেনেজ | বিকল্পভাবে NAD⁺ ব্যবহার করে একই প্রতিক্রিয়া ঘটায় | অক্সিডেটিভ স্ট্রেস পরিস্থিতিতে সক্রিয় হতে পারে |
| icdC | রেগুলেটরি সাবইউনিট (সম্ভাব্য) | icdA ও icdB জিনের অভ্যন্তরীণ নিয়ন্ত্রণ করতে পারে | এখনও সম্পূর্ণ কার্যপ্রণালী জানা যায়নি |
| icdD | অজানা কার্যসম্পন্ন প্রোটিন (আইসোসাইট্রেট সংশ্লিষ্ট) | আইসোসাইট্রেট বিপাকের পার্শ্বপ্রতিক্রিয়া রোধ করতে সহায়তা করে | গবেষণাধীনে; এক্সপ্রেশন মাত্রা নাইট্রোজেন ঘাটতিতে বৃদ্ধি পায় |
| icdE | ট্রান্সপোর্টার প্রোটিন | TCA চক্রের অন্তর্বর্তী উপাদান পরিবহনে সহায়তা করে | ঝিল্লি সংযুক্ত বহুপাস প্রোটিন; শক্তি পরিবহন ব্যবস্থার সাথে সম্পর্কযুক্ত |
| icdF | স্ট্রেস-রেসপন্স প্রোটিন | আইসোসাইট্রেট ডিহাইড্রোজেনেজ কার্যকারিতা স্ট্যাবিলাইজ করে | উচ্চ তাপমাত্রা বা অম্লীয় pH-তে কার্যকর |
| icdG | কোএনজাইম সংশ্লেষ এনজাইম | NADP⁺ সংশ্লেষণে সহায়তা করে যা icdA-র সাবস্ট্রেট | নিয়ন্ত্রিত উপায়ে NADP⁺ স্তর বজায় রাখে |
| icdH | ফসফোরিলেশন নিয়ন্ত্রক | icdA এনজাইমের সক্রিয়তা ফসফোরিলেশন দ্বারা নিয়ন্ত্রণ করে | শক্তি ও সংকেত পরিবহণের সাথে সম্পর্কিত |
| icdI | আইসোসাইট্রেট সংশ্লিষ্ট অক্সিডোরিডাক্টেজ | আইসোসাইট্রেট মেটাবোলিজমে ইলেকট্রন স্থানান্তর ঘটায় | অজানা মেকানিজম; অক্সিজেন সীমিত পরিবেশে দেখা যায় |
| icdZ | অ্যান্টিসেন্স রেগুলেটরি RNA (সম্ভাব্য) | icdA–icdI গোষ্ঠীর mRNA স্তর নিয়ন্ত্রণে সহায়তা করে | gene silencing বা feedback loop-এর অংশ হতে পারে |
আরও দেখুন
[সম্পাদনা]- বায়োলজিক্যাল নাইট্রোজেন ফিক্সেশন
- রাইজোবিয়াম
- সিমবায়োসিস
- ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস
- ডায়াজোট্রোফিক ব্যাকটেরিয়া
- রাইজোবিয়াম
- লিগিউমিনাস উদ্ভিদ
বিভাগ:জীববিজ্ঞান বিভাগ:জিনতত্ত্ব বিভাগ:ব্যাকটেরিয়া বিভাগ:উদ্ভিদবিজ্ঞান বিভাগ:সিমবায়োসিস বিভাগ:জীবাণুবিজ্ঞান
উৎস
[সম্পাদনা]Oldroyd, G.E.D.; Downie, J.A. (২০০৮)। Coordinating Nodule Morphogenesis with Rhizobial Infection in Legumes। খণ্ড ৫৯। Annual Review of Plant Biology। পৃ. ৫১৯–৫৪৬। ডিওআই:10.1146/annurev.arplant.59.032607.092839।
Roy, S. (২০২০)। Celebrating 20 years of genetic discoveries in legume nodulation and symbiotic nitrogen fixation। খণ্ড ৩২। পৃ. ১৫–৪১। ডিওআই:10.1105/tpc.19.00279। {{বই উদ্ধৃতি}}: |সাময়িকী= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)
তথ্যসূত্র
[সম্পাদনা]Downie, J.A. (২০১০)। The roles of Nod factors and exopolysaccharides in the Rhizobium–legume symbiosis। খণ্ড ৩৪। পৃ. ৪৩১–৪৫৩। ডিওআই:10.1111/j.1574-6976.2010.00241.x। {{বই উদ্ধৃতি}}: |সাময়িকী= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)
Long, Steven R. (২০০১)। Rhizobium–legume nodulation: Life together in the underground। খণ্ড ১০০। পৃ. ১৯১–১৯৩। ডিওআই:10.1016/S0092-8674(01)81838-3। {{বই উদ্ধৃতি}}: |সাময়িকী= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)
- NCBI Gene Database
- KEGG Nitrogen Metabolism Pathway
- Molecular Plant-Microbe Interactions Journal
- UniProt Database
বহিঃসংযোগ
[সম্পাদনা]এই নিবন্ধটির অতিরিক্ত অথবা আরো বৈশিষ্ট্যসূচক বিষয়শ্রেণী প্রয়োজন। (মে ২০২৫) |
[[বিষয়শ্রেণী:নাইট্রোজেন সংবদ্ধকরণ [[বিষয়শ্রেণী: লেগোহিমোগ্লোবিন
- ↑
লিগুমিনাস উদ্ভিদের শিকড়ে রাইজোবিয়াম সংক্রমণের সূচনা প্রক্রিয়া
লিগুমিনাস (Leguminous) জাতীয় উদ্ভিদের শিকড়ে রাইজোবিয়াম (Rhizobium) প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সংক্রমণ একটি জটিল ও সুনির্দিষ্ট সিমবায়োটিক প্রক্রিয়া, যা ধাপে ধাপে সংঘটিত হয়। নিচে এই প্রক্রিয়াটির বিস্তারিত বর্ণনা প্রদান করা হলো:১. ফ্ল্যাভোনয়েড নিঃসরণ
লিগুমিনাস উদ্ভিদের শিকড় থেকে নির্গত হয় কিছু নির্দিষ্ট রাসায়নিক যৌগ, যেগুলোকে বলা হয় ফ্ল্যাভোনয়েড (Flavonoids)। এই যৌগগুলো মাটিতে উপস্থিত রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার দৃষ্টি আকর্ষণ করে এবং একপ্রকার সংকেত হিসেবে কাজ করে। ভিন্ন ভিন্ন উদ্ভিদ ভিন্ন ধরনের ফ্ল্যাভোনয়েড নিঃসরণ করে, যা প্রজাতি-নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে।২. Nod ফ্যাক্টরের সৃষ্টি
ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগগুলো রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার মধ্যে অবস্থিত NodD নামক প্রোটিনকে সক্রিয় করে। NodD প্রোটিন সক্রিয় হলে, Nod জিনসমূহের কার্যকারিতা শুরু হয় এবং রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া Nod Factors (লিপো-কাইটিন ওলিগোস্যাকারাইড) তৈরি করে, যা উদ্ভিদ শিকড়ের সংকেত গ্রহণকারী রিসেপ্টর দ্বারা শনাক্ত হয়।৩. NFR1 ও NFR5 রিসেপ্টরের মাধ্যমে সংকেত গ্রহণ
উদ্ভিদের মূলরোমে অবস্থিত NFR1 ও NFR5 নামক রিসেপ্টর (Lysin Motif-type receptor kinases) Nod Factor গুলিকে শনাক্ত করে। এই শনাক্তকরণের মাধ্যমে উদ্ভিদ বুঝতে পারে যে বন্ধুত্বপূর্ণ ব্যাকটেরিয়া প্রবেশ করতে যাচ্ছে, এবং এই সিগন্যালের মাধ্যমে উদ্ভিদের কোষের অভ্যন্তরে সিমবায়োটিক সংকেত সঞ্চালন পথ (Symbiotic Signaling Pathway) সক্রিয় হয়।৪. Lectin প্রোটিনের ভূমিকা
Lectin হলো একটি গ্লাইকোপ্রোটিন যা রাইজোবিয়ামের লিপোপলিস্যাকারাইড শনাক্ত করতে সাহায্য করে। এটি ব্যাকটেরিয়ার স্বীকৃতি ও নির্দিষ্টতা বজায় রাখার ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।Rhizobium-এর পৃষ্ঠের কার্বোহাইড্রেট / লিপোপলিস্যাকারাইড চিহ্নিত করে, ফলে গাছটি উপযুক্ত ব্যাকটেরিয়াকে “বন্ধু” হিসেবে চিনতে পারে বিশেষ করে Root-specific lectins।Lectin রিসেপ্টর (যেমন Lectin receptor-like kinases – LecRKs) Rhizobium-এর Nod factor চিহ্নিত করার পর সেল মেমব্রেনে সংকেত প্রেরণ করে। এর মাধ্যমে calcium spiking ও অন্যান্য সেকেন্ডারি মেসেঞ্জার সক্রিয় হয়। পরবর্তী ধাপে transcription factors (যেমন NIN, NSP1, NSP2) সক্রিয় হয়, যা নডিউল গঠনের জন্য প্রয়োজনীয় জিন চালু করে।Lectin প্রোটিন root hair curling প্রক্রিয়ায় ভূমিকা রাখে, যেখানে মূলের চুল Rhizobium কে ফাঁদে ফেলে। এভাবে একটি infection thread তৈরি হয়, যার মাধ্যমে Rhizobium কোষের ভেতরে প্রবেশ করে।Lectin দ্বারা সক্রিয় সিগনাল কাসকেড cortical cell গুলোতে পুনঃবিভাজন ঘটায়। এর ফলে মূলের ভেতরে nodule primordium (গাঁটের প্রাথমিক গঠন) তৈরি হয়।Infection thread cortical cell-এর দিকে প্রসারিত হয়। Lectin প্রোটিন infection thread-এর দিকনির্দেশনা (guidance) ও Rhizobium-এর স্থায়িত্ব রক্ষা করে। শেষ পর্যন্ত Rhizobium cortical cell-এ প্রবেশ করে এবং bacteroid আকার ধারণ করে।প্রতিটি Rhizobium symbiosome মেমব্রেনে আবদ্ধ হয়। Lectin প্রোটিন symbiosome মেমব্রেনের স্থিতিশীলতা বজায় রাখতে সাহায্য করে। গঠিত নডিউলে Rhizobium nitrogenase এনজাইম ব্যবহার করে N₂ → NH₃ রূপান্তর করে, যা গাছ ব্যবহার করে প্রোটিন সংশ্লেষণে।৫. ইনফেকশন পকেট (Infection Pocket) গঠন
Nod ফ্যাক্টর শনাক্ত হবার পর মূলরোমের সংযোগস্থলে রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়াগুলো জমা হয়ে Infection Pocket গঠন করে। এই পকেট হল এমন একটি স্থান যেখানে ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের কোষে প্রবেশের প্রস্তুতি নেয়।৬. ইনফেকশন থ্রেড গঠন
Infection Pocket গঠনের পর, উদ্ভিদের অ্যাপিডার্মিস কোষে Infection Thread নামক একটি টিউব-সদৃশ গঠন তৈরি হয়। এই থ্রেডের মধ্য দিয়ে রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের অভ্যন্তরে প্রবেশ করে।Rhizobium মূলের চারপাশে ভেসে বেড়ায় এবং root hair curling ঘটায় (Nod factor দ্বারা উদ্দীপিত)। Curl হওয়া root hair-এর ফাঁকা জায়গায় Rhizobium জমা হয়ে একটি infection pocket তৈরি হয়। 👉 এভাবে উদ্ভিদ Rhizobium কে প্রথমে “আটকায়” যেন সঠিকভাবে ভেতরে প্রবেশ করানো যায়, বলতে গেলে Bacterial trapping এ সহায়তা করে।Infection pocket-এর ভেতরে Rhizobium দ্রুত গুণবৃদ্ধি করে। Lectin ও অন্যান্য surface protein-এর মাধ্যমে উদ্ভিদ ব্যাকটেরিয়ার ওপর নিয়ন্ত্রণ বজায় রাখে, যেন অবাঞ্ছিত অণুজীব ভেতরে প্রবেশ না করতে পারে। 👉 এটি এক ধরনের screening checkpoint।Infection pocket হলো ঘনিষ্ঠ সংকেত বিনিময়ের স্থান। এখানে Rhizobium Nod factor, exopolysaccharide, lipopolysaccharide ইত্যাদি নিঃসরণ করে, আর উদ্ভিদ calcium spiking ও ROS signaling দ্বারা সাড়া দেয়। 👉 এই ধাপে mutual compatibility নিশ্চিত হয়।Infection pocket থেকে উদ্ভিদ কোষের প্রাচীরে একটি cell wall invagination তৈরি হয়। এখান থেকে infection thread (টিউবের মতন কাঠামো) গড়ে উঠে, যা Rhizobium কে ভেতরের দিকে পরিচালিত করে। 👉 Infection pocket basically infection thread-এর “launching pad”।Infection pocket Rhizobium কে root cortex-এর দিকে প্রবেশের জন্য দিকনির্দেশনা দেয়। Pocket → thread → cortical cell → nodule primordium—এই ধাপে ব্যাকটেরিয়ার চলাচল infection pocket থেকেই শুরু হয়।৭. ইনফেক্টোসোম (Infectosome) গঠন
রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া যখন মূলরোমের অ্যাপিডার্মিস কোষে প্রবেশ করে, তখন বিভিন্ন সিগন্যালিং ও কোষীয় উপাদান মিলে Infectosome নামক একটি মাল্টি-প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে। এর কাজ হল: যখন Rhizobium উদ্ভিদের মূলচুলে (root hair) আসে, তখন Nod factor perception ঘটে। গাছের receptor kinases (যেমন NFR1, NFR5) সক্রিয় হয়। এর ফলেই infectosome assembly শুরু হয় – একাধিক signaling protein মেমব্রেনের কাছে এসে জড়ো হয়।Infectosome প্রোটিন কমপ্লেক্স Nod factor signaling pathway চালু করে। এতে Ca²⁺ oscillation / calcium spiking ও downstream transcription factors (যেমন NSP1, NSP2, NIN) সক্রিয় হয়। 👉 এর মাধ্যমে plant cell “symbiotic program” চালু করে।Infectosome root hair-এর cytoskeleton (actin, microtubule) পুনর্গঠন করে। এর ফলে root hair curling ঘটে, যেখানে infection pocket গঠিত হয়। 👉 অর্থাৎ infectosome হলো infection pocket তৈরির জন্য “controller”।Infectosome cell wall remodeling enzyme (cellulose synthase, expansins) ও ROS regulators নিয়ন্ত্রণ করে। এর মাধ্যমে infection pocket থেকে cell wall invagination হয়, যা পরে infection thread এ রূপ নেয়। 👉 এখানে infectosome infection thread-এর “launching engine”।Infectosome cortical cell-এর দিকে infection thread পরিচালনা করে। Actin filaments ও vesicle trafficking (exocytosis) নিয়ন্ত্রণ করে infection thread-এর টিপে নতুন মেমব্রেন যোগ করে। 👉 ফলে thread সঠিক দিকে বাড়তে পারে।Infectosome Rhizobium কে infection thread-এর ভেতরে রাখতে সাহায্য করে। Cortical cell-এ পৌঁছালে Rhizobium “endocytosis-like process” এর মাধ্যমে plant cell-এ ঢোকে এবং symbiosome তৈরি হয়। Infectosome এই endocytosis প্রক্রিয়ারও সমন্বয় সাধন করে।Infectosome-এর সংকেত cortical cell division উদ্দীপিত করে। ফলে nodule primordium তৈরি হয়। পরবর্তীতে symbiosome-এ Rhizobium bacteroid আকার নেয় এবং nitrogen fixation শুরু করে। 👉 এই পুরো প্রক্রিয়ার ভিত্তি স্থাপন করে infectosome।ইনফেকশন ড্র্যোপ্লেট (Infection droplet 💧 💧)
Infection droplet কী? এটি হলো Rhizobium–legume symbiosis প্রক্রিয়ায় cortical cell বা নডিউল প্রাইমোর্ডিয়ামের ভেতরে গঠিত একটি ক্ষুদ্র ফোটা-সদৃশ কাঠামো। Infection droplet মূলত infection thread-এর অগ্রভাগে (tip) তৈরি হয়। এখান থেকে Rhizobium উদ্ভিদ কোষের ভেতরে endocytosis-এর মত প্রক্রিয়ায় প্রবেশ করে। 👉 অর্থাৎ, Infection droplet হলো bacteria release chamber, যেখান থেকে Rhizobium cortical cell-এ ছেড়ে দেওয়া হয়। Infection thread elongation-এর শেষে droplet তৈরি Root hair থেকে শুরু হওয়া infection thread cortical cell পর্যন্ত পৌঁছায়। Cortical cell-এর ভেতরে পৌঁছালে thread-এর অগ্রভাগ ফুলে উঠে infection droplet তৈরি হয়। Infection droplet-এর ভেতরে প্রচুর Rhizobium জমা হয়। Plant cell wall ও plasma membrane remodeling হয়, যাতে ব্যাকটেরিয়া release করা যায়।Infection droplet থেকে Rhizobium ধীরে ধীরে host cell cytoplasm-এ endocytosis-এর মাধ্যমে মুক্তি পায়। প্রতিটি মুক্ত হওয়া ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের মেমব্রেন দ্বারা আবৃত হয়ে আলাদা compartments তৈরি করে। 👉 এই compartments-কে বলা হয় symbiosome।Symbiosome-এর ভেতরে প্রবেশের পর Rhizobium ধীরে ধীরে রূপান্তরিত হয়ে bacteroid আকার নেয়। এরা নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের জন্য প্রস্তুত হয়। বলতে গেলে ইনফেকশন ড্র্যোপ্লেট Bacteroid differentiation পদ্ধতিতে সহায়ক ভূমিকা পালন করে।Infection droplet থেকে release হওয়া Rhizobium cortical cell-এ ছড়িয়ে পড়ে এবং symbiosome তৈরি করে। ধীরে ধীরে নডিউলের ভেতরে অসংখ্য bacteroid তৈরি হয়। পরিশেষে, nitrogen fixation (N₂ → NH₃) প্রক্রিয়া শুরু হয়, যা গাছকে নাইট্রোজেন সরবরাহ করে।সারাংশ
এই সমগ্র প্রক্রিয়াটি রাইজোবিয়াম ও লিগুমিনাস উদ্ভিদের মধ্যে সিমবায়োটিক সম্পর্ক গঠনের প্রথম ধাপ, যা পরবর্তীতে নডিউল গঠন এবং নাইট্রোজেন স্থায়ীকরণে পরিণত হয়। - ↑ পুনঃঅববিশিষ্টকরণ হলো এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে পরিপক্ক কোষগুলি তাদের পৃথক অবস্থা পরিবর্তন করে এবং বহুত্ব অর্জন করে। পুনঃবিশিষ্টকরণ হলো এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে ডিডিফারেনশিয়েটেড কোষগুলি বিভাজনের ক্ষমতা হারিয়ে ফেলে এবং স্থায়ী টিস্যুর একটি অংশে রূপান্তরিত হয়ে ভূমিকা পালনের জন্য বিশেষায়িত হয়।
- ↑ সিম্বায়োসোম (symbiosome) হলো উদ্ভিদের মূল গাঁঠ কোষের অভ্যন্তরে থাকা এক বিশেষ ধরনের গঠন, যা নাইট্রোজেন-স্থিরকারী ব্যাক্টেরিয়া (যেমন: Rhizobium) দ্বারা গঠিত ব্যাক্টোরোয়েডকে ঘিরে রাখে। এটি উদ্ভিদ ও ব্যাক্টেরিয়ার মধ্যে পারস্পরিক সহনশীল সম্পর্ক বজায় রাখতে সাহায্য করে।
- ↑ Succinoglycan একটি এক্সোপলিস্যাকারাইড (exopolysaccharide), যা প্রধানত রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া দ্বারা উৎপাদিত হয়। এটি লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদের শিকড়ে ইনফেকশন থ্রেড গঠন এবং ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।Succinoglycan উদ্ভিদের Nodulative Factor স্বীকৃতি প্রক্রিয়া সম্পন্ন হওয়ার পর ইনফেকশন থ্রেড গঠনে সহায়তা করে। এটি রাইজোবিয়ামের চলনক্ষমতা বৃদ্ধি করে এবং উদ্ভিদের শিকড় কোষের দেওয়ালে সংযোগ স্থাপন করে।Succinoglycan সাধারণত নিম্নলিখিত মনোমার একক দ্বারা গঠিত হয়: - 7টি গ্লুকোজ (Glucose) একক - 1টি গ্যালাক্টোজ (Galactose) একক।Succinoglycan সাধারণত নিম্নলিখিত উপাদান সংযুক্ত থাকে: - সাক্সিনেট গ্রুপ (–COCH2CH2COOH) - পাইরুভেট গ্রুপ (–COCOOH) - অ্যাসিটেট গ্রুপ (–COCH3) এই গ্রুপগুলো এর ভৌত ও রাসায়নিক বৈশিষ্ট্য নির্ধারণ করে এবং উদ্ভিদের সাথে সংযোগ স্থাপনে সাহায্য করে।
- ↑
- নোট**: প্রতিটি হরমোন উদ্ভিদের অভ্যন্তরে পরস্পরের সাথে সমন্বিতভাবে কাজ করে এবং পরিবেশ ও অণুজীব সংবেদনের ভিত্তিতে ভিন্নভাবে প্রতিক্রিয়া করে।
- মাইক্রোবায়োলজি
- বংশাণুবিজ্ঞান
- রাইজোবিয়াম
- উদ্ভিদ অঙ্গসংস্থান
- নাইট্রোজেন স্থিরীকরণ
- নডিউলেশন জিন
- রাইজোবিয়াম জিনতত্ত্ব
- ব্যাকটেরিয়ার জিন
- নোড জিন
- নডিউলেশন
- এক্সোপলিস্যাকারাইড
- সিম্বায়োসিস
- নডিউল সংস্থাপন
- লিপিড সংশ্লেষণ
- ব্যাকটেরিয়া জিন
- জৈবরাসায়ন
- ডায়াজোট্রোফ
- ব্যাকটেরিয়াল সিক্রিশন সিস্টেম
- সেক্রেশন সিস্টেম
- বিষাক্ততা প্রোটিন
- ফ্ল্যাজেলাম
- জৈবপ্রযুক্তি
- পাইলাস
- ফ্রিম্ব্রিয়া
- সারফেস প্রোটিন
- আধেশন প্রোটিন
- সার্ফেস আডহেশন প্রোটিন
- ক্যাপসুলার পলিস্যাকারাইড
- ফ্ল্যাভোনয়েড
- লিগুমিনাস উদ্ভিদ
- লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদীয় জিন