বিষয়বস্তুতে চলুন

ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস

উইকিপিডিয়া, মুক্ত বিশ্বকোষ থেকে

ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস(ইংরেজি: Diazotrophic nodule Morphogenesis) হল একটি জটিল জৈবপ্রক্রিয়া যার মাধ্যমে ডায়াজোট্রোফিক (নাইট্রোজেন-স্থিরকারী) ব্যাকটেরিয়াগুলোর সাথে উদ্ভিদের রাইজোস্ফিয়ারীয় রাইজোরিমিডিয়েশনের পারস্পরিক ক্রিয়ার ফলে শিকড়ে নডিউল (নডিউল = গ্রন্থি সদৃশ গঠন) গঠিত হয়। এই প্রক্রিয়াটি উদ্ভিদের জন্য পরিবেশ থেকে নাইট্রোজেন সংগ্রহ করার একটি বিকল্প ব্যবস্থা প্রদান করে এবং কৃষিতে জৈব সার বিকল্প হিসেবে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।একটি জৈব প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে কিছু উদ্ভিদের শিকড়ে নাইট্রোজেন-স্থিরকারী ব্যাকটেরিয়ার সাথে সহাবস্থানের মাধ্যমে বিশেষ ধরনের গঠন, যাকে নডিউল বলা হয়, সৃষ্টি হয়। এই প্রক্রিয়ার ফলে উদ্ভিদ বায়ুমণ্ডলীয় নাইট্রোজেনকে গ্রহণযোগ্য অ্যামোনিয়ায় রূপান্তর করে, যা উদ্ভিদের বৃদ্ধির জন্য অপরিহার্য।এ পদ্ধতির অপর নাম হলো নডিউল অর্গানোজেনেসিস (Nodule organogenesis) বলা যায়।এ পদ্ধতির অংশগ্রহণকারী রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ কে ডায়াজোট্রোফ বা সিম্বোয়োন্ট (Diazotroph Or Symbiont) বলা যায়।ডায়াজোট্রোফ জাতীয় রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ গোত্র হলো রাইজোবিয়াসিয়াই (Rhizobiaceae) ও এর অপর নাম হলো (Azotroph) অ্যাজোট্রোফ বা বায়োট্রোফ (Biotroph) বলা হয়।ডায়াজোট্রোফ জাতীয় রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ যে লিগিউমিনাস উদ্ভিদ কে হোস্ট করে তাকে নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদ (Nodulated host plant) বলা হয়।উদ্ভিদের শিকড়ে অবস্থিত বিশেষ নডিউল বা গাঁঠ গঠনের জৈব ও আণবিক প্রক্রিয়া, যার মাধ্যমে ডায়াজোট্রোফিক (নাইট্রোজেন-স্থিতিসূচক) ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের সঙ্গে সহজীবী বা সহাবস্থান স্থাপন করে। এই প্রক্রিয়ার মাধ্যমে গাছগুলো বায়ুমণ্ডলীয় নাইট্রোজেনকে গ্রহণযোগ্য যৌগে রূপান্তর করে, যা উদ্ভিদের বৃদ্ধি ও পুষ্টির জন্য অপরিহার্য।ডায়াজোট্রোফিক ব্যাকটেরিয়া, যেমন Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium প্রভৃতি মাইক্রোবরা উদ্ভিদের শিকড়ে অনুপ্রবেশ করে এবং সিমবায়োটিক সম্পর্ক গঠন করে। এই সম্পর্কের ফলে উদ্ভিদের শিকড়ে বিশেষ ধরণের গাঁঠ (নডিউল) সৃষ্টি হয়। এই নডিউলগুলোতে নাইট্রোজেন ফিক্সেশন প্রক্রিয়া সম্পন্ন হয়, যা উদ্ভিদের জন্য নাইট্রোজেন সরবরাহ করে। নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদের গোত্র নাম হলো Fabaceae,Leguminosae,Caesalpinioideae (সেসালপিনিওইডি),Mimosoideae (মিমোসোইডি),Faboideae / Papilionoideae (ফ্যাবয়েডি বা প্যাপিলিওনয়েডি),রোসিওইডি (Rosoideae),রোসাসিয়াই (Rosaceae),Spiraeoideae,Dryadoideae,Amygdaloideae (বা Maloideae) ও ইত্যাদি।এ পদ্ধতির অপর নাম হলো অ্যাজোট্রোফিক অ্যান্ডোবায়োসিম্বোসিস (Azotrophic Endobiosymbiosis) ও এ পদ্ধতিটিকে এমন একটি পারস্পরিক উপকারী সম্পর্ক (Mutualistic Relationship) বলা হয়।ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস একটি জটিল, বহুস্তরবিশিষ্ট প্রক্রিয়া, যেখানে জিনতত্ত্ব, সেলুলার সংকেত, ও ব্যাকটেরিয়া-উদ্ভিদ পারস্পরিক সম্পর্ক একত্রে কাজ করে উদ্ভিদকে পরিবেশ থেকে নাইট্রোজেন গ্রহণের অক্ষমতা কাটিয়ে তুলতে সাহায্য করে। অন্যান্য গণসমূহ হচ্ছেঃ

পরিবার: গণ

Betulaceae (বার্চ পরিবার): Alnus — অ্যাল্ডার গাছ

Cannabaceae (গাঁজা পরিবার): Trema — ত্রেমা

Casuarinaceae (কাসুয়ারিনা পরিবার):

Allocasuarina — অ্যালোকাসুয়ারিনা
Casuarina — কাসুয়ারিনা
Ceuthostoma — কিউথোস্টোমা
Gymnostoma — জিমনোস্টোমা

......

Coriariaceae (কোরিয়ারিয়া পরিবার): Coriaria — কোরিয়ারিয়া

Datiscaceae (ডাটিস্কা পরিবার): Datisca — ডাটিস্কা

Elaeagnaceae (এলিয়াগনাস পরিবার):

Elaeagnus — সিলভারবেরি
Hippophae — সমুদ্র বাকথর্ন
Shepherdia — বাফেলোবেরি

......

Myricaceae (বে-বেরি পরিবার):

Comptonia — সুইটফার্ন
Morella — মোরেলা
Myrica — বে-বেরি

......

Rhamnaceae (র‍্যামনাসি পরিবার):

Ceanothus — সিয়ানোথাস
Colletia — কোল্লেটিয়া
Discaria — ডিস্কারিয়া
Kentrothamnus — কেনট্রোথামনাস
Retanilla — রেটানিলা
Talguenea — টালগুয়েনিয়া
Trevoa — ট্রেভোয়া

......

Rosaceae (গোলাপ পরিবার):

Cercocarpus — মাউন্টেন মহগনি
Chamaebatia — মাউন্টেন মিজেরি
Dryas — ড্রায়াস
Purshia/Cowania — বিটারব্রাশ/ক্লিফরোজ

জিনতত্ত্ব ও জৈবপদার্থবিদ্যা

[সম্পাদনা]

প্রক্রিয়া

[সম্পাদনা]

নডিউল গঠনের প্রক্রিয়াটি প্রধানত নিচের ধাপগুলোতে সংঘটিত হয়:

১. সংকেত বিনিময়(Signal Recognition): উদ্ভিদ তার শিকড়ের নিঃসরণ দ্বারা ব্যাকটেরিয়াকে আকর্ষণ করে। ব্যাকটেরিয়া ‘নোড ফ্যাক্টর’ নামক সংকেত পাঠিয়ে উদ্ভিদকে সাড়া দিতে প্ররোচিত করে।উদ্ভিদের শিকড় ফ্ল্যাভোনয়েড নির্গত করে, যা ব্যাকটেরিয়াকে উদ্দীপিত করে Nod ফ্যাক্টর তৈরি করতে।উদ্ভিদ শিকড় থেকে নির্গত ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ ডায়াজোট্রোফিক ব্যাকটেরিয়াকে আকৃষ্ট করে।রাইজোবিয়াম-লিগুমিনাস সিম্বোসিসের সূচনায় কেমোট্যাক্সিসের মডেল (Chemotactic model) কাজ করে।

(ক) মূল এবং বীজের নির্গমন ছড়িয়ে পড়ে এবং রাসায়নিক পথ তৈরি করে। দ্রবণীয় নির্গমনের (লাল❤️) গ্রেডিয়েন্টগুলি সবচেয়ে দূরে ভ্রমণ করে এবং কেমোঅ্যাট্র্যাক্ট্যান্ট (Chemoattractant) হিসাবে কাজ করে। হাইড্রোফোবিক অ্যাক্সুডেট উপাদানগুলি (হলুদ 💛) উৎসের কাছাকাছি থাকে।

(খ) নির্দিষ্ট নির্গমনিত যৌগগুলি ব্যাকটেরিয়া মিথাইল-গ্রহণকারী কেমোট্যাক্সিস (Chemotaxis)প্রোটিন (এমসিপি:-মনোক্যালসিয়াম ফসফেট{Ca(H₂PO₄)₂}) দ্বারা সনাক্ত করা হয়, যা আকর্ষকদের (attractors) নিবেদিত কোমোসেন্সর। কেমোসেন্সরি সিস্টেম (Chemosensory system) এবং মোটরের মধ্যে সংকেত ব্যাকটেরিয়াকে আকর্ষক উৎসের দিকে পরিচালিত করে। রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ কোষঝিল্লিতে থাকা NodD protein (কোমোসেন্সর {Chemosensor}) হিসেবে কাজ করে।এটি একটি ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটর (Transcriptional Regulator) যা ব্যাকটেরিয়ার কোষে ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগগুলো শনাক্ত করে।ফ্ল্যাভোনয়েডের সাথে যুক্ত হয়ে এটি nod box genes গুলোর অ্যাক্সোপ্রেশন ট্রিগার করে, যা Nodulative factors উৎপন্ন করে।এটি প্রোক্যারিওটিক চলন অঙ্গাণু, যা ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদের রাইজোস্ফিয়ারে (Rhizosphere) দ্রুতগতিতে পৌঁছাতে সাহায্য করে।ফ্ল্যাজেলাম নড়াচড়ার নির্দেশনা পায় কোমোসেন্সিং সিস্টেম (Chemosensing system) থেকে, যার মধ্যে কোমোসেন্সর, কোমোসিগনালিং পথ (Chemosignaling Pathway) এবং মোটর অংশ থাকে।

(গ) রাইজোবিয়াল NodD দ্বারা উদ্ভিদ ফ্ল্যাভোনয়েডের উপলব্ধি সঠিক হোস্টকে সংক্রামিত করার জন্য জড়িত জিনের প্রতিলিপি শুরু করে। ব্যাকটেরিয়া নোড ফ্যাক্টর (lipochitooligosaccharide) নিঃসরণ করে, যা উদ্ভিদের শিকড় কোষে সংকেত পৌঁছে দেয়।লিগিউমিনাস (Leguminous) গাছের মূল থেকে নির্গত কিছু ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার NodD প্রোটিন সক্রিয় করে নোড জিন (nod genes) গুলোর কার্যক্রম শুরু করে। এই যৌগগুলো সংকেত-আণবিক (signaling molecule) হিসেবে কাজ করে এবং ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস প্রক্রিয়া শুরু করতে সাহায্য করে।লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদের মূল থেকে নিঃসৃত ফ্ল্যাভোনয়েড (Flavonoids) যৌগ nodD জিন সক্রিয় করে। এরপর nodABC গোষ্ঠী মূল GlcNAc ব্যাকবোন গঠন করে এবং অন্যান্য nod জিনগুলোর সাহায্যে মোডিফিকেশন সম্পন্ন হয়। ফলস্বরূপ উৎপন্ন Nodulative Factor উদ্ভিদের মূল কোষে সংকেত প্রেরণ করে এবং সেলুলার প্রতিক্রিয়া শুরু হয়, যার মাধ্যমে নডিউল মরফোজেনেসিস প্রক্রিয়া শুরু হয়।এ ধাপে নোড অপেরন(Operon) এ থাকা নোড ক্লাস্টারে নোড জিনসমূহ ত্বরান্বিত করতে মূখ্য ভূমিকা পালন করে সহায়ক হিসেবে। []

ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগসমূহের তালিকা

[সম্পাদনা]
রাইজোবিয়াম উদ্দীপক ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ
ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগের ইংরেজি নামবাংলা নামশ্রেণি (Class)রাসায়নিক সংকেত (Chemical Formula)উৎস উদ্ভিদ (Host Plant)
LuteolinলুটিওলিনFlavoneC15H10O6Medicago sativa (আলফালফা)
Genisteinজেনিস্টেইনIsoflavoneC15H10O5Glycine max (সয়াবিন)
DaidzeinডাইডোজেইনIsoflavoneC15H10O4Glycine max (সয়াবিন)
Naringeninনারিন্জেনিনFlavanoneC15H12O5Phaseolus vulgaris (সাধারণ শিম)
Eriodictyolঅ্যারিওডিক্টিওলFlavanoneC15H12O6Phaseolus spp. (বিভিন্ন শিম প্রজাতি)
Apigeninঅ্যাপিজেনিনFlavoneC15H10O5Trifolium spp. (ক্লোভার)
Chrysinক্রাইসিনFlavoneC15H10O4বিভিন্ন লিগিউমিনাস উদ্ভিদ
Formononetinফর্মোনোনেটিনIsoflavoneC16H12O4Trifolium pratense (লাল ক্লোভার)
Biochanin Aবায়োক্যানিন এIsoflavoneC16H12O5Cicer arietinum (ছোলা)
LiquiritigeninলিকুইরিটিজেনিনFlavanoneC16H12O4Glycyrrhiza spp. (যষ্টিমধু)
7,4'-Dihydroxyflavone৭,৪'-ডাইহাইড্রক্সিফ্ল্যাভোনFlavoneC15H10O4বিভিন্ন লিগিউমিনাস উদ্ভিদ
7-Hydroxyflavone৭-হাইড্রক্সিফ্ল্যাভোনFlavoneC15H10O3বহু লিগিউমিনাস উদ্ভিদ

নোড ফ্যাক্টরের (Nodulative Factor) গঠন

[সম্পাদনা]

নোড ফ্যাক্টর সাধারণত নিম্নলিখিত রাসায়নিক উপাদানসমূহ দ্বারা গঠিত হয়:

যৌগ/উপাদানরাসায়নিক সংকেতকাজ ও ভূমিকা
বিটা-১,৪-সংযুক্ত এন-অ্যাসিটাইলগ্লুকোসামিনβ-1,4-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc)Nod factor-এর মূল ব্যাকবোন গঠন করে
ফ্যাটি অ্যাসাইল শৃঙ্খলFatty acyl chain (R-CO-)হাইড্রোফোবিক অংশ; প্রজাতিভেদে পরিবর্তিত হয়
অ্যাসিটাইল গ্রুপ–COCH3 (Acetyl group)গঠনগত মোডিফিকেশন ঘটায় ও জৈব সংকেত প্রেরণে সাহায্য করে
সালফেট গ্রুপ–SO42⁻ (Sulfate group)সিগন্যাল শক্তি ও কার্যকারিতা বৃদ্ধি করে
কার্বাময়েল গ্রুপ–CONH2 (Carbamoyl group)নির্দিষ্ট উদ্ভিদের মূল কোষে গ্রহণযোগ্যতা বাড়ায়
ফিউকোজ / আরাবিনোজ শর্করাFucose / Arabinose (–O-Sugar)শর্করা সংযোজনের মাধ্যমে প্রজাতি-নির্দিষ্টতা নির্ধারণ করে

২. ইনফেকশন থ্রেড গঠন(Formation of Inflection thread): ব্যাকটেরিয়া শিকড়ের মূলরোম কোষে প্রবেশ করে ইনফেকশন থ্রেড তৈরি করে, যাকে ইনফেকশন থ্রেডিং পদ্ধতি বলে।ব্যাকটেরিয়া শিকড়ের রোমে প্রবেশ করে এবং ইনফেকশন থ্রেড নামক টিউবুলার স্ট্রাকচার (Tabular Structure) তৈরি করে যার মাধ্যমে ব্যাকটেরিয়া শিকড়ের অভ্যন্তরে প্রবেশ করে।এ ধাপে ব্যাকটেরিয়াল টাইপ সিক্রেশন সিস্টেমিক, ইপিএস,টিটিএস,অ্যাক্সো, ফ্ল্যাগ,ফ্ল্যাজ,ফ্রিম ইত্যাদি অপেরন এ থাকা এসব ক্লাস্টারে ব্যাকটেরিয়াল টাইপ সিক্রেশন সিস্টেমিক, ইপিএস,টিটিএস,অ্যাক্সো,ফ্ল্যাগ,ফ্ল্যাজ,ফ্রিম জিনসমূহ ত্বরান্বিত করতে মূখ্য ভূমিকা পালন করে সহায়ক হিসেবে।এ ধাপে ইনফেকশন পকেট, ইনফেকশন থ্রেড ও ইনফেক্টোসোম তৈরি হয় অতিদ্রুততে নডিউল প্রাইর্মোডিয়াম কোষে প্রবেশ করার পূর্বে।

৩. হাইপারপ্লাসিয়া কোষ বিভাজন ও নডিউল গঠন(Formation of Nodule and Hyperplasia Cell division): ইনফেকশন থ্রেডিং পদ্ধতির সময় ইনফেকশন থ্রেডটি থেকে হাইপারপ্লাসিয়া কোষ বিভাজনের মাধ্যমে বিভাজিত লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদের শিকড়ের কর্টেক্স কোষের সাইটোপ্লাজমে রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ প্রবেশ করে এবং সেখানে রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ অ্যামাইটোসিস ও ক্যারিওস্টেনোসিস প্রোক্যারিওটিক কোষ বিভাজনের মাধ্যমে বিভাজিত হয়ে বংশবিস্তার করে।উদ্ভিদের কর্টেক্স ও পেরিসাইকেল কোষ বিভাজনের মাধ্যমে নডিউলের অবকাঠামো গঠিত হয়।উদ্ভিদের পেরিসাইকেল ও কর্টেক্স হাইপারপ্লাসিয়া পদ্ধতিতে কোষ বিভাজনের মাধ্যমে নতুন টিস্যু গঠন করে এবং একটি গঠনগত নডিউল সৃষ্টি করে যেখানে NCR পেপটাইড ও অন্যান্য জিন প্রোটিন দ্বারা (Bacteroides Differentiation:- Dedifferentiation & Redifferentiation) পদ্ধতি [] রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ ব্যাক্টোরোয়েড (Bacteroides) রূপান্তরিত হয়। নাইট্রোজেন স্থিরকরণ এবং নাইট্রোজেন সরবরাহের জন্য পরিবেশ তৈরি করা সংক্রমণের থ্রেডটি নডিউল প্রাইমোর্ডিয়ামে পৌঁছানোর পর, সংক্রমণের থ্রেডগুলি ব্যাকটেরিয়া ধারক কোষে ফোঁটা ছেড়ে দেয়, যা সর্বদা একটি উদ্ভিদ-উদ্ভূত ঝিল্লি দ্বারা বেষ্টিত থাকে। এই কাঠামোগুলি, তথাকথিত সিম্বোসোমগুলি, অর্গানেলের মতো। সিম্বোসোমগুলি বিভাজন অব্যাহত রাখতে পারে এবং ব্যাক্টেরিয়াগুলি ব্যাক্টোরোয়েডে বিভক্ত হতে পারে। DNF1-ক্লিভড N-NCR মেমব্রেন ভেসিকেল ট্র্যাফিকিংয়ের মাধ্যমে সিম্বোসোমে সরবরাহ করা হয় এবং ব্যাক্টোরোয়েড পার্থক্যকে প্ররোচিত করে। DNF1 প্রোটিওলাইটিকভাবে NIN প্রোটিনকে বিচ্ছিন্ন করে এবং একটি C-NIN তৈরি করে, যা টার্মিনাল পার্থক্য এবং নাইট্রোজেন স্থিরকরণে জড়িত জিনগুলিকে সক্রিয় করে।

কোষের আকার বৃদ্ধির ফলে হাইপারট্রোফি হয়, তবে কোষের সংখ্যা বৃদ্ধির ফলে হাইপারপ্লাসিয়া হয়।

৪. নাইট্রোজেন ফিক্সেশন (Nitrogen fixation): ব্যাকটেরিয়া নাইট্রোজেনেজ (Nitrogenase) এনজাইমের মাধ্যমে বায়বীয় নাইট্রোজেনকে অ্যামোনিয়ায় রূপান্তর করে।ব্যাকটেরিয়া নডিউলের ভিতরে নাইট্রোজেনেজ এনজাইমের মাধ্যমে বায়ুমণ্ডলের নাইট্রোজেন (N₂) কে উদ্ভিদের গ্রহণযোগ্য অ্যামোনিয়া (NH₃)-তে রূপান্তর করে। রাইজোবিয়ামের নাইট্রোজেনেজ এনজাইম কমপ্লেক্স N₂ কে অ্যামোনিয়াতে (NH₃) রূপান্তরিত করে যা ব্যাক্টোরোয়েড থেকে প্রসারণ বা অজানা চ্যানেলের মাধ্যমে নির্গত হয়।সিম্বোসোম [](Symbosome) ঝিল্লিতে H+-ATPases একটি অ্যাসিডিক পেরিব্যাক্টোরোয়েড স্থান তৈরি করে, যা অ্যামোনিয়া প্রোটোনেট করে এবং অ্যামোনিয়াম(NH₄⁺) ক্যাটেশন তৈরি করে অ্যামোনিয়ামকে (NH₄⁺) আটকে রাখে। অ্যামোনিয়াম ক্যাটেশনগুলি উদ্ভিদ কোষের সাইটোপ্লাজমে রপ্তানি করা হয় এবং তারপর GS এবং GOGAT দ্বারা Gln এবং Glu-তে আত্তীকরণ করা হয়, যা অ্যামাইড গ্রুপকে Gln থেকে AKG-তে স্থানান্তর করে। লিগুমিনাসের প্রজাতি এবং নডিউলের ধরণের উপর নির্ভর করে, Gln এবং Glu জাইলেমের মাধ্যমে দীর্ঘ দূরত্বের পরিবহনের জন্য Asn বা ureides-এ রূপান্তরিত হয়। শেষ পর্যন্ত, নডিউলটি বার্ধক্য এবং ব্যাক্টোরোয়েডের লিসের মধ্য দিয়ে যায়। বার্ধক্য পর্যায়ে নডিউলগুলিতে বিভিন্ন CP অত্যন্ত উচ্চ মাত্রায় প্রকাশিত হয়, বিশেষ করে একটি প্যাপেইন পেপ্টিডেজ (CP6) এবং একটি VPE, যা একটি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর NAC969 দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়।এ ধাপে নিফ অপেরন এ থাকা নিফ ক্লাস্টারে নিফ জিনসমূহ ত্বরান্বিত করতে মূখ্য ভূমিকা পালন করে সহায়ক হিসেবে।

মূল নডিউল সিম্বোটিক কোষ একটি কোষের একটি অংশ, যেখানে ব্যাক্টোরোয়েডকে ঘিরে সিম্বায়োসোম দেখা যাচ্ছে।
রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহ নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময় নাইট্রোজেনেজ এনজাইমের ত্রিমাত্রিক চিত্র
নাইট্রোজেনেজ এনজাইমের মাধ্যমে নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের ডিস্টাল ও অলটারনেটিং মেকানিজমিক পথের তুলনা।
বাম পাশে

উল্লেখযোগ্য তথ্য

[সম্পাদনা]
  • EPS I (Succinoglycan:- C56H92O46) নডিউল গঠনে উদ্ভিদের ইমিউন প্রতিক্রিয়া দমন করে।[]
  • Exo জিনগুলোর মিউটেশনের ফলে নডিউল গঠন বিঘ্নিত হয়।
  • এগুলো সাধারণত একসঙ্গে একটি জিন ক্লাস্টারে অবস্থান করে।
  • উদ্ভিদের ফাইটোহরমোনসমূহ (Phytohormones)

উদ্ভিদের বিকাশ, বৃদ্ধি, সিগন্যাল সংবেদন, পরিবেশ প্রতিক্রিয়া এবং সিমবায়োসিস প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালনকারী প্রধান ফাইটোহরমোনসমূহ নিম্নরূপ:

  • ১. IAA (Indole-3-Acetic Acid)

- **রাসায়নিক সংকেত**: C10H9NO2

- **ধরন**: অক্সিন (Auxin)

- **প্রধান কার্যাবলী**:- শিকড় ও কান্ড বৃদ্ধিতে সহায়তা,Root hair curling ও নোড গঠনে প্রাথমিক ভূমিকা,কোষ প্রসারণ ও ভিন্নকরণে সহায়ক হিসেবে কাজ করে।

২. CK (Cytokinin)

- **প্রতিনিধিত্বকারী যৌগ**: Zeatin

- **রাসায়নিক সংকেত (Zeatin)**: C10H13N5O

- **ধরন**: সাইটোকাইনিন

- **প্রধান কার্যাবলী**:- কোষ বিভাজন বৃদ্ধি,নডিউল গঠনে Cortex কোষকে সক্রিয় করে,NIN, CRE1 pathway উদ্দীপিত করে

৩. ET (Ethylene)

- **রাসায়নিক সংকেত**: C2H4

- **ধরন**: গ্যাসীয় হরমোন

- **প্রধান কার্যাবলী**:- ফল পাকা ও পত্রপাত ঝরা ঘটায়,উচ্চমাত্রায় নোড গঠন বাধাগ্রস্ত করে,কিছু মাত্রায় নোড সংবেদনশীলতা নিয়ন্ত্রণ করে।

৪. GA (Gibberellic Acid)

- **রাসায়নিক সংকেত (GA3)**: C19H22O6

- **ধরন**: জিব্বেরেলিন

- **প্রধান কার্যাবলী**:- শিকড় ও কান্ডের কোষ প্রসারণ,নডিউলের বিকাশ ত্বরান্বিত করে,বীজ অঙ্কুরোদগমের সহায়তা করে।

৫. BR (Brassinosteroids)

- **প্রতিনিধি যৌগ**: Brassinolide - **রাসায়নিক সংকেত (Brassinolide)**: C28H48O6

- **ধরন**: স্টেরয়েড জাতীয় হরমোন

- **প্রধান কার্যাবলী**:- কোষ বিভাজন ও প্রসারণে সহায়ক,সিমবায়োটিক সিগন্যাল প্রতিক্রিয়া সমন্বয় করে,শারীরবৃত্তীয় প্রতিক্রিয়া সক্রিয় রাখে।

৬. JA (Jasmonic Acid)

- **রাসায়নিক সংকেত**: C12H18O3

- **ধরন**: অক্সিলিপিন

- **প্রধান কার্যাবলী**:- পরিবেশগত স্ট্রেসে প্রতিক্রিয়া প্রদান,অতিমাত্রায় নোড গঠনে প্রতিবন্ধক হতে পারে,সুরক্ষা সিগন্যাল ও জিন অণুব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে।

৭. ABA (Abscisic Acid)

- **রাসায়নিক সংকেত**: C15H20O4

- **ধরন**: টেরপেনয়েড

- **প্রধান কার্যাবলী**:- জলঘাটতির সময় স্টোমাটা বন্ধ করে,পরিপক্ব নোডিউলে নাইট্রোজেন ফিক্সেশন বজায় রাখে,বীজ সুপ্তাবস্থায় রাখে।

[]

কৃষিতে প্রয়োগ

[সম্পাদনা]

এই প্রক্রিয়া টেকসই কৃষি ব্যবস্থার জন্য গুরুত্বপূর্ণ, কারণ এটি রাসায়নিক সারের ব্যবহার কমিয়ে পরিবেশবান্ধব কৃষি নিশ্চিত করে।

অংশগ্রহণকারী নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদের জিনসমূহ

[সম্পাদনা]

নডিউল মরফোজেনেসিসে অনেক উদ্ভিদ ও ব্যাকটেরিয়াল জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এর মধ্যে রয়েছে:

  • NIN (Nodule Inception)
  • ENOD (Early Nodulin)
  • NSP1 ও NSP2
  • SYMRK (Symbiosis Receptor-like Kinase) – সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন প্রক্রিয়া শুরু করে।
  • CCaMK (Calcium and Calmodulin-dependent protein Kinase) – ক্যালসিয়াম সংকেতের মাধ্যমে প্রতিক্রিয়া দেয়।
  • ক্যালসিয়াম স্পাইকিং ও সাইটোকাইনিন সংকেত পথ এই প্রক্রিয়ার অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ অংশ।

ফ্ল্যাভোনয়েড সংশ্লেষণ-সম্পর্কিত জিনসমূহ (লিগুমিনাস উদ্ভিদে)

[সম্পাদনা]

লিগুমিনাস (Leguminous) জাতীয় উদ্ভিদে ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগ তৈরিতে নিচের জিনসমূহ গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে:

১. CHS (Chalcone Synthase/polyketide synthase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: পলিকেটাইড পথের(Polyketide pathway) এ এনজাইম মাধ্যমে চ্যালকোন তৈরি করে, যা ফ্ল্যাভোনয়েড সংশ্লেষণের প্রাথমিক পদার্থ।
  • মন্তব্য: এটি ফ্ল্যাভোনয়েড বায়োসিন্থেসিসের প্রথম ও নিয়ন্ত্রক এনজাইম।

২. CHI (Chalcone Isomerase/lsomochalonase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: চ্যালকোনকে ফ্ল্যাভানোনে রূপান্তর করে।
  • মন্তব্য: এটি ফ্ল্যাভোনয়েড অণুর রিং গঠনে সহায়তা করে।

৩. F3H (Flavanone 3-Hydroxylase/Naringenin 3-dioxygenase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: ফ্ল্যাভানোন থেকে ডাইহাইড্রোফ্ল্যাভোনল তৈরি করে।
  • মন্তব্য: এটি পরবর্তী ধাপে অ্যান্থোসায়ানিন সংশ্লেষণের জন্য প্রস্তুত করে।

৪. F3'H (Flavonoid 3'-Hydroxylase/Naringenin 3′-hydroxylase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: ফ্ল্যাভোনয়েড অণুর B-রিং-এ হাইড্রক্সিল গ্রুপ যোগ করে।
  • মন্তব্য: বিভিন্ন রঙের অ্যান্থোসায়ানিন উৎপাদনে ভূমিকা রাখে।

৫. DFR (Dihydroflavonol 4-Reductase/Leucocyanidin reductase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: ডাইহাইড্রোফ্ল্যাভোনলকে লিউকোকায়ানিডিনে রূপান্তর বা রিডাক্টেড করে।
  • মন্তব্য: এটি রঞ্জক সংশ্লেষণে অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ।

৬. ANS (Anthocyanidin Synthase/Leucocyanidin dioxygenase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: লিউকোকায়ানিডিন থেকে অ্যান্থোসায়ানিডিন তৈরি করে।
  • মন্তব্য: এটি রঞ্জক অ্যান্থোসায়ানিনের মূল উপাদান।

৭. UFGT (Uridine Diphosphate-Glucose:flavonoid 3-O-Glucosyltransferase/Anthocyanidin 3-O-Glucosyltransferase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: অ্যান্থোসায়ানিডিন অণুকে গ্লুকোজ সংযুক্ত করে অ্যান্থোসায়ানিনে রূপান্তর করে।
  • মন্তব্য: গ্লাইকোসাইলেশন পদ্ধতির মাধ্যমে রঞ্জকের স্থিতিশীলতা বৃদ্ধি করে।

৮. IFS (Isoflavone Synthase/2-hydroxyisoflavanone synthase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: ফ্ল্যাভানোন থেকে আইসোফ্ল্যাভোন তৈরি করে।
  • মন্তব্য: লিগুমিনাস উদ্ভিদে বিশেষভাবে গুরুত্বপূর্ণ এনজাইম।

৯. IFR (Isoflavone Reductase/Cytochrome P450 monooxygenase)

[সম্পাদনা]
  • কার্যাবলি: আইসোফ্ল্যাভোন সংশ্লেষণের পরবর্তী ধাপে কাজ করে।
  • মন্তব্য: উদ্ভিদের প্রতিরক্ষা প্রক্রিয়ায় সহায়তা করে।

ব্যবহার

[সম্পাদনা]

এই জিনসমূহ লিগুমিনাস উদ্ভিদের বিভিন্ন প্রজাতিতে যেমন সয়াবিন (Glycine max), মেডিকাগো (Medicago truncatula), ও লোটাস (Lotus japonicus)-এ গবেষণায় ব্যবহৃত হয়েছে।

অংশগ্রহণকারী রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া

[সম্পাদনা]
ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিসে অংশগ্রহণকারী রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া
ক্রমিক নাম্বার রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সমূহের নাম নডিউলেটেড হোস্ট উদ্ভিদ বা (Nodulation host) (উদাহরণস্বরূপ) শ্রেণিবিন্যাস (Taxonomic classification)
Rhizobium leguminosarumমটর, মসুরগামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Bradyrhizobium japonicumসয়াবিনআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Sinorhizobium melilotiআলফালফা (মেদিকাগো),Melilotus officinalisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Mesorhizobium lotiলোটাসআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Azorhizobium caulinodansসেশনিয়া,Sesbania rostrataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Ensifer frediiসয়াবিন, মিমোসাআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Rhizobium etliফেজিওলাস (সাধারণ বিন)গামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Rhizobium tropiciTrifolium alexandrinum,Trifolium grandiflorum,Trifolium campestre,Trifolium hirtum,Trifolium hybridum,Trifolium incarnatum,Trifolium nigrescens,Trifolium pratense,Trifolium repens,Trifolium resupinatum,Trifolium subterraneumগামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
Mesorhizobium ciceriছোলাআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০Bradyrhizobium elkaniiসয়াবিনআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১১Sinorhizobium kummerowiaeKummerowia striata (এক প্রকার legume) এশিয়ায় পাওয়া যায়আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২Rhizobium phaseoliবিন Leucaena leucocephala,Phaseolus vulgarisগামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩Rhizobium bangladeshenseCicer arietinum (ছোলা উদ্ভিদ)আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪Rhizobium acidisoliGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫Rhizobium aegyptiacumVigna unguiculataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬Rhizobium aethiopicumCajanus cajanআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭Rhizobium alamii Arachis hypogaeaগামা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৮Rhizobium album Glycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৯Rhizobium albus Arachis hypogaeaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২০Rhizobium alkalisoli Glycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২১Rhizobium altiplani Mimosa pudicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২২Rhizobium alveiGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৩Rhizobium anhuienseGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৪Rhizobium aquaticumAeschynomene indicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৫Rhizobium arachisArachis hypogaeaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৬Rhizobium arenaeArachis hypogaeaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৭Rhizobium arsenicireducensMedicago Sativaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৮Rhizobium azibenseGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
২৯Rhizobium azooxidifexVigna angularis,Vigna aconitifolia,Vigna subterraneaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩০Rhizobium binaeVigna unguiculataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩১Bradyrhizobium betaebeta vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩২Rhizobium retamaeRetama raetamআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৩Bradyrhizobium HuanghuaihaienseGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৪Rhizobium yuanmingensCorollina varia,Amphicarpaea bracteata,Reutealis trisperma,Gueldenstaedtia Fisch,Gueldenstaedtia verna,Rosa multiflora,Fockea multifloraআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৫Rhizobium calliandraeCalliandra calothyrsusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৬Rhizobium capsiciChili Pepper (Capsicum annuum)আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৭Rhizobium cauenseCajanus Cajanআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৮Rhizobium cellulosilyticumGlycine max,Medicago sativa,Pisum sativum,Lupinus albus,Lupinus polyphyllusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৩৯Rhizobium changzhienseCicer arietinumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪০Rhizobium chutanenseCicer reticulatum,Cicer echinospermum,Cicer bijugum,Cicer judaicum,Cicer microphyllumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪১Rhizobium cremeumPhaseolus lunatus,Phaseolus coccineus,Phaseolus acutifolius,Phaseolus polystachios, Phaseolus filiformisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪২Rhizobium croatiensePhaseolus coccineus,Phaseolus acutifoliusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৩Rhizobium desertiVachellia pachycerasআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৪Rhizobium dioscoreaeDioscorea villosa,Dioscorea cayenensis, Dioscorea bulbifera,Dioscorea oppositifoliaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৫Rhizobium ecuadorensePhaseolus Vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৬Rhizobium endophyticumPhaseolus angularis,Phaseolus polystachios,Phaseolus coccineusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৭Rhizobium esperanzaeCrotalaria junceaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৮Rhizobium pisiPisum Sativumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৪৯Rhizobium favelukesiiCajanus platycarpus,Cajanus indicus,Cajanus cajanifoliusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫০Rhizobium flavescensCajanus platycarpus,Cajanus cajanifoliusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫১Rhizobium freireiGlycine max,Trifolium alexandrinum,Trifolium grandiflorum, Pisum sativumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫২Rhizobium geiCajanus cajanআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৩Rhizobium glycinendophyticumGlycine soja,Glycine tomentella,Glycine clandestina,Glycine hispidulaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৪Rhizobium grahamiiCajanus scarabaeoidesআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৫Rhizobium hainanenseCentrosema brasilianum,Desmodium podocarpum,Stylosanthes venezuelensis,Tephrosia virginianaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৬Rhizobium halophytocolaSalicornia virginica,Salicornia europaea,Salicornia dolichostachya,Salicornia perennisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৭Rhizobium halotoleransVigna radiata, Medicago polymorpha,Medicago arabica,Vigna subterraneaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৮Rhizobium hedysariHedysarum coronarium,Hedysarum grandiflorumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৫৯Rhizobium hedysarumHedysarum boreale,Hedysarum sulphureumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬০Rhizobium helianthiHelianthus annuusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬১Rhizobium hidalgonensePhaseolus polystachiosআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬২Rhizobium indicumCajanus volubilis,Cajanus sericeus,Cajanus rhomboideus,Cajanus confertiflorusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৩Rhizobium jaguarisCalliandra grandiflora,Calliandra haematocephala,Calliandra californica,Calliandra tweedii,Calliandra houstonianaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৪Rhizobium kunmingensePhaseolus angustissimus,Phaseolus atropurpureus,Phaseolus brevicalyx, Phaseolus leptostachyus,Phaseolus maculatifoliusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৫Rhizobium laguerreaeLens culinarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৬Rhizobium lemnaeLemna minorআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৭Rhizobium lentisLens culinarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৮Rhizobium leucaenaeLeucaena leucocephala,Leucaena cultivars,Leucaena psyllidআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৬৯Rhizobium lusitanumPhaseolus maculatifolius,Phaseolus leptostachyusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭০Rhizobium massiliensePhaseolus vulgaris,Phaseolus maculatifoliusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭১Rhizobium mayensePhaseolus mollis, Phaseolus Pachyrrizoides, Phaseolus Esperanzaeআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭২Rhizobium mesoamericanumPhaseolus Vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৩Rhizobium mesosinicumMedicago lupulinaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৪Rhizobium miluonensephaseolus maculatifoliusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৫Rhizobium mongolenseMedicago ruthenicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৬Rhizobium multihospitiumLotus corniculatusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৭Rhizobium oryzicolaOryza longistaminata,Oryza australiensis,Oryza brachyantha,Oryza grandiglumisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৮Rhizobium oryzihabitansOryza australiensis,Oryza longistaminataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৭৯Rhizobium pakistanenseVigna mungoআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮০Rhizobium panacihumiPanax ginsengআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮১Rhizobium paranaenseProteus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮২Rhizobium phenanthrenilyticumMedicago sativaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৩Rhizobium pongamiaePongamia pinnataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৪Rhizobium populiPopulus tomentosaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৫Rhizobium populisoliPopulus albaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৬Rhizobium puerariaePueraria phaseoloidesআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৭Rhizobium qilianshanenseAstragalus membranaceusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৮Rhizobium quercicolaQuercus roburআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৮৯Rhizobium redzepoviciiPhaseolus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯০Rhizobium rhizogenesParasponia seramensis,Leucaena leucocephala,Phaseolus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯১Rhizobium rhizolycopersiciSolanum lycopersicumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯২Rhizobium rhizoryzaeOryza Sativaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৩Rhizobium ruizarguesonisPhaseolus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৪Rhizobium smilacinaeSmilacina japonicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৫Rhizobium soliPhaseolus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৬Rhizobium sophoraeSophora japonicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৭Rhizobium sophoriradicisSophora flavescensআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৮Rhizobium straminoryzaeStreptanthus polygaloidesআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
৯৯Rhizobium sullaeHedysarum coronariumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০০Rhizobium terraeGlycine max,Pisum sativum,Phaseolus vulgaris,Lens culinaris, Cicer arietinumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০১Rhizobium tibeticumTrifolium repensআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০২Rhizobium tubonenseCajanus cajanআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৩Rhizobium tumorigenesSolanum lycopersicum,Solanum tuberosum,Nicotiana tabacum,Brassica oleracea,Gossypium hirsutumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৪Rhizobium vallisVicia fabaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৫Rhizobium viscosumVigna radiataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৬Rhizobium wenxiniaeMedicago truncatulaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৭Rhizobium zeaeZea maysআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৮Ciceribacter daejeonensisCicer arietinumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১০৯Bradyrhizobium diazoefficiensGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২০Bradyrhizobium agresteGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২১Bradyrhizobium glycinisGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২২Bradyrhizobium diversitatisCajanus cajan,Phaseolus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৩Bradyrhizobium algerienseMedicago Sativaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৪Bradyrhizobium americanumLespedeza cuneata (Sericea lespedeza)আলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৫Bradyrhizobium amphicarpaeaeAmphicarpaea bracteataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৬Bradyrhizobium arachidisArachis hypogaeaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৭Bradyrhizobium archetypumsericea lespedezaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৮Bradyrhizobium australienseMacroptilium atropurpureumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১২৯Bradyrhizobium cajaniCajanus cajanআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩০Bradyrhizobium centrosematisCentrosema pubescensআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩১Bradyrhizobium cosmicumGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩২Bradyrhizobium cytisiCytisus scopariusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৩Bradyrhizobium daqingenseGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৪Bradyrhizobium denitrificansAeschynomene indicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৫Bradyrhizobium embrapenseStylosanthes guianensisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৬Bradyrhizobium erythrophleiErythrophleum fordiiআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৭Bradyrhizobium ferriligniAcacia melanoxylon,Acacia niloticaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৮Bradyrhizobium ganzhouenseGlycine clandestina, Glycine latifoliaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৩৯Bradyrhizobium guangdongenseArachia hypogaea & Lablab purpureusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪০Bradyrhizobium guangxienseAcacia mangiumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪১Bradyrhizobium hipponenseArachis stenosperma,Arachis monticolaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪২Bradyrhizobium pachyrhiziGlycine latifoliaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৩Bradyrhizobium liaoningenseGlycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৪Bradyrhizobium stylosanthisStylosanthes guianensisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৫Bradyrhizobium lablabiLablab purpureusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৬Azorhizobium doebereineraeSesbania virgataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৭Cupriavidus necatorMimosa caesalpiniaefolia,Leucaena leucocephala,Proteus vulgaris,Vigna unguiculataবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৮Methylobacterium nodulansCrotalaria glaucoides,Crotalaria podocarpa,Crotalaria perrottetiiআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৪৯Paraburkholderia mimosarumMimosa pigraবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫০Paraburkholderia nodosaPhaseolus vulgarisবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫১Paraburkholderia piptadeniaePiptadenia gonoacanthaবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫২Paraburkholderia tuberumAspalathus carnosaবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৩Devosia neptuniaeNeptunia natansআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৪Devosia yakushimensisPueraria lobataআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৫Agrobacterium salinitoleransSesbania cannabinaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৬Agrobacterium deltaenseSesbania cannabinaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৭Ensifer sojaeVigna unguiculata,Glycine maxআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৮Ensifer medicaeMedicago polymorphaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৫৯Mesorhizobium shangrilenseCaragana microphyllaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬০Mesorhizobium robiniaeRobinia pseudoacaciaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬১Mesorhizobium lotiLotus japonicusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬২Microvirga lupiniLupinus texensisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৩Microvirga lotononidisListia angolensisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৪Microvirga zambiensisListia angolensisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৫Ochrobactrum lupiniLupinus albusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৬Ochrobactrum cytisiProteus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৭Pararhizobium giardiniiProteus vulgarisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৮Pararhizobium herbaeAlbizia julibrissinআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৬৯Phyllobacterium trifoliiTrifolium repens,Lupinus albusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭০Phyllobacterium sophoraeSophora flavescensআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭১Rhizobium xinjiangensisTrigonella adscendens,Trigonella foenum-graecumআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭২Rhizobium huakuiiAstragalus sinicusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭৩Rhizobium huautlenseSesbania herbaceaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭৪Rhizobium galegueGalega officinalis,Galega orientalisআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭৫Rhizobium viciaepisum sativum,Vicia sativaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭৬Rhizobium indigoferaeIndigofera tinctoriaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭৮Rhizobium undicolaNeptunia natansআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৭৯Ensifer abriSesbania rostrata, Abrus precatoriusআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৮০Rhizobium loessenseLespedeza virginicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৮১ Azorhizobium oxalatiphilumTamarindus indicaআলফা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৮২Ciceribacter naphthalenivoransVicia fabaবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৮৩Cieribacter selenitireducensCicer arietinumবিটা-প্রোটিওব্যাকটেরিয়া
১৮৪Ensifer arboris

নাইট্রোজেফিক্স প্লাসমিড

[সম্পাদনা]

এই জিনসমূহ সাধারণত একটি বা একাধিক **Sym plasmid (pSym)** এ অবস্থান করে। উদাহরণস্বরূপ:

  • Sinorhizobium meliloti তে দুটি প্রধান প্লাসমিড থাকে: **pSymA** (nif/nod বহনকারী) এবং **pSymB**
  • Rhizobium leguminosarum এ pRL10, pRL11, In-fusion pMWnifVSU GluDH,pHY NifB-hesA,pRHB470,pRHB506,qRT-PCR-,pRP30,pDOA9,pRSF1010,pBCJ2315,HI2424,pBVIE01,pBVIE05, প্রভৃতি ভেক্টরধারী প্লাসমিড দেখা যায়।

অংশগ্রহণকারী ডায়াজোট্রোফ ব্যাকটেরিয়াল জিন অপেরন

[সম্পাদনা]

Hya জিনসমূহ এবং তাদের কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]
রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়ায় HyaA থেকে HyaZ জিনসমূহ
জিন সংশ্লিষ্ট প্রোটিন কার্যপ্রণালী
hyaAহাইড্রোজেনেজ বড় সাবইউনিটইলেকট্রন পরিবহন এবং হাইড্রোজেন গ্যাসের অক্সিডেশন
hyaBহাইড্রোজেনেজ ছোট সাবইউনিটইলেকট্রন পরিবহন এবং হাইড্রোজেন গ্যাসের অক্সিডেশন
hyaCসাইটোক্রোম b উপাদানইলেকট্রন পরিবহন চেইনে অংশগ্রহণ
hyaDপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaEপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaFপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaGপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaHপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaIপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaJপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaKপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaLপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaMপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaNপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaOপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaPপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaQপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaRপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaSপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaTপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaUপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaVপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaWপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaXপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaYপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে
hyaZপরিপক্বতা সহকারী প্রোটিনহাইড্রোজেনেজ এনজাইমের সঠিক ভাঁজ এবং কার্যকারিতা নিশ্চিত করে

Nif (Nitrogen Fixation) জিনসমূহ

[সম্পাদনা]

রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়ায় নাইট্রোজেন ফিক্সেশন প্রক্রিয়ার জন্য দায়ী জিনগুচ্ছকে Nif জিন বলা হয়। NifA থেকে শুরু করে NifZ পর্যন্ত প্রতিটি জিন নির্দিষ্ট ভূমিকা পালন করে। নিচে তাদের নাম ও কাজ উল্লেখ করা হলো:

Nif জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী
জিনের নামকাজের সংক্ষিপ্ত বর্ণনা
nifATranscriptional activator; অন্যান্য Nif জিনগুলোর কার্যক্রম শুরু করে
nifBFeMo-cofactor (FeMo-co) এর প্রাথমিক ধাপের গঠন নিশ্চিত করে
nifCCofactor সংশ্লেষণে সহায়তা করে; কিছু রাইজোবিয়ামে দেখা যায়
nifDNitrogenase এর MoFe-protein এর α-subunit তৈরি করে
nifECofactor assembly complex গঠন করে (nifN-এর সাথে মিলে)
nifFElectron carrier হিসেবে কাজ করে, electron পরিবহন করে nitrogenase-এ
nifGCofactor সংশ্লেষণে ভূমিকা রাখে (FeMo-co সংশ্লেষণ)
nifHNitrogenase এর Fe-protein গঠন করে; ATP দ্বারা চালিত ইলেকট্রন ট্রান্সফার নিশ্চিত করে
nifIRegulatory function পালন করে; O₂ গ্যাস নাইট্রোজেনেজ এনজাইম সংবেদনশীলতা সুরক্ষা করে
nifJPyruvate:flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase (ফ্ল্যাভোডোক্সিনেজ/ফেরোডোক্সিনেজ) এনজাইম উৎপন্ন করে
nifKNitrogenase MoFe-protein এর β-subunit তৈরি করে (nifD-এর সাথে জোড়ায় কাজ করে)
nifLNegative regulator; উচ্চ অক্সিজেন বা নাইট্রোজেন কনসেনট্রেশনে nifA বন্ধ রাখে
nifMFe-protein সঠিকভাবে ভাঁজ (folding) নিশ্চিত করে (chaperone protein)
nifNFeMo-co তৈরিতে জড়িত; nifE-এর সাথে কাজ করে
nifOCofactor সংযোজন ও নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রাখে
nifPPhosphatase এনজাইম; ফসফেট সমন্বয় করে
nifQMolybdenum পরিবহন ও সংযোজনে ভূমিকা রাখে
nifR(NifR1 & NifR2)নিয়ন্ত্রক (regulator) ও Transcriptional Repression জিন; সংবেদনশীলতা ও প্রতিক্রিয়াশীলতা বজায় রাখে
nifSFe-S cluster সংশ্লেষণে জড়িত
nifTCofactor সংশ্লেষণে ভূমিকা; কিছু রাইজোবিয়ামে থাকে
nifUFe-S cluster assembly এবং সংরক্ষণে সহায়তা করে
nifVHomocitrate synthase তৈরি করে, FeMo-cofactor অংশ হিসেবে কাজ করে
nifWNitrogenase এর সুরক্ষা দেয়; স্থিতিশীলতা নিশ্চিত করে
nifXFeMo-cofactor পরিবহন ও সংরক্ষণে জড়িত
nifYFeMo-cofactor পরিপক্বতায় সহায়তা করে
nifZNitrogenase প্রোটিনের সমাপ্তি ও সঠিক জটিল গঠনে সাহায্য করে

Nod জিনসমূহ ও কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]
Rhizobium প্রজাতির Nod (নোড) জিনসমূহ ও কার্যপ্রণালী
জিনের নামকাজ/ফাংশনব্যাখ্যা
nodAN-acylationNod ফ্যাক্টরে ফ্যাটি অ্যাসিড যুক্ত করে যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে গুরুত্বপূর্ণ
nodBDeacetylationচিটোবিওজের ডি-অ্যাসিটাইলেশন করে Nod ফ্যাক্টর প্রস্তুতিতে অংশগ্রহণ করে
nodCChitin oligosaccharide synthesisচিটিন ওলিগোস্যাকারাইড চেইন তৈরি করে, যা Nod ফ্যাক্টরের মূল কঙ্কাল
nodD:-(nodD1,nodD2,nodD3 & NodD4)Transcriptional activation & Regulator proteinউদ্ভিদের ফ্ল্যাভোনয়েড শনাক্ত করে এবং অন্যান্য nod জিনগুলো চালু করে
nodEFatty acid modificationফ্যাটি অ্যাসিডের গঠন পরিবর্তনের মাধ্যমে হোস্ট নির্দিষ্টতা বাড়ায় (বিশেষত ব্র্যাডিরাইজোবিয়াম-এ)
nodFFatty acid biosynthesisনির্দিষ্ট ফ্যাটি অ্যাসিড সংশ্লেষণ করে Nod ফ্যাক্টর সংশোধনে সাহায্য করে
nodGNADPH-dependent reductaseফ্যাটি অ্যাসিড সংশ্লেষণে রিডাকশন এনজাইম হিসেবে কাজ করে
nodHSulfationNod ফ্যাক্টরের টার্মিনাল রেস্টিডিউতে সালফেট যুক্ত করে
nodIEfflux proteinNod ফ্যাক্টর রুট এক্সসিউডে রপ্তানিতে ভূমিকা রাখে
nodJEfflux transporternodI-এর সাথে মিলিতভাবে Nod ফ্যাক্টর পরিবহনে সাহায্য করে
nodLO-acetylationNod ফ্যাক্টরের চেইনে অ্যাসেটিল গ্রুপ যুক্ত করে, হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সহায়ক
nodMGlucosamine synthesisফ্রুক্টোজ-৬-ফসফেট থেকে গ্লুকোসামিন-৬-ফসফেট তৈরি করে (প্রি-কার্সার উৎপাদনে সহায়ক)
nodNFunction not clearly definedসম্ভাব্যভাবে Nod ফ্যাক্টর সংশোধন বা রেগুলেশনে জড়িত
nodOCalcium-binding proteinহোস্টের ক্যালসিয়াম সংকেত ব্যবস্থায় প্রতিক্রিয়া জানায়
nodPSulfate activationNod ফ্যাক্টরে সালফেশন চালু করার জন্য সালফেট এক্টিভেশন করে
nodQATP sulfurylase subunitসালফেট এক্টিভেশনে সহায়ক ATP সালফারাইলেজ এনজাইম গঠনে কাজ করে
nodR:-(nodR1 & nodR2)Regulator protein & Transcriptional Repressionnod জিনের রেগুলেটরি ফ্যাক্টর হিসেবে কাজ করে
nodSMethyltransferaseNod ফ্যাক্টরের O-মিথাইলেশন করে
nodTEfflux pumpNod ফ্যাক্টরের স্রোত নিয়ন্ত্রণে সহায়ক
nodUCarbamoyltransferaseNod ফ্যাক্টরে কার্বাময়েল গ্রুপ যুক্ত করে
nodVSensor kinaseফ্ল্যাভোনয়েড সংবেদন করে signal transduction pathway চালু করে
nodWResponse regulatornodV এর সাথে জোড়ায় কাজ করে জিন অ্যাক্টিভেশন ঘটায়
nodXFucosylationNod ফ্যাক্টরের fucose যুক্ত করে (বিশেষত *Rhizobium leguminosarum* bv. *viciae* তে)
nodYHypothetical proteinবর্তমানে কাজ অস্পষ্ট, ধারণা করা হয় nodO সম্পর্কিত
nodZFucosyltransferaseα-1,6-fucose যুক্ত করে Nod ফ্যাক্টরে হোস্ট নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে

Noe (Nodulation Outer Envelope) জিনসমূহ

[সম্পাদনা]

রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়ায় NoeA থেকে NoeZ পর্যন্ত বিভিন্ন জিন বিদ্যমান, যেগুলো নোড ফ্যাক্টরের গঠন ও সংশ্লেষণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। নিচে এই জিনসমূহের নাম ও কার্যপ্রণালী তালিকাভুক্ত করা হলো:

রাইজোবিয়াম প্রজাতির NoeA থেকে NoeZ জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী
জিনের নাম কার্যপ্রণালী সংশ্লিষ্ট ব্যাকটেরিয়া প্রজাতি
noeANod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করেRhizobium leguminosarum
noeBNod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িতSinorhizobium meliloti
noeCNod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করেBradyrhizobium japonicum
noeDNod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেMesorhizobium loti
noeENod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করেRhizobium etli
noeFNod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেSinorhizobium fredii
noeGNod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িতBradyrhizobium elkanii
noeHNod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করেRhizobium tropici
noeINod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করেMesorhizobium ciceri
noeJNod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেAzorhizobium caulinodans
noeKNod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করেEnsifer fredii
noeLNod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেRhizobium phaseoli
noeMNod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িতBradyrhizobium japonicum
noeNNod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করেSinorhizobium meliloti
noeONod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করেRhizobium leguminosarum
noePNod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেMesorhizobium loti
noeQNod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করেRhizobium etli
noeRNod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেSinorhizobium fredii
noeSNod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িতBradyrhizobium elkanii
noeTNod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করেRhizobium tropici
noeUNod ফ্যাক্টরের ও-অ্যাসেটাইলেশন প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করেMesorhizobium ciceri
noeVNod ফ্যাক্টরের কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেAzorhizobium caulinodans
noeWNod ফ্যাক্টরের সুলফেশন প্রক্রিয়ায় জড়িত, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা বৃদ্ধি করেEnsifer fredii
noeXNod ফ্যাক্টরের ও-কার্বক্সিমেথিলেশন ঘটায়, যা উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়ায় প্রভাব ফেলেRhizobium phaseoli
noeYNod ফ্যাক্টরের গ্লুকুরোনিক অ্যাসিড সংশ্লেষণে জড়িতBradyrhizobium japonicum
noeZNod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট মিথাইলেশন ঘটায়, যা হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে সাহায্য করেSinorhizobium meliloti

Nol জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]

Nol (Nodulation Outer Layer) জিনসমূহ হল রাইজোবিয়াম প্রজাতির অতিরিক্ত জিন, যেগুলো nod জিনসমূহের পরিপূরক হিসেবে কাজ করে। এরা হোস্ট নির্দিষ্টতা, nod জিনের প্রকাশ, লাইপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ ও সংবেদনশীলতা বৃদ্ধিতে সহায়তা করে।

Nol জিনসমূহের তালিকা ও কাজ
জিনের নামপ্রধান কার্যপ্রণালীব্যাখ্যা / মন্তব্য
NolAট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণNodD-এর বিকল্প; ফ্ল্যাভোনয়েডে প্রতিক্রিয়াশীল nod জিনগুলোর নিয়ন্ত্রক
NolBলিপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণLPS পরিবর্তন করে হোস্ট প্রতিক্রিয়া কমায়
NolCলিপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণLPS biosynthesis pathway এ অংশগ্রহণ করে
NolDসিগন্যাল ট্রান্সডাকশন প্রোটিনNod সংকেত প্রক্রিয়াজাতকরণে সাহায্য করে
NolEসেক্রেশন প্রোটিনNod ফ্যাক্টরের বহিঃনিঃসরণ (efflux) সম্পাদন করে
NolFহোস্ট নির্দিষ্টতাNod ফ্যাক্টরের মডিফিকেশন করে নির্দিষ্ট উদ্ভিদের সঙ্গে সঙ্গতিপূর্ণ করে
NolGঅজানা / সন্দেহভাজন ফাংশনএখনও বিশ্লেষণাধীন
NolHট্রান্সপোর্ট প্রোটিনNod ফ্যাক্টর বা সংশ্লিষ্ট লিপিড বহিঃনিঃসরণে সাহায্য করে
NolIট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণNod / Nol pathway নিয়ন্ত্রণে জড়িত
NolJট্রান্সক্রিপশন সহায়কNod pathway-তে সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন সহায়ক
NolKহোস্ট নির্দিষ্টতা সংশোধনকারীস্পেসিফিক লেগিউমের Nod ফ্যাক্টর নির্ধারণে সাহায্য করে
NolLসেক্রেশন সংশ্লিষ্ট প্রোটিনNod উপাদান বহিঃনিঃসরণ সহজতর করে
NolMপরিবহন ও সংশ্লেষণঅ্যানকিলোমাইসিনজাতীয় যৌগ সংশ্লেষণ
NolNএনজাইম্যাটিক সংশ্লেষণNod ফ্যাক্টরের চেইন মডিফাই করে
NolOঅজানা / গবেষণাধীনতথ্য সীমিত
NolPরেগুলেটরি প্রোটিনNod সিগন্যাল ও ফ্ল্যাভোনয়েড সংকেত মিলানে সাহায্য করে
NolQসিগন্যাল সংবেদনশীলতাহোস্ট উদ্ভিদের প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে অংশগ্রহণ
NolRrepressing regulatorNodD রেগুলেশন বন্ধ করে, যাতে বেশি nod gene না প্রকাশ পায়
NolSঅজানা / সন্দেহভাজন এনজাইমআরও গবেষণার প্রয়োজন
NolTATP-binding কাসেট (ABC) ট্রান্সপোর্টারNod উপাদান পরিবহন
NolUসেক্রেশন সিস্টেম প্রোটিনNod ফ্যাক্টর বহিঃনিঃসরণ
NolVঅজানা প্রোটিননতুনভাবে আবিষ্কৃত; কাজ নির্দিষ্ট নয়
NolWহোস্ট নির্দিষ্টতা মডিফায়ারNod ফ্যাক্টরের সুনির্দিষ্টতা বাড়ায়
NolXসিগন্যাল ফ্যাক্টর সংশ্লেষণNod ফ্যাক্টরের কার্যকারিতা বৃদ্ধি করে
NolYলাইপোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণব্যাকটেরিয়াল পৃষ্ঠের গঠন উন্নত করে
NolZহোস্ট ইন্টারঅ্যাকশন সাপোর্টারহোস্ট উদ্ভিদের অভ্যন্তরে সফল উপনিবেশ গঠনে সহায়তা

Nop জিনসমূহ

[সম্পাদনা]

রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়াগুলোর মধ্যে Nop (Nodulation outer proteins) এবং Nol (Nodulation locus) নামক জিনগুলো হোস্ট উদ্ভিদের সাথে যোগাযোগ স্থাপন, প্রতিক্রিয়া সৃষ্টি এবং সফল ইনফেকশন নিশ্চিতকরণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।

Nop জিনসমূহের নাম ও কাজ
জিন পূর্ণরূপ/নাম কাজ / কার্যপ্রণালী মন্তব্য
NopANodulation outer protein Aটাইপ III সিক্রেশন সিস্টেমের pilus গঠন করেহোস্ট উদ্ভিদের সাথে সংযুক্তি ও সংকেত প্রেরণ
NopBNodulation outer protein Bটাইপ III সিস্টেম pilus-এ অংশগ্রহণকারী একাধিক রূপসংযুক্তির জন্য প্রোটিন রূপান্তর
NopCNodulation outer protein Cহোস্ট কোষে প্রবেশ করে জিন এক্সপ্রেশন প্রভাবিত করেহোস্ট রেসপন্স সক্রিয় করে
NopDNodulation outer protein Dইউবিকুইটিন লিগেস অ্যাক্টিভিটি সম্পন্ন effectorহোস্ট প্রতিরক্ষা হ্রাস করে
NopENodulation outer protein Eইনফেকশন ও নডিউল গঠনের সহায়কহোস্ট নির্ভর প্রতিক্রিয়া সৃষ্টি করে
NopFNodulation outer protein Fঅজানা কার্যপ্রণালীকিছু রাইজোবিয়ামে উপস্থিত
NopGNodulation outer protein Gহোস্টের মধ্যে সংক্রমণ ও সংশ্লেষ প্রক্রিয়ায় অংশগ্রহণ করেপরিপূর্ণ ব্যাখ্যা অনুপস্থিত
NopHNodulation outer protein Hটাইপ III সিক্রেশন সিস্টেমের সহায়ক উপাদানসিগন্যাল রেগুলেশন সম্পন্ন
NopINodulation outer protein Iহোস্ট সেল ওয়ালে প্রভাব ফেলেইনফেকশন থ্রেড গঠনে অংশগ্রহণ
NopJNodulation outer protein Jসেরিন প্রোটিজ অ্যাক্টিভিটি সম্পন্ন effectorহোস্ট প্রতিরক্ষা সংকেত দমন করে
NopLNodulation outer protein Lহোস্ট ম্যাপ কাইনেজ পথ প্রতিরোধ করেইমিউন প্রতিক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে সহায়ক
NopMNodulation outer protein Mইউবিকুইটিন E3 লিগেস কার্য সম্পন্ন করেহোস্ট প্রতিরক্ষা দমন করে
NopPNodulation outer protein Pহোস্ট ফসফোরাইলেশন সাইটের সাথে সংশ্লেষহোস্ট নির্ভর nod কার্যক্রম প্রভাবিত
NopTNodulation outer protein Tসিরিন প্রোটেজ ও এক্সটেনশন এনজাইম হিসেবে কাজ করেহোস্ট সেল মেমব্রেনে প্রভাব ফেলে
NopXNodulation outer protein Xটাইপ III সিক্রেশন সিস্টেমের পোর গঠন করেপ্রোটিন ইনজেকশন নিশ্চিত করে
NopZNodulation outer protein Zহোস্ট প্রোটিন কাটে (cysteine protease)ইমিউন প্রতিক্রিয়া হ্রাস করে

LPS সংশ্লিষ্ট জিনসমূহ (LpsA–LpsZ)

[সম্পাদনা]

লাইপোপলিস্যাকারাইড (LPS) হলো রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার বাইরের পর্দার একটি গুরুত্বপূর্ণ উপাদান, যা নডিউল গঠনে গাছের সাথে সংযোগে সহায়তা করে। নিচে LpsA থেকে LpsZ পর্যন্ত জিনসমূহের তালিকা ও কার্যপ্রণালী দেয়া হলো:

Rhizobium প্রজাতির LPS সংশ্লিষ্ট জিন (LpsA–LpsZ)
জিনের নামকার্যপ্রণালী/ফাংশনশ্রেণিবিন্যাস
LpsAO-antigen গঠন এবং LPS কোর শৃঙ্খলে চিনি সংযোজনগ্লাইকোসিল ট্রান্সফারেজ
LpsBকোর অলিগোস্যাকারাইড গঠনের জন্য প্রাথমিক চিনি সংযুক্তিগ্লাইকোসিল ট্রান্সফারেজ
LpsCর‍্যামনোজ (rhamnose) সংযোজনের জন্য দায়ীচিনির পরিবাহী এনজাইম
LpsDO-antigen পরিবহন ও বহির্মুখী স্থানান্তরট্রান্সপোর্ট প্রোটিন
LpsEকোর অঞ্চল সম্পূর্ণকরণে সহায়তা করেঅ্যানজাইমেটিক সংশ্লেষণ
LpsFহাইড্রোফোবিক গঠন রক্ষণে ভূমিকা রাখেঝিল্লি-সম্পর্কিত প্রোটিন
LpsGস্যালফেটেড চিনি যুক্ত করে যা হোস্ট নির্ধারণে ভূমিকা রাখেস্যালফোট্রান্সফারেজ
LpsHLPS biosynthesis pathway-এ মধ্যবর্তী পদার্থকে রূপান্তর করেএনজাইম
LpsIবহির্মুখী শৃঙ্খল তৈরির প্রাথমিক ধাপে যুক্তচিনির সংশ্লেষক
LpsJLPS কে স্থায়িত্ব প্রদান করেস্ট্রাকচারাল প্রোটিন
LpsKঝিল্লি পারমিয়েজ ট্রান্সপোর্টারে অংশগ্রহণ করেপরিবাহক প্রোটিন
LpsLদীর্ঘ চেইনযুক্ত O-antigen সংশ্লেষে কাজ করেপলিস্যাকারাইড সিনথেসিস
LpsMবিশেষ শর্করা সংযোজন করে (উদাহরণস্বরূপ ফুকোজ)চিনির সংশ্লেষক
LpsNশিকড়ের ইমিউন প্রতিক্রিয়া এড়াতে সাহায্য করেলিপিড সংশ্লেষক
LpsOO-antigen পুনর্গঠন করেপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষক
LpsPঝিল্লি স্থিতিশীলতা রক্ষা করেঝিল্লি প্রোটিন
LpsQক্যালসিয়াম-নির্ভর সংকেতের মাধ্যমে নিয়ন্ত্রণরেগুলেটরি প্রোটিন
LpsRট্রান্সক্রিপশন রেগুলেটরনিয়ন্ত্রণ জিন
LpsSসিগন্যাল রিসিভার হিসেবে কাজ করেসিগন্যালিং প্রোটিন
LpsTট্রান্সপোর্টার হিসেবে কাজ করেপরিবাহী প্রোটিন
LpsUতাপমাত্রা বা পরিবেশগত চাপের প্রতিক্রিয়ায় সক্রিয় হয়উত্তেজনা সাড়া প্রদানকারী জিন
LpsVবহির্মুখী শৃঙ্খল প্রতিরক্ষা কাঠামোপলিস্যাকারাইড প্রোটিন
LpsWওলিগোমার ফর্ম করেস্ট্রাকচারাল উপাদান
LpsXবাইরের আবরণ গঠনে সহায়তা করেআবরণ সংশ্লেষক
LpsYঅ্যান্টিজেন উপস্থাপনে ভূমিকা রাখেরিসেপ্টর সম্পর্কিত প্রোটিন
LpsZসম্পূর্ণ LPS biosynthesis pathway এর শেষ ধাপে কাজ করেটার্মিনাল এনজাইম

Nol জিনসমূহ (NolR থেকে NolZ)

[সম্পাদনা]

ডায়াজোট্রোফিক নডিউল অর্গানোজেনেসিস প্রক্রিয়ায় কিছু Nol (nodulation-related) জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে। এগুলি সাধারণত রাইজোবিয়াম প্রজাতির জিনোম বা প্লাসমিডে থাকে এবং নডিউল গঠনের সময় বিশেষত Nod ফ্যাক্টর সংশ্লেষণ, নিয়ন্ত্রণ ও হোস্ট-ব্যাকটেরিয়া মিথষ্ক্রিয়ায় কাজ করে।

Nol (Nodulation Outer-related Locus) জিনসমূহ ও তাদের কাজ
জিনের নামপ্রজাতি (উদাহরণস্বরূপ)প্রধান কাজ / ফাংশন
NolRRhizobium leguminosarum, Sinorhizobium melilotiNod জিন ট্রান্সক্রিপশন রেপ্রেসর; NodD দ্বারা সক্রিয়করণকে দমন করে, Nod ফ্যাক্টর উৎপাদন নিয়ন্ত্রণ করে
NolABradyrhizobium japonicumট্রান্সক্রিপশন অ্যাক্টিভেটর, nodD2 ও nodW নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রাখে; হোস্ট-নির্দিষ্ট প্রতিক্রিয়ায় জড়িত
NolBBradyrhizobium spp.সম্ভাব্য এক্সোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণ বা পরিবহন সংশ্লিষ্ট; এখনও বিস্তারিতভাবে অনিশ্চিত
NolCBradyrhizobium japonicumপ্রোটিন পরিবহন বা LPS সংশ্লেষণে সম্ভাব্য ভূমিকা
NolDBradyrhizobium japonicumNod ফ্যাক্টর সংশ্লেষণে জড়িত এনজাইম; হোস্ট নির্দিষ্টতা নির্ধারণে ভূমিকা
NolEBradyrhizobium japonicumLPS সংশ্লেষণে অংশগ্রহণ করে; নডিউল সংক্রমণে সহায়তা করে
NolFBradyrhizobium spp.LCO গঠন বা সংশ্লেষণে সম্ভাব্য ভূমিকা; বিস্তারিত অজানা
NolGBradyrhizobium japonicumসম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন সংশ্লিষ্ট
NolHBradyrhizobium spp.Nod ফ্যাক্টরের গ্লাইকোসাইলেশন বা এক্সটেনশন মডিফিকেশন
NolIBradyrhizobium japonicumNod ফ্যাক্টরের গঠন পরিবর্তনে ভূমিকা
NolJBradyrhizobium spp.হোস্ট নির্দিষ্টতা ও Nod ফ্যাক্টর পরিবহণ সংশ্লিষ্ট
NolKRhizobium spp.Nod ফ্যাক্টর পরিবহন ও মডিফিকেশন
NolLBradyrhizobium spp.এনজাইম মডিফায়ার হিসেবে কাজ করে
NolNBradyrhizobium japonicumNod ফ্যাক্টর পরিবহন ও এক্সটেনশন
NolORhizobium spp.এক্সোপলিস্যাকারাইড সংশ্লেষণে জড়িত
NolTBradyrhizobium spp.ফ্যাক্টর পরিবহন; সংক্রমণ ফিলামেন্টে ভূমিকা
NolUBradyrhizobium spp.Nod ফ্যাক্টরের নির্দিষ্ট রূপান্তর বা পরিবহন
NolVBradyrhizobium spp.হোস্ট নির্দিষ্ট পরিবেশে গঠনীয় পরিবর্তন আনে
NolWBradyrhizobium spp.বায়োকেমিক্যাল রেগুলেটরি ভূমিকা পালন করে
NolXBradyrhizobium japonicumNod ফ্যাক্টর পরিবহনে অংশগ্রহণ
NolYBradyrhizobium spp.হোস্ট নির্দিষ্ট সংকেত আদান-প্রদান সংক্রান্ত
NolZBradyrhizobium spp.সংশ্লেষণ উপশমকারী প্রোটিন বা এনজাইম

EPS সংশ্লিষ্ট জিনসমূহ (EpsA - EpsZ)

[সম্পাদনা]

Rhizobium প্রজাতির ব্যাকটেরিয়াগুলোর বহিঃকোষীয় পলিস্যাকারাইড (EPS) সংশ্লেষণ ও নির্গমনে EpsA থেকে EpsZ পর্যন্ত বিভিন্ন জিন জড়িত। এই বহিঃকোষীয় উপাদান উদ্ভিদের শিকড়ে সংযুক্তি, ইনফেকশন থ্রেড গঠন ও নডিউল অর্গানোজেনেসিসে সহায়তা করে।

EpsA থেকে EpsZ পর্যন্ত জিন ও তাদের কাজ
জিনের নাম কাজ/ফাংশন
EpsAট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটর, eps জিন অপেরন নিয়ন্ত্রণ করে
EpsBফসফোরাইলেশনযুক্ত রেগুলেটরি প্রোটিন; EpsA-এর সাথে কাজ করে
EpsCসাইটোপ্লাজমিক গ্লাইকোসাইল ট্রান্সফারেজ; মূল কাঠামো নির্মাণে জড়িত
EpsDমেমব্রেন-বাউন্ড ট্রান্সফারেজ, লিপিড লিংকেজে সহায়তা করে
EpsEএক্সোপলিস্যাকারাইড এক্সপোর্টে সহায়তাকারী
EpsFরিপিটার ইউনিটে শাখা যুক্ত করে
EpsGমেমব্রেন চ্যানেল প্রোটিন (Wzx টাইপ ফ্লিপেজ)
EpsHপলিস্যাকারাইড সাবইউনিট পলিমারাইজ করে
EpsIপলিমার চেইনের দৈর্ঘ্য নিয়ন্ত্রণে ভূমিকা রাখে
EpsJবহিঃনির্গমন প্রোটিন, বহিঃপ্রকাশ নিশ্চিত করে
EpsKসুগার মডিফাইং এনজাইম
EpsLগ্লাইকোসিড লিংক তৈরি করে
EpsMমেমব্রেন সংলগ্ন ট্রান্সপোর্ট সিস্টেম
EpsNএক্সপোর্ট সিগন্যাল শনাক্তকরণে কাজ করে
EpsOপলিস্যাকারাইড প্রক্রিয়াকরণ এনজাইম
EpsPবহিঃপ্রকাশ কমপ্লেক্সের অংশ
EpsQগ্লাইকান সাইক্লিং প্রোটিন
EpsRট্রান্সক্রিপশনাল রিপ্রেসার
EpsSপরিবেশগত সংকেত শনাক্তকারী সেন্সর কাইনেজ
EpsTATP-binding ক্যাসেট প্রোটিন (ABC Transporter)
EpsUবহিঃচাপ শনাক্তকারী এনজাইম
EpsVশৃঙ্খলা নির্ধারক প্রোটিন
EpsWপলিস্যাকারাইড বাইন্ডিং ডোমেইন
EpsXবহিঃপ্রকাশ চ্যানেল প্রোটিন
EpsYস্ট্রাকচারাল স্ট্যাবিলাইজার
EpsZসর্বশেষ ধাপে পলিমার এক্সপোর্টে সহায়তাকারী

Exo (ExoA–ExoZ) জিনসমূহ ও কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]

Sinorhizobium meliloti এবং অন্যান্য Rhizobium প্রজাতিতে, **ExoA থেকে ExoZ পর্যন্ত জিনসমূহ** এক্সোপলিস্যাকারাইড (EPS I বা succinoglycan) সংশ্লেষণের জন্য দায়ী, যা নডিউল অর্গানোজেনেসিস ও ইনফেকশন থ্রেড গঠনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।

Exo জিনসমূহ ও তাদের কাজ
জিনের নামকাজের বর্ণনা
ExoAUDP-গ্লুকোজ ডিহাইড্রোজেনেজ – প্রাথমিকভাবে শর্করার অ্যাক্টিভেশন ঘটায়
ExoBগ্যালাক্টোজ মিউটেজ – EPS মনোমার শর্করার পরিবর্তন ঘটায়
ExoCগ্লুকোজ-১-ফসফেট ইউরিডাইল ট্রান্সফারেজ – UDP-glucose সংশ্লেষণ করে
ExoDসম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক প্রোটিন – EPS সংশ্লেষণের ওপর প্রভাব ফেলে
ExoEপলিস্যাকারাইড শৃঙ্খল বৃদ্ধিতে অংশগ্রহণকারী এনজাইম
ExoFসাইক্লিক বা শাখাবিশিষ্ট EPS গঠন নিয়ন্ত্রণ করে
ExoGএক্সোপলিস্যাকারাইড পরিবহন সংশ্লিষ্ট প্রোটিন
ExoHএক্সোপলিস্যাকারাইডের অ্যাসিটাইলেশন এনজাইম
ExoIGlycosyl transferase – মনোমার যোগ করে
ExoJGlycosyl transferase – বিশেষ করে গ্যালাক্টোজ সংযুক্ত করে
ExoKএক্সোপলিস্যাকারাইড ডিগ্রেডেশন এনজাইম – EPS এর দৈর্ঘ্য নিয়ন্ত্রণ করে
ExoLস্থানান্তর সংশ্লিষ্ট প্রোটিন
ExoMমূল EPS কোর গঠন করে
ExoNগ্লুকুরোনিক অ্যাসিড যুক্ত করে EPS শৃঙ্খলে
ExoOস্থানান্তর ও বহির্গমন সংশ্লিষ্ট
ExoPসেক্রেশন কমপ্লেক্সের অংশ
ExoQলিপিড আংটিতে সংযুক্তি ঘটাতে সাহায্য করে
ExoRনিয়ন্ত্রণকারী প্রোটিন – EPS সংশ্লেষণকে উপনিয়ন্ত্রিত করে
ExoSসেন্সর কাইনেজ – রেগুলেটরি সিস্টেমে অংশগ্রহণ করে
ExoTসম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন
ExoUঅ্যান্টিজেনিক নির্ধারক
ExoVসিগন্যাল ট্রান্সডাকশন সংশ্লিষ্ট
ExoWরেজিস্ট্রি ও সিগন্যালিং মডুলে কাজ করে
ExoXঅজানা কার্যসম্পন্ন (সম্ভবত রেগুলেটরি)
ExoYগ্লাইকান সুনির্দিষ্ট এনজাইম
ExoZসুনির্দিষ্ট ফাংশন অজ্ঞাত, তবে EPS সংশ্লেষণে অংশ নিতে পারে

PraA to PraZ জিনসমূহ

[সম্পাদনা]

ডায়াজোট্রোফিক নডিউল অর্গানোজেনেসিসে, **PraA থেকে PraZ** পর্যন্ত বিভিন্ন জিন গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এই জিনগুলো সাধারণত **Rhizobium** প্রজাতির ব্যাকটেরিয়াগুলির মধ্যে নাইট্রোজেন স্থিরীকরণের প্রক্রিয়াকে নিয়ন্ত্রণ করে। নীচে প্রতিটি জিনের নাম, ফাংশন এবং কাজের প্রণালী দেওয়া হলো:

PraA থেকে PraZ পর্যন্ত জিনসমূহ
ক্রমিক জিনের নাম ফাংশন কাজের প্রণালী
**PraA**প্রোটিন কোয়ালিটি কন্ট্রোল এবং এনজাইম সংশ্লেষণএটি রাইজোবিয়াম প্রজাতির মধ্যে প্রোটিনের সঠিক গঠন নিশ্চিত করতে সাহায্য করে।
**PraB**প্রোটিন অঙ্গবিন্যাস নিয়ন্ত্রণপ্রোটিনগুলোর সঠিক মলিকুলার গঠন নিশ্চিত করে, যাতে তারা তাদের নির্দিষ্ট কাজ সঠিকভাবে করতে পারে।
**PraC**রিজোলাইট প্রস্তুতির জন্য গুরুত্বপূর্ণএটি রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া নডিউল গঠনের জন্য সাহায্য করে এবং নোড ফ্যাক্টর উৎপাদন নিয়ন্ত্রণ করে।
**PraD**সেলুলার বিভাজন এবং স্কেলিং নিয়ন্ত্রণএটি সেলুলার বিভাজন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে সাহায্য করে, যা নডিউল গঠন এবং শিকড়ে ব্যাকটেরিয়া ইনফেকশন বৃদ্ধি করতে সহায়ক।
**PraE**পদার্থের পরিবহন নিয়ন্ত্রণএটি বিভিন্ন পদার্থের পরিবহন নিয়ন্ত্রণে সহায়ক এবং এনার্জি স্থানান্তরের জন্য গুরুত্বপূর্ণ।
**PraF**নাইট্রোজেন স্থিরীকরণ সাহায্যকারী এনজাইম প্রোটিনএটি নাইট্রোজেন স্থিরীকরণে ব্যবহৃত নাইট্রোজেনেজ এনজাইমের সংশ্লেষণে সাহায্য করে।
**PraG**হোস্ট নির্দিষ্টতা নিয়ন্ত্রণএটি ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদের শিকড়ে প্রবেশ করতে সাহায্য করে এবং এনজাইমের সক্রিয়করণের মাধ্যমে ইনফেকশন থ্রেড গঠন পরিচালনা করে।
**PraH**লিপিড সাইথেসিস এবং গ্র্যাম-নেগেটিভ প্রোটিনএটি ব্যাকটেরিয়া কোষের ভেতরে গঠন এবং পারমিয়াবিলিটি নিয়ন্ত্রণে সাহায্য করে।
**PraI**নডিউল গঠন পরবর্তী পর্যায়ে গুরুত্বপূর্ণ প্রোটিনএটি নডিউল গঠনের পরবর্তী পর্যায়ে, বিশেষভাবে ব্যাকটেরিয়ার জীবনচক্রের জন্য গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।
১০**PraJ**ব্যাকটেরিয়া শিকড়ে প্রবেশের জন্য সহায়ক প্রোটিনএটি ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদের শিকড়ে প্রবেশ করার জন্য সাহায্য করে এবং ইনফেকশন থ্রেড গঠন করতে সহায়ক।
১১**PraK**সেলুলার কোষমembrane সন্নিবেশ ও অনুপ্রবেশ প্রক্রিয়াএটি সেলুলার কোষের মেমব্রেনের সংমিশ্রণ নিয়ন্ত্রণ করে এবং কোষের অনুপ্রবেশ প্রক্রিয়া সহায়ক হয়।
১২**PraL**পিপিডি (পেপটাইড) ফ্যাক্টর সংশ্লেষণএটি পিপিডি নামক ফ্যাক্টর সংশ্লেষণের জন্য প্রয়োজনীয় এবং নডিউল গঠন প্রক্রিয়া সহায়ক।
১৩**PraM**মেটাবলিক প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণএটি ব্যাকটেরিয়া কোষের শক্তির উৎপাদন ও স্থানান্তর নিয়ন্ত্রণ করে, যা ব্যাকটেরিয়া ইনফেকশন গঠনের জন্য প্রয়োজনীয়।
১৪**PraN**এনজাইম নিয়ন্ত্রণ এবং প্রোটিন সংযোজনএটি এনজাইম এবং প্রোটিনের গঠন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ করে, যা নাইট্রোজেন স্থিরীকরণের প্রক্রিয়ায় সহায়ক।
১৫**PraO**কোষীয় প্রবাহ নিয়ন্ত্রণএটি কোষের অভ্যন্তরে প্রবাহ নিয়ন্ত্রণ করে, যার মাধ্যমে ব্যাকটেরিয়া বিভিন্ন স্তরের কার্যক্রম পরিচালনা করতে পারে।
১৬**PraP**লিপিড সংশ্লেষণ সহায়ক প্রোটিনএটি লিপিড সংশ্লেষণ প্রক্রিয়ায় সহায়ক, যা ব্যাকটেরিয়ার কোষের স্ট্রাকচার গঠন করে।
১৭**PraQ**এনজাইম সংশ্লেষণ নিয়ন্ত্রণএটি বিভিন্ন এনজাইমের সংশ্লেষণ নিয়ন্ত্রণ করে, যা নডিউল গঠনে গুরুত্বপূর্ণ।
১৮**PraR**নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের জন্য প্রয়োজনীয়এটি নাইট্রোজেন ফিক্সেশন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।
১৯**PraS**পরিবেশগত সংকেত সনাক্তকরণ এবং রিসেপ্টরএটি পরিবেশের সংকেত সনাক্ত করে, যা ব্যাকটেরিয়া শিকড়ে প্রবেশের সময় প্রয়োজন।
২০**PraT**সংক্রমণ থ্রেড গঠন প্রক্রিয়াএটি সংক্রমণ থ্রেড গঠন করতে সাহায্য করে, যা ব্যাকটেরিয়াকে উদ্ভিদ কোষে প্রবেশ করতে সক্ষম করে।
২১**PraU**সেলুলার বৃদ্ধি নিয়ন্ত্রণএটি কোষের বৃদ্ধি এবং বিভাজন প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণে সহায়ক।
২২**PraV**শিকড়ে ইনফেকশন থ্রেডের গঠন ও সম্প্রসারণএটি শিকড়ে ইনফেকশন থ্রেড গঠন ও তার সম্প্রসারণে সহায়ক।
২৩**PraW**পরিবহন সিস্টেম নিয়ন্ত্রণএটি ব্যাকটেরিয়া কোষের মাধ্যমে পদার্থ পরিবহন নিয়ন্ত্রণে সাহায্য করে।
২৪**PraX**কোষের স্থিতিশীলতা নিয়ন্ত্রণএটি কোষের স্থিতিশীলতা বজায় রাখে এবং সঠিকভাবে বিভাজন করতে সহায়ক।
২৫**PraY**প্রোটিন ফোল্ডিং এবং কোষীয় পরিবেশের জন্য উপযুক্তএটি কোষের অভ্যন্তরীণ প্রোটিন গঠনের প্রক্রিয়া নিয়ন্ত্রণ করে।
২৬**PraZ**কোষীয় সংকেত সৃষ্টির জন্য প্রয়োজনীয়এটি কোষের সংকেত সৃষ্টি প্রক্রিয়া এবং ফাংশনালাইজেশনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে।

Rhizobium প্রজাতিতে Allantoin catabolism সংশ্লিষ্ট জিনসমূহ

[সম্পাদনা]
AllA, AllB ও AllC জিনের নাম, কার্যপ্রণালী ও সংশ্লিষ্ট প্রজাতি
জিনের নাম এনজাইমের নাম ফাংশন / রাসায়নিক রূপান্তর ধারক প্রজাতি
allA Ureidoglycolate urea-lyase Ureidoglycolate → Glyoxylate + Urea Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allB Allantoinase Allantoin → Allantoate Rhizobium leguminosarum bv. trifolii (strain WSM1325)
allC (সম্ভাব্য) Allantoate amidohydrolase Allantoate → Ureidoglycine + NH₃ Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841)
allD Allantoate amidohydrolase Allantoate → Ureidoglycine + NH₃ Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841)
allE Ureidoglycine aminohydrolase Ureidoglycine → Ureidoglycolate + NH₃ Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841)
allF Ureidoglycolate amidohydrolase Ureidoglycolate → Glyoxylate + NH₃ Rhizobium leguminosarum bv. viciae (strain 3841)
allG Ureidoglycolate urea-lyase Ureidoglycolate → Glyoxylate + Urea Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allH Glyoxylate reductase Glyoxylate → Glycolate Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allI Urease Urea → 2 NH₃ + CO₂ Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allJ Urea transporter Urea পরিবহন কোষে Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allK Allantoin permease Allantoin পরিবহন কোষে Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allL Allantoate transporter Allantoate পরিবহন কোষে Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allM Ureidoglycine transporter Ureidoglycine পরিবহন কোষে Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allN Ureidoglycolate transporter Ureidoglycolate পরিবহন কোষে Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allO Glyoxylate transporter Glyoxylate পরিবহন কোষে Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allP Glycolate oxidase Glycolate → Glyoxylate + H₂O₂ Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allQ Transcriptional regulator (AllR) Allantoin catabolism জিনসমূহের নিয়ন্ত্রণ Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allR Transcriptional regulator (AllS) Allantoin catabolism জিনসমূহের নিয়ন্ত্রণ Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allS Transcriptional regulator Allantoin catabolism pathway নিয়ন্ত্রণ Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allT Hypothetical protein সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক ভূমিকা Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allU Hypothetical protein সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allV Hypothetical protein সম্ভাব্য এনজাইমেটিক ভূমিকা Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allW Hypothetical protein সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allX Hypothetical protein সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক ভূমিকা Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allY Hypothetical protein সম্ভাব্য এনজাইমেটিক ভূমিকা Rhizobium etli (strain ATCC 51251)
allZ Hypothetical protein সম্ভাব্য পরিবহন প্রোটিন Rhizobium etli (strain ATCC 51251)

ygeA-ygeZ জিনসমূহের তালিকা ও কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]
ygeA থেকে ygeZ পর্যন্ত জিনসমূহের নাম ও পরিচিত কার্যপ্রণালী
জিনের নামপরিচিত কার্যপ্রণালী (অন্যান্য ব্যাকটেরিয়ায়)
ygeAL- ও D-homoserine বিপাকের সাথে জড়িত একটি অ্যামাইনো অ্যাসিড রেসেমেজ; *E. coli* তে বায়োফিল্ম গঠনে ভূমিকা রাখে।
ygeBygeB একটি এনজাইম যা কোএনজাইম A এর সাথে সম্পর্কিত এবং পেন্টোজ ফসফেট রুটে একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এটি সেলুলোজের বিপাককে সমর্থন করে এবং ব্যাকটেরিয়ার বৃদ্ধি ও উন্নয়নে সহায়ক।
ygeCygeC একাধিক বায়োফিল্ম গঠন প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রাখে। এটি কোষের বাইরের স্তরে কাজ করে এবং বিভিন্ন পরিবেশে জীবিত থাকতে সহায়ক ভূমিকা পালন করে।
ygeDygeD ব্যাকটেরিয়াল কেলোলোসিস বা কোষের মধ্যে ক্যালসিয়াম শোষণের প্রক্রিয়ায় যুক্ত। এটি সেলুলোজ সমৃদ্ধ খাদ্যসূত্রের প্রতি প্রতিক্রিয়া দেখায়।
ygeEygeE একটি ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন যা জীবাণু কোষের আয়নাগুলি প্রবাহিত করতে সাহায্য করে, বিশেষত আয়নাগুলির বিপাকের জন্য ব্যবহৃত।
ygeFygeF একাধিক শারীরিক প্রতিক্রিয়া নির্ণয়ে সহায়ক ভূমিকা পালন করে, বিশেষ করে কোষের অভ্যন্তরে শর্করা শক্তি সঞ্চয়ের জন্য।
ygeGygeG ক্যালসিয়াম আয়নাসহ মেটাল আয়নাগুলির পরিবহন প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ। এটি জীবাণু কোষের বৃদ্ধি সমর্থন করতে সহায়ক।
ygeHygeH গ্লাইকোলাইসিসের সঙ্গে সম্পর্কিত, এবং এটি ব্যাকটেরিয়ার এনার্জি বিপাক প্রক্রিয়াতে অংশগ্রহণ করে।
ygeIygeI একটি এনজাইম যা ব্যাকটেরিয়ার মেমব্রেন স্ট্রাকচার সঠিক রাখতে সহায়ক। এটি বায়োফিল্ম গঠন প্রক্রিয়ায় অবদান রাখে।
ygeJygeJ ডিএনএ রিপ্লিকেশন এবং রিকম্বিনেশন প্রক্রিয়ায় ভূমিকা রাখে এবং সেলুলোজ উৎপাদনের জন্য গুরুত্বপূর্ণ হতে পারে।
ygeKygeK ব্যাকটেরিয়ার সেলুলোজ প্রোটিন স্তরের সমন্বয় করতে সহায়ক ভূমিকা রাখে, এবং এটি শর্করা বিপাকের জন্য গুরুত্বপূর্ণ।
ygeLygeL হল একটি ক্যালসিয়াম সক্রিয় ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন, যা ব্যাকটেরিয়ার বৃদ্ধির জন্য প্রয়োজনীয় মিনারেলগুলি পরিবহনে সহায়ক।
ygeMygeM গ্লাইকোলাইটিক প্রবাহের নিয়ন্ত্রণ করতে সহায়ক একটি প্রোটিন, যা কোষে শক্তি সরবরাহের জন্য ব্যবহৃত হয়।
ygeNygeN একটি ট্রান্সপোর্ট প্রোটিন যা আয়নাগুলির শোষণ এবং সেলুলোজ উৎপাদনের প্রক্রিয়াতে সহায়ক।
ygeOygeO কোষের বাইরের শর্করা প্রতিক্রিয়া নিশ্চিত করতে সহায়ক এবং কোষের উন্নয়নে ভূমিকা রাখে।
ygePygeP গ্লাইকোলাইসিসের সাথে সম্পর্কিত এবং এনার্জি প্রবাহের সমন্বয়ে ভূমিকা রাখে।
ygeQygeQ কোষের মেমব্রেনে শক্তির পরিমাপের জন্য ব্যবহৃত হয় এবং মাইক্রোবিয়াল জীবনের জন্য অপরিহার্য।
ygeRygeR ব্যাকটেরিয়া কোষের চাপ সহনশীলতার উন্নতির জন্য গুরুত্বপূর্ণ একটি প্রোটিন।
ygeSygeS একটি গুরুত্বপূর্ণ কোষীয় প্রোটিন, যা জীবাণু কোষের জীবিত থাকাকে দীর্ঘস্থায়ী করতে সহায়ক।
ygeTygeT প্রোটিন টপোলজির সঠিক নিয়ন্ত্রণ নিশ্চিত করতে সহায়ক।
ygeUygeU কোষের কোয়ালিটি নিয়ন্ত্রণ এবং মেমব্রেনের পরিবহন ব্যবস্থার জন্য গুরুত্বপূর্ণ।
ygeVygeV ব্যাকটেরিয়া মেমব্রেনের পরিবর্তন এবং শক্তি পুনরায় সৃষ্টি নিশ্চিত করে।
ygeW*E. coli* তে ক্যাটাবলিক প্রক্রিয়ায় জড়িত; ATP উৎপাদনে ভূমিকা রাখে।
ygeXygeX কোষীয় শক্তির অগ্রগতি এবং বিপাকীয় ভারসাম্যকে সমর্থন করে।
ygeYygeY একটি ব্যাকটেরিয়া কোষের গঠন পরিবর্তন এবং বায়োফিল্ম গঠন প্রক্রিয়ায় ভূমিকা রাখে।
ygeZygeZ কোষের জীবিত থাকার জন্য একটি গুরুত্বপূর্ণ প্রোটিন।

arcA থেকে arcD পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]
রাইজোবিয়াম প্রজাতিতে arcA থেকে arcD পর্যন্ত জিন ও তাদের কার্যপ্রণালী
জিন সংশ্লিষ্ট এনজাইম কার্যপ্রণালী মন্তব্য
arcA আর্জিনিন ডিইমিনেজ আর্জিনিনকে সাইট্রুলিন ও অ্যামোনিয়াতে রূপান্তর করে অক্সিজেন-নিম্ন পরিবেশে সক্রিয়; arcA-র অভাবে নাইট্রোজেন স্থিরীকরণ কমে যায়
arcB ক্যাটাবলিক অর্নিথিন কার্বাময়েলট্রান্সফারেজ (cOTCase) সাইট্রুলিনকে অর্নিথিন ও কার্বাময়েল ফসফেটে রূপান্তর করে arcA-র অভাবে cOTCase কার্যকারিতা হ্রাস পায়
arcC কার্বামেট কিনেজ কার্বাময়েল ফসফেটকে অ্যামোনিয়া ও CO₂-এ রূপান্তর করে ATP উৎপাদন করে arcC প্রোটিনের আকার ~৩৪ কিলোডালটন; কার্যপ্রণালী Pseudomonas aeruginosa-এর অনুরূপ
arcD আর্জিনিন/অর্নিথিন এক্সচেঞ্জার আর্জিনিন ও অর্নিথিনের মধ্যে ইলেকট্রোনিউট্রাল বিনিময় সম্পন্ন করে শক্তি রূপান্তরে সহায়তা করে; ArcD প্রোটিন একটি বহুপাস ঝিল্লি প্রোটিন

GltA থেকে GltZ পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যাবলি

[সম্পাদনা]

GltA থেকে GltZ পর্যন্ত বিভিন্ন জিন TCA চক্র ও অ্যামাইনো অ্যাসিড সংশ্লেষণ প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে, বিশেষ করে নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময়। নিচে প্রতিটি জিনের নাম ও ফাংশন উল্লেখ করা হলো:

  • GltA – সাইট্রেট সিনথেজ: অ্যাসিটাইল-CoA ও অক্সালোঅ্যাসেটেটের বিক্রিয়ার মাধ্যমে সাইট্রেট তৈরি করে।
  • GltB – গ্লুটামিন সিনথেটেজের বড় সাবউনিট: অ্যামোনিয়া থেকে গ্লুটামিন তৈরিতে সহায়তা করে।
  • GltC – গ্লুটামিন সিনথেটেজ নিয়ন্ত্রক প্রোটিন: gltAB অপারনের ট্র্যান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ করে।
  • GltD – গ্লুটামেট সিঙ্কথেজের ছোট সাবইউনিট: গ্লুটামিন থেকে গ্লুটামেট তৈরি করে NADPH এর সহায়তায়।
  • GltF – সংশ্লিষ্ট প্রোটিন, তবে অনেক সময় এটি ছদ্মজিন হিসেবে বিবেচিত হয়; কার্যকারিতা এখনও অস্পষ্ট।
  • GltG – ABC পরিবাহক সিস্টেমের ATP-বাইন্ডিং সাবইউনিট: অ্যামিনো অ্যাসিড পরিবহনে জড়িত।
  • GltH – ABC পরিবাহক সিস্টেমের পারমিয়েজ সাবউনিট: গ্লুটামেট পরিবহনের জন্য ঝিল্লিতে ছিদ্র সৃষ্টি করে।
  • GltI – গ্লুটামেট/অ্যাস্পার্টেট পরিবাহক প্রোটিনের পেরিপ্ল্যাজমিক লিগ্যান্ড-বাইন্ডিং সাবইউনিট।
  • GltJ – একই ABC পরিবহন ব্যবস্থার অংশ: গ্লুটামেট পরিবহনে সহায়তা করে।
  • GltK – পরিবহন ব্যবস্থার সমন্বয়ক সাবইউনিট: পরিবহন কাঠামোর স্থায়িত্ব বজায় রাখে।
  • GltL – গ্লুটামেট সংশ্লেষণের সহায়ক প্রোটিন: পরিবাহক এনজাইমের কার্যকারিতা উন্নত করে।
  • GltM – পরিবাহী প্রোটিন কমপ্লেক্সের সহায়ক উপাদান হিসেবে কাজ করে।
  • GltS – সোডিয়াম-সামঞ্জস্যপূর্ণ গ্লুটামেট/অ্যাস্পার্টেট পরিবাহক, কো-ট্রান্সপোর্ট সিস্টেমে অংশগ্রহণ করে।
  • GltT – পরিবাহক সিস্টেমের সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রক উপাদান।
  • GltX – গ্লুটামেট-টিআরএনএ লাইগেজ: গ্লুটামেটকে tRNA(Glu)-এর সঙ্গে যুক্ত করে।
  • GltZ – অনিশ্চিত কার্যকারিতা; কিছু ক্ষেত্রে এটি ছদ্মজিন হিসেবে পরিগণিত হয়, তবে গ্লুটামেট সংশ্লেষণ ব্যবস্থায় সংশ্লিষ্ট বলে ধারণা করা হয়।

AcnA থেকে AcnZ পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]
রাইজোবিয়াম প্রজাতিতে AcnA থেকে AcnZ পর্যন্ত জিন ও তাদের কার্যপ্রণালী
জিন সংশ্লিষ্ট এনজাইম কার্যপ্রণালী মন্তব্য
acnA আকোনিটেজ A সাইট্রেটকে আইসোসাইট্রেটে রূপান্তর করে (reversible) আয়রন সালফার ক্লাস্টারযুক্ত এনজাইম; TCA চক্রে গুরুত্বপূর্ণ
acnB আকেোনিটেজ B একইভাবে সাইট্রেটকে আইসোসাইট্রেটে রূপান্তর করে পরিবেশভেদে acnA/acnB একে অপরকে পরিপূরকভাবে কাজ করে
acnC ফার্মাকোলজিক্যাল কার্যকারিতার জন্য চিন্হিত (কমন নয়) সম্ভবত অক্সিডেটিভ স্ট্রেসে অপ্রত্যক্ষ ভূমিকা পালন করে Rhizobium-এ প্রকাশ খুব সীমিত; গবেষণার অধীন
acnD হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন TCA চক্র বা সংশ্লিষ্ট বিপাকীয় পথে সম্ভাব্য ভূমিকা বর্তমানে অনির্দিষ্ট কার্যপ্রণালী; জিনোম প্রেডিকশনের মাধ্যমে শনাক্ত
acnE TCA সহায়ক ফ্যাক্টর E আকেোনিটেজের কার্যকারিতায় সহায়তা করে Cofactor হিসেবে কাজ করতে পারে; Escherichia coli-তে গবেষণা হয়েছে
acnF আয়রন-সালফার ক্লাস্টার সংশ্লেষ প্রোটিন আকেোনিটেজে Fe-S ক্লাস্টার স্থাপন ও রক্ষণাবেক্ষণে সহায়তা করে নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময় Fe-S প্রোটিনগুলো গুরুত্বপূর্ণ
acnG হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন সম্ভবত আকেোনিটেজ সংশ্লিষ্ট কোনো উপ-একক বা সহায়ক ফ্যাক্টর গবেষণাধীন; কিছু প্রজাতিতে TCA চক্র সহায়ক হিসেবে উল্লেখ আছে
acnH অক্সোগ্লুটারেট ডিকার্বক্সিলেজ সংশ্লিষ্ট প্রোটিন TCA বাইপাসে সংশ্লিষ্ট ভূমিকা পালন করতে পারে বিভিন্ন Rhizobium প্রজাতির জিনোমে অনুজ্ঞাত
acnI ফিউমারেট সংশ্লিষ্ট প্রোটিন TCA চক্রে ফিউমারেট-সংশ্লিষ্ট এনজাইমগুলোর সহায়তায় কাজ করতে পারে সেকেন্ডারি মেটাবোলাইট নিয়ন্ত্রণেও ভূমিকা থাকতে পারে
acnJ আয়রন সালফার প্রোটিন সংশ্লিষ্ট আকেোনিটেজে Fe-S ক্লাস্টার ইনসার্শনে ভূমিকা নাইট্রোজেন ফিক্সেশনে এই ধরণের প্রোটিন গুরুত্বপূর্ণ
acnK রিডাক্টেজ/অক্সিডোরিডাক্টেজ ধরনের প্রোটিন TCA চক্রে NADH/NAD+ ভারসাম্য বজায় রাখতে সহায়তা করে শক্তি বিপাক ও ইলেকট্রন পরিবহণ চেইনের সাথে সম্পর্কিত
acnL হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন সম্ভাব্যভাবে TCA চক্রের সহায়ক বিপাকপথে ভূমিকা গবেষণাধীন; বিভিন্ন soil bacterium এ শনাক্ত হয়েছে
acnM ফিউমারেজ সংশ্লিষ্ট সহ-প্রোটিন ফিউমারেট থেকে ম্যালেট উৎপাদনে ফিউমারেজকে সহায়তা করে কিছু Rhizobium ও Sinorhizobium sp. এ দেখা যায়
acnN ম্যালেট সংশ্লিষ্ট বিপাকীয় প্রোটিন ম্যালেট ডিহাইড্রোজেনেজ কার্যকারিতায় সহায়ক শক্তি উৎপাদন চক্রে গৌণ ভূমিকা পালন করে
acnO সম্ভাব্য এনজাইম ইনহিবিটার TCA চক্রে বিপাকীয় প্রবাহ নিয়ন্ত্রণে অংশ নিতে পারে রেগুলেটরি প্রোটিন হিসেবে বিবেচিত
acnP ফসফোএনোলপাইরুভেট/অক্সালোসেটেট সংশ্লিষ্ট প্রোটিন বিপাকীয় রূপান্তরে সহায়তা করে প্রাইমারি মেটাবোলিক ফ্লাক্সে ভূমিকা থাকতে পারে
acnQ হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন অজানা কার্যপ্রণালী জিনোম অ্যানোটেশনভিত্তিক জিন; পরীক্ষামূলক প্রমাণ প্রয়োজন
acnR ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটর acn অপারনের জিন এক্সপ্রেশন নিয়ন্ত্রণ করে নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের সময় জিন নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ
acnS ম্যালেট সংশ্লিষ্ট হেল্পার প্রোটিন ম্যালেট সংশ্লিষ্ট প্রক্রিয়াকে প্রভাবিত করে শক্তি উৎপাদন ও NAD(P)H ভারসাম্যে ভূমিকা থাকতে পারে
acnT ফিউমারেট ট্রান্সপোর্টার ফিউমারেট ট্রান্সপোর্টে সহায়তা করে সেলুলার পরিবেশে মেটাবোলাইট পরিবহণে কার্যকর
acnU হাইপোথেটিক্যাল প্রোটিন TCA চক্রের বাইপাসে সম্ভাব্য অংশগ্রহণকারী কিছু soil bacterium-এ প্রেডিক্টেড
acnV সাইট্রেট বাইন্ডিং প্রোটিন সাইট্রেট সংশ্লিষ্ট বিপাকে সহায়ক নাইট্রোজেনেস কার্যকলাপে অপ্রত্যক্ষ ভূমিকা
acnW ট্রান্সপোর্টার/চ্যানেল প্রোটিন TCA সংশ্লিষ্ট উপাদানগুলোর পরিবহণে অংশ নিতে পারে বহুপাস ঝিল্লি প্রোটিন হিসেবে বিবেচিত
acnX হাইপোথেটিক্যাল রিডাক্টেজ প্রোটিন সম্ভবত NAD(P)+ এর রিসাইক্লিং-এ সহায়তা করে শক্তি রূপান্তরে গৌণ ভূমিকা পালন করতে পারে
acnY আকেোনিটেজ-সম্পর্কিত সম্ভাব্য সহায়ক জিন TCA চক্রে কার্যকারিতা বৃদ্ধিতে অংশগ্রহণ গবেষণাধীন; TCA রেগুলেশন প্রোটিন হিসেবে চিহ্নিত
acnZ সংশ্লিষ্টতা অনিশ্চিত সম্ভাব্যভাবে TCA বাইপাস বা অন্য বিপাকীয় পথে অংশগ্রহণ করে গবেষণাধীন জিন; Rhizobium sp. বা অনুরূপ প্রজাতিতে শনাক্ত

icdA থেকে icdZ পর্যন্ত জিনসমূহ ও তাদের কার্যপ্রণালী

[সম্পাদনা]
রাইজোবিয়াম প্রজাতিতে icdA থেকে icdZ পর্যন্ত জিন ও তাদের কার্যপ্রণালী
জিন সংশ্লিষ্ট এনজাইম কার্যপ্রণালী মন্তব্য
icdA আইসোসাইট্রেট ডিহাইড্রোজেনেজ (NADP⁺ নির্ভর) আইসোসাইট্রেটকে α-কেটোগ্লুটারেট, CO₂ এবং NADPH-এ রূপান্তর করে TCA চক্রে শক্তি উৎপাদনের জন্য গুরুত্বপূর্ণ; এনজাইমটি Mg²⁺ বা Mn²⁺ সহকারে সক্রিয় হয়
icdB NAD⁺ নির্ভর আইসোসাইট্রেট ডিহাইড্রোজেনেজ বিকল্পভাবে NAD⁺ ব্যবহার করে একই প্রতিক্রিয়া ঘটায় অক্সিডেটিভ স্ট্রেস পরিস্থিতিতে সক্রিয় হতে পারে
icdC রেগুলেটরি সাবইউনিট (সম্ভাব্য) icdA ও icdB জিনের অভ্যন্তরীণ নিয়ন্ত্রণ করতে পারে এখনও সম্পূর্ণ কার্যপ্রণালী জানা যায়নি
icdD অজানা কার্যসম্পন্ন প্রোটিন (আইসোসাইট্রেট সংশ্লিষ্ট) আইসোসাইট্রেট বিপাকের পার্শ্বপ্রতিক্রিয়া রোধ করতে সহায়তা করে গবেষণাধীনে; এক্সপ্রেশন মাত্রা নাইট্রোজেন ঘাটতিতে বৃদ্ধি পায়
icdE ট্রান্সপোর্টার প্রোটিন TCA চক্রের অন্তর্বর্তী উপাদান পরিবহনে সহায়তা করে ঝিল্লি সংযুক্ত বহুপাস প্রোটিন; শক্তি পরিবহন ব্যবস্থার সাথে সম্পর্কযুক্ত
icdF স্ট্রেস-রেসপন্স প্রোটিন আইসোসাইট্রেট ডিহাইড্রোজেনেজ কার্যকারিতা স্ট্যাবিলাইজ করে উচ্চ তাপমাত্রা বা অম্লীয় pH-তে কার্যকর
icdG কোএনজাইম সংশ্লেষ এনজাইম NADP⁺ সংশ্লেষণে সহায়তা করে যা icdA-র সাবস্ট্রেট নিয়ন্ত্রিত উপায়ে NADP⁺ স্তর বজায় রাখে
icdH ফসফোরিলেশন নিয়ন্ত্রক icdA এনজাইমের সক্রিয়তা ফসফোরিলেশন দ্বারা নিয়ন্ত্রণ করে শক্তি ও সংকেত পরিবহণের সাথে সম্পর্কিত
icdI আইসোসাইট্রেট সংশ্লিষ্ট অক্সিডোরিডাক্টেজ আইসোসাইট্রেট মেটাবোলিজমে ইলেকট্রন স্থানান্তর ঘটায় অজানা মেকানিজম; অক্সিজেন সীমিত পরিবেশে দেখা যায়
icdZ অ্যান্টিসেন্স রেগুলেটরি RNA (সম্ভাব্য) icdA–icdI গোষ্ঠীর mRNA স্তর নিয়ন্ত্রণে সহায়তা করে gene silencing বা feedback loop-এর অংশ হতে পারে

আরও দেখুন

[সম্পাদনা]

বিভাগ:জীববিজ্ঞান বিভাগ:জিনতত্ত্ব বিভাগ:ব্যাকটেরিয়া বিভাগ:উদ্ভিদবিজ্ঞান বিভাগ:সিমবায়োসিস বিভাগ:জীবাণুবিজ্ঞান

Oldroyd, G.E.D.; Downie, J.A. (২০০৮)। Coordinating Nodule Morphogenesis with Rhizobial Infection in Legumes। খণ্ড ৫৯। Annual Review of Plant Biology। পৃ. ৫১৯–৫৪৬। ডিওআই:10.1146/annurev.arplant.59.032607.092839

Roy, S. (২০২০)। Celebrating 20 years of genetic discoveries in legume nodulation and symbiotic nitrogen fixation। খণ্ড ৩২। পৃ. ১৫–৪১। ডিওআই:10.1105/tpc.19.00279 {{বই উদ্ধৃতি}}: |সাময়িকী= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)

তথ্যসূত্র

[সম্পাদনা]

Downie, J.A. (২০১০)। The roles of Nod factors and exopolysaccharides in the Rhizobium–legume symbiosis। খণ্ড ৩৪। পৃ. ৪৩১–৪৫৩। ডিওআই:10.1111/j.1574-6976.2010.00241.x {{বই উদ্ধৃতি}}: |সাময়িকী= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)

Long, Steven R. (২০০১)। Rhizobium–legume nodulation: Life together in the underground। খণ্ড ১০০। পৃ. ১৯১–১৯৩। ডিওআই:10.1016/S0092-8674(01)81838-3 {{বই উদ্ধৃতি}}: |সাময়িকী= উপেক্ষা করা হয়েছে (সাহায্য)

  • NCBI Gene Database
  • KEGG Nitrogen Metabolism Pathway
  • Molecular Plant-Microbe Interactions Journal
  • UniProt Database

বহিঃসংযোগ

[সম্পাদনা]

[[বিষয়শ্রেণী:নাইট্রোজেন সংবদ্ধকরণ [[বিষয়শ্রেণী: লেগোহিমোগ্লোবিন

  1. লিগুমিনাস উদ্ভিদের শিকড়ে রাইজোবিয়াম সংক্রমণের সূচনা প্রক্রিয়া

    লিগুমিনাস (Leguminous) জাতীয় উদ্ভিদের শিকড়ে রাইজোবিয়াম (Rhizobium) প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া সংক্রমণ একটি জটিল ও সুনির্দিষ্ট সিমবায়োটিক প্রক্রিয়া, যা ধাপে ধাপে সংঘটিত হয়। নিচে এই প্রক্রিয়াটির বিস্তারিত বর্ণনা প্রদান করা হলো:

    ১. ফ্ল্যাভোনয়েড নিঃসরণ

    লিগুমিনাস উদ্ভিদের শিকড় থেকে নির্গত হয় কিছু নির্দিষ্ট রাসায়নিক যৌগ, যেগুলোকে বলা হয় ফ্ল্যাভোনয়েড (Flavonoids)। এই যৌগগুলো মাটিতে উপস্থিত রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার দৃষ্টি আকর্ষণ করে এবং একপ্রকার সংকেত হিসেবে কাজ করে। ভিন্ন ভিন্ন উদ্ভিদ ভিন্ন ধরনের ফ্ল্যাভোনয়েড নিঃসরণ করে, যা প্রজাতি-নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে।

    ২. Nod ফ্যাক্টরের সৃষ্টি

    ফ্ল্যাভোনয়েড যৌগগুলো রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়ার মধ্যে অবস্থিত NodD নামক প্রোটিনকে সক্রিয় করে। NodD প্রোটিন সক্রিয় হলে, Nod জিনসমূহের কার্যকারিতা শুরু হয় এবং রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া Nod Factors (লিপো-কাইটিন ওলিগোস্যাকারাইড) তৈরি করে, যা উদ্ভিদ শিকড়ের সংকেত গ্রহণকারী রিসেপ্টর দ্বারা শনাক্ত হয়।

    ৩. NFR1 ও NFR5 রিসেপ্টরের মাধ্যমে সংকেত গ্রহণ

    উদ্ভিদের মূলরোমে অবস্থিত NFR1 ও NFR5 নামক রিসেপ্টর (Lysin Motif-type receptor kinases) Nod Factor গুলিকে শনাক্ত করে। এই শনাক্তকরণের মাধ্যমে উদ্ভিদ বুঝতে পারে যে বন্ধুত্বপূর্ণ ব্যাকটেরিয়া প্রবেশ করতে যাচ্ছে, এবং এই সিগন্যালের মাধ্যমে উদ্ভিদের কোষের অভ্যন্তরে সিমবায়োটিক সংকেত সঞ্চালন পথ (Symbiotic Signaling Pathway) সক্রিয় হয়।

    ৪. Lectin প্রোটিনের ভূমিকা

    Lectin হলো একটি গ্লাইকোপ্রোটিন যা রাইজোবিয়ামের লিপোপলিস্যাকারাইড শনাক্ত করতে সাহায্য করে। এটি ব্যাকটেরিয়ার স্বীকৃতি ও নির্দিষ্টতা বজায় রাখার ক্ষেত্রে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।Rhizobium-এর পৃষ্ঠের কার্বোহাইড্রেট / লিপোপলিস্যাকারাইড চিহ্নিত করে, ফলে গাছটি উপযুক্ত ব্যাকটেরিয়াকে “বন্ধু” হিসেবে চিনতে পারে বিশেষ করে Root-specific lectins।Lectin রিসেপ্টর (যেমন Lectin receptor-like kinases – LecRKs) Rhizobium-এর Nod factor চিহ্নিত করার পর সেল মেমব্রেনে সংকেত প্রেরণ করে। এর মাধ্যমে calcium spiking ও অন্যান্য সেকেন্ডারি মেসেঞ্জার সক্রিয় হয়। পরবর্তী ধাপে transcription factors (যেমন NIN, NSP1, NSP2) সক্রিয় হয়, যা নডিউল গঠনের জন্য প্রয়োজনীয় জিন চালু করে।Lectin প্রোটিন root hair curling প্রক্রিয়ায় ভূমিকা রাখে, যেখানে মূলের চুল Rhizobium কে ফাঁদে ফেলে। এভাবে একটি infection thread তৈরি হয়, যার মাধ্যমে Rhizobium কোষের ভেতরে প্রবেশ করে।Lectin দ্বারা সক্রিয় সিগনাল কাসকেড cortical cell গুলোতে পুনঃবিভাজন ঘটায়। এর ফলে মূলের ভেতরে nodule primordium (গাঁটের প্রাথমিক গঠন) তৈরি হয়।Infection thread cortical cell-এর দিকে প্রসারিত হয়। Lectin প্রোটিন infection thread-এর দিকনির্দেশনা (guidance) ও Rhizobium-এর স্থায়িত্ব রক্ষা করে। শেষ পর্যন্ত Rhizobium cortical cell-এ প্রবেশ করে এবং bacteroid আকার ধারণ করে।প্রতিটি Rhizobium symbiosome মেমব্রেনে আবদ্ধ হয়। Lectin প্রোটিন symbiosome মেমব্রেনের স্থিতিশীলতা বজায় রাখতে সাহায্য করে। গঠিত নডিউলে Rhizobium nitrogenase এনজাইম ব্যবহার করে N₂ → NH₃ রূপান্তর করে, যা গাছ ব্যবহার করে প্রোটিন সংশ্লেষণে।

    ৫. ইনফেকশন পকেট (Infection Pocket) গঠন

    Nod ফ্যাক্টর শনাক্ত হবার পর মূলরোমের সংযোগস্থলে রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়াগুলো জমা হয়ে Infection Pocket গঠন করে। এই পকেট হল এমন একটি স্থান যেখানে ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের কোষে প্রবেশের প্রস্তুতি নেয়।

    ৬. ইনফেকশন থ্রেড গঠন

    Infection Pocket গঠনের পর, উদ্ভিদের অ্যাপিডার্মিস কোষে Infection Thread নামক একটি টিউব-সদৃশ গঠন তৈরি হয়। এই থ্রেডের মধ্য দিয়ে রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের অভ্যন্তরে প্রবেশ করে।Rhizobium মূলের চারপাশে ভেসে বেড়ায় এবং root hair curling ঘটায় (Nod factor দ্বারা উদ্দীপিত)। Curl হওয়া root hair-এর ফাঁকা জায়গায় Rhizobium জমা হয়ে একটি infection pocket তৈরি হয়। 👉 এভাবে উদ্ভিদ Rhizobium কে প্রথমে “আটকায়” যেন সঠিকভাবে ভেতরে প্রবেশ করানো যায়, বলতে গেলে Bacterial trapping এ সহায়তা করে।Infection pocket-এর ভেতরে Rhizobium দ্রুত গুণবৃদ্ধি করে। Lectin ও অন্যান্য surface protein-এর মাধ্যমে উদ্ভিদ ব্যাকটেরিয়ার ওপর নিয়ন্ত্রণ বজায় রাখে, যেন অবাঞ্ছিত অণুজীব ভেতরে প্রবেশ না করতে পারে। 👉 এটি এক ধরনের screening checkpoint।Infection pocket হলো ঘনিষ্ঠ সংকেত বিনিময়ের স্থান। এখানে Rhizobium Nod factor, exopolysaccharide, lipopolysaccharide ইত্যাদি নিঃসরণ করে, আর উদ্ভিদ calcium spiking ও ROS signaling দ্বারা সাড়া দেয়। 👉 এই ধাপে mutual compatibility নিশ্চিত হয়।Infection pocket থেকে উদ্ভিদ কোষের প্রাচীরে একটি cell wall invagination তৈরি হয়। এখান থেকে infection thread (টিউবের মতন কাঠামো) গড়ে উঠে, যা Rhizobium কে ভেতরের দিকে পরিচালিত করে। 👉 Infection pocket basically infection thread-এর “launching pad”।Infection pocket Rhizobium কে root cortex-এর দিকে প্রবেশের জন্য দিকনির্দেশনা দেয়। Pocket → thread → cortical cell → nodule primordium—এই ধাপে ব্যাকটেরিয়ার চলাচল infection pocket থেকেই শুরু হয়।

    ৭. ইনফেক্টোসোম (Infectosome) গঠন

    রাইজোবিয়াম ব্যাকটেরিয়া যখন মূলরোমের অ্যাপিডার্মিস কোষে প্রবেশ করে, তখন বিভিন্ন সিগন্যালিং ও কোষীয় উপাদান মিলে Infectosome নামক একটি মাল্টি-প্রোটিন কমপ্লেক্স তৈরি করে। এর কাজ হল: যখন Rhizobium উদ্ভিদের মূলচুলে (root hair) আসে, তখন Nod factor perception ঘটে। গাছের receptor kinases (যেমন NFR1, NFR5) সক্রিয় হয়। এর ফলেই infectosome assembly শুরু হয় – একাধিক signaling protein মেমব্রেনের কাছে এসে জড়ো হয়।Infectosome প্রোটিন কমপ্লেক্স Nod factor signaling pathway চালু করে। এতে Ca²⁺ oscillation / calcium spiking ও downstream transcription factors (যেমন NSP1, NSP2, NIN) সক্রিয় হয়। 👉 এর মাধ্যমে plant cell “symbiotic program” চালু করে।Infectosome root hair-এর cytoskeleton (actin, microtubule) পুনর্গঠন করে। এর ফলে root hair curling ঘটে, যেখানে infection pocket গঠিত হয়। 👉 অর্থাৎ infectosome হলো infection pocket তৈরির জন্য “controller”।Infectosome cell wall remodeling enzyme (cellulose synthase, expansins) ও ROS regulators নিয়ন্ত্রণ করে। এর মাধ্যমে infection pocket থেকে cell wall invagination হয়, যা পরে infection thread এ রূপ নেয়। 👉 এখানে infectosome infection thread-এর “launching engine”।Infectosome cortical cell-এর দিকে infection thread পরিচালনা করে। Actin filaments ও vesicle trafficking (exocytosis) নিয়ন্ত্রণ করে infection thread-এর টিপে নতুন মেমব্রেন যোগ করে। 👉 ফলে thread সঠিক দিকে বাড়তে পারে।Infectosome Rhizobium কে infection thread-এর ভেতরে রাখতে সাহায্য করে। Cortical cell-এ পৌঁছালে Rhizobium “endocytosis-like process” এর মাধ্যমে plant cell-এ ঢোকে এবং symbiosome তৈরি হয়। Infectosome এই endocytosis প্রক্রিয়ারও সমন্বয় সাধন করে।Infectosome-এর সংকেত cortical cell division উদ্দীপিত করে। ফলে nodule primordium তৈরি হয়। পরবর্তীতে symbiosome-এ Rhizobium bacteroid আকার নেয় এবং nitrogen fixation শুরু করে। 👉 এই পুরো প্রক্রিয়ার ভিত্তি স্থাপন করে infectosome।

    ইনফেকশন ড্র্যোপ্লেট (Infection droplet 💧 💧)

    Infection droplet কী? এটি হলো Rhizobium–legume symbiosis প্রক্রিয়ায় cortical cell বা নডিউল প্রাইমোর্ডিয়ামের ভেতরে গঠিত একটি ক্ষুদ্র ফোটা-সদৃশ কাঠামো। Infection droplet মূলত infection thread-এর অগ্রভাগে (tip) তৈরি হয়। এখান থেকে Rhizobium উদ্ভিদ কোষের ভেতরে endocytosis-এর মত প্রক্রিয়ায় প্রবেশ করে। 👉 অর্থাৎ, Infection droplet হলো bacteria release chamber, যেখান থেকে Rhizobium cortical cell-এ ছেড়ে দেওয়া হয়। Infection thread elongation-এর শেষে droplet তৈরি Root hair থেকে শুরু হওয়া infection thread cortical cell পর্যন্ত পৌঁছায়। Cortical cell-এর ভেতরে পৌঁছালে thread-এর অগ্রভাগ ফুলে উঠে infection droplet তৈরি হয়। Infection droplet-এর ভেতরে প্রচুর Rhizobium জমা হয়। Plant cell wall ও plasma membrane remodeling হয়, যাতে ব্যাকটেরিয়া release করা যায়।Infection droplet থেকে Rhizobium ধীরে ধীরে host cell cytoplasm-এ endocytosis-এর মাধ্যমে মুক্তি পায়। প্রতিটি মুক্ত হওয়া ব্যাকটেরিয়া উদ্ভিদের মেমব্রেন দ্বারা আবৃত হয়ে আলাদা compartments তৈরি করে। 👉 এই compartments-কে বলা হয় symbiosome।Symbiosome-এর ভেতরে প্রবেশের পর Rhizobium ধীরে ধীরে রূপান্তরিত হয়ে bacteroid আকার নেয়। এরা নাইট্রোজেন ফিক্সেশনের জন্য প্রস্তুত হয়। বলতে গেলে ইনফেকশন ড্র্যোপ্লেট Bacteroid differentiation পদ্ধতিতে সহায়ক ভূমিকা পালন করে।Infection droplet থেকে release হওয়া Rhizobium cortical cell-এ ছড়িয়ে পড়ে এবং symbiosome তৈরি করে। ধীরে ধীরে নডিউলের ভেতরে অসংখ্য bacteroid তৈরি হয়। পরিশেষে, nitrogen fixation (N₂ → NH₃) প্রক্রিয়া শুরু হয়, যা গাছকে নাইট্রোজেন সরবরাহ করে।

    সারাংশ

    এই সমগ্র প্রক্রিয়াটি রাইজোবিয়াম ও লিগুমিনাস উদ্ভিদের মধ্যে সিমবায়োটিক সম্পর্ক গঠনের প্রথম ধাপ, যা পরবর্তীতে নডিউল গঠন এবং নাইট্রোজেন স্থায়ীকরণে পরিণত হয়।
  2. পুনঃঅববিশিষ্টকরণ হলো এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে পরিপক্ক কোষগুলি তাদের পৃথক অবস্থা পরিবর্তন করে এবং বহুত্ব অর্জন করে। পুনঃবিশিষ্টকরণ হলো এমন একটি প্রক্রিয়া যার মাধ্যমে ডিডিফারেনশিয়েটেড কোষগুলি বিভাজনের ক্ষমতা হারিয়ে ফেলে এবং স্থায়ী টিস্যুর একটি অংশে রূপান্তরিত হয়ে ভূমিকা পালনের জন্য বিশেষায়িত হয়।
  3. সিম্বায়োসোম (symbiosome) হলো উদ্ভিদের মূল গাঁঠ কোষের অভ্যন্তরে থাকা এক বিশেষ ধরনের গঠন, যা নাইট্রোজেন-স্থিরকারী ব্যাক্টেরিয়া (যেমন: Rhizobium) দ্বারা গঠিত ব্যাক্টোরোয়েডকে ঘিরে রাখে। এটি উদ্ভিদ ও ব্যাক্টেরিয়ার মধ্যে পারস্পরিক সহনশীল সম্পর্ক বজায় রাখতে সাহায্য করে।
  4. Succinoglycan একটি এক্সোপলিস্যাকারাইড (exopolysaccharide), যা প্রধানত রাইজোবিয়াম প্রজাতির ব্যাকটেরিয়া দ্বারা উৎপাদিত হয়। এটি লিগুমিনাস জাতীয় উদ্ভিদের শিকড়ে ইনফেকশন থ্রেড গঠন এবং ডায়াজোট্রোফিক নডিউল মরফোজেনেসিস প্রক্রিয়ায় গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।Succinoglycan উদ্ভিদের Nodulative Factor স্বীকৃতি প্রক্রিয়া সম্পন্ন হওয়ার পর ইনফেকশন থ্রেড গঠনে সহায়তা করে। এটি রাইজোবিয়ামের চলনক্ষমতা বৃদ্ধি করে এবং উদ্ভিদের শিকড় কোষের দেওয়ালে সংযোগ স্থাপন করে।Succinoglycan সাধারণত নিম্নলিখিত মনোমার একক দ্বারা গঠিত হয়: - 7টি গ্লুকোজ (Glucose) একক - 1টি গ্যালাক্টোজ (Galactose) একক।Succinoglycan সাধারণত নিম্নলিখিত উপাদান সংযুক্ত থাকে: - সাক্সিনেট গ্রুপ (–COCH2CH2COOH) - পাইরুভেট গ্রুপ (–COCOOH) - অ্যাসিটেট গ্রুপ (–COCH3) এই গ্রুপগুলো এর ভৌত ও রাসায়নিক বৈশিষ্ট্য নির্ধারণ করে এবং উদ্ভিদের সাথে সংযোগ স্থাপনে সাহায্য করে।
      • নোট**: প্রতিটি হরমোন উদ্ভিদের অভ্যন্তরে পরস্পরের সাথে সমন্বিতভাবে কাজ করে এবং পরিবেশ ও অণুজীব সংবেদনের ভিত্তিতে ভিন্নভাবে প্রতিক্রিয়া করে।