বিষয়বস্তুতে চলুন

কেমস্পাইডার

উইকিপিডিয়া, মুক্ত বিশ্বকোষ থেকে
কেমস্পাইডার (ChemSpider)
Content
বিবরণ১০ কোটিরও বেশি রাসায়নিক গঠন, গুণাবলি ও সংশ্লিষ্ট তথ্য
যোগাযোগ
গবেষণা কেন্দ্রক্যামব্রিজ, যুক্তরাজ্য
গবেষণা
Access
ওয়েবসাইটwww.chemspider.com
Miscellaneous
Licenseক্রিয়েটিভ কমন্স অ্যাট্রিবিউশন শেয়ার-অ্যালাইক[]

কেমস্পাইডার (ChemSpider) হলো একটি উন্মুক্ত অনলাইন রাসায়নিক তথ্যভান্ডার, যা পরিচালনা করে রয়েল সোসাইটি অফ কেমিস্ট্রি[][][][][]

এই তথ্যভান্ডারে ১০ কোটিরও বেশি রাসায়নিক অণুর তথ্য সংরক্ষিত রয়েছে, যেগুলি ২৭০টিরও বেশি উৎস থেকে সংগৃহীত। প্রতিটি অণুর জন্য একটি আলাদা শনাক্তকারী প্রদান করা হয়, যাকে বলা হয় কেমস্পাইডার শনাক্তকারী (ChemSpider Identifier)।

উৎসসমূহ

[সম্পাদনা]

এই ডেটাবেসটি নিচে উল্লিখিত বিভিন্ন উৎস থেকে সংগৃহীত তথ্য অন্তর্ভুক্ত করে:[]

পেশাদার ডেটাবেস

[সম্পাদনা]

ক্রাউডসোর্সিং

[সম্পাদনা]

কেমস্পাইডার ডেটাবেসে ব্যবহারকারীরা নিজে হাতে অবদান রাখতে পারেন—যেমন: রাসায়নিক গঠন জমা দেওয়া, স্পেকট্রা জমা দেওয়া এবং তথ্য সম্পাদনা। এটি একটি ক্রাউডসোর্সিং ভিত্তিক পদ্ধতি, যার মাধ্যমে একটি অনলাইন রসায়ন তথ্যভান্ডার তৈরি করা হয়েছে। এই পদ্ধতিতে প্রাপ্ত তথ্য দিয়ে রাসায়নিক গঠনের সঙ্গে সম্পর্কিত রাসায়নিক নামসমূহের একটি শব্দকোষ তৈরি হয়েছে, যা টেক্সট-মাইনিং গবেষণায় ব্যবহৃত হয়েছে।[১০]

তবে, ডেটাবেস অধিকারের ছাড় দেওয়া হয়নি এবং ডেটা ডাম্প-ও উপলব্ধ নয়। প্রকৃতপক্ষে, এফএকিউ-তে উল্লেখ আছে যে কেবল সীমিত পরিমাণে ডাউনলোড অনুমোদিত:[১১]। ফলে ফর্ক করার অধিকার (right to fork) নিশ্চিত নয় এবং একে মুক্ত সামগ্রী বা উন্মুক্ত তথ্যভান্ডার বলা যায় না।

বৈশিষ্ট্যসমূহ

[সম্পাদনা]

অনুসন্ধান ব্যবস্থা

[সম্পাদনা]

কেমস্পাইডারে বিভিন্ন ধরনের অনুসন্ধান পদ্ধতি বিদ্যমান:

  • স্ট্যান্ডার্ড সার্চ-এর মাধ্যমে পদ্ধতিগত নাম, বাণিজ্যিক নাম ও সমার্থক শব্দ, রেজিস্ট্রেশন নম্বর ইত্যাদি অনুসন্ধান করা যায়।
  • অ্যাডভান্সড সার্চ ব্যবহার করে রাসায়নিক গঠন, উপগঠন, আণবিক সংকেত (molecular formula), আণবিক ভরের পরিসর, CAS নম্বর, সরবরাহকারী ইত্যাদি বিবেচনায় নিয়ে ইন্টারঅ্যাকটিভ অনুসন্ধান করা যায়। এটি পূর্বে প্রাপ্ত ফলাফল প্রসারিত বা সীমিত করতেও ব্যবহৃত হতে পারে।
  • মোবাইল ডিভাইস থেকেও রাসায়নিক গঠন অনুসন্ধান করা যায়। iOS (iPhone/iPod/iPad)[১২] এবং অ্যান্ড্রয়েড-এর জন্য বিনামূল্যের অ্যাপস উপলব্ধ আছে।[১৩]

রসায়ন ডকুমেন্ট মার্কআপ

[সম্পাদনা]

কেমস্পাইডার ডেটাবেস টেক্সট মাইনিং-এর সঙ্গে একত্রে ব্যবহার করে রসায়ন ডকুমেন্ট মার্কআপের ভিত্তি হিসেবে ব্যবহৃত হয়েছে। ChemMantis[১৪] (Chemistry Markup And Nomenclature Transformation Integrated System) একটি ব্যবস্থা যা আলগোরিদম ব্যবহার করে ডকুমেন্ট ও ওয়েবপেজ থেকে রাসায়নিক নাম শনাক্ত ও সংগ্রহ করে এবং নাম-থেকে-গঠন রূপান্তর প্রক্রিয়া ও শব্দকোষ অনুসন্ধানের মাধ্যমে সেই নামগুলিকে রাসায়নিক গঠনে রূপান্তর করে। এই পদ্ধতিতে কেমস্পাইডারের মাধ্যমে ১৫০টিরও বেশি তথ্যউৎসের সঙ্গে একটি সমন্বিত তথ্যপ্রবাহ গড়ে ওঠে।

সিনথেটিকপেইজেস (SyntheticPages)

[সম্পাদনা]

সিনথেটিকপেইজেস হলো একটি বিনামূল্যের, ইন্টারঅ্যাকটিভ সিনথেটিক রসায়ন পদ্ধতির ডেটাবেস, যা পরিচালনা করে রয়েল সোসাইটি অফ কেমিস্ট্রি[১৫] এখানে ব্যবহারকারীরা নিজেরা যেসব সিনথেটিক পদ্ধতি অনুসরণ করেছেন, তা জমা দিয়ে প্রকাশ করতে পারেন। এসব পদ্ধতি মৌলিক হতে পারে, তবে সাধারণত সেগুলো কোনো সাহিত্যসূত্র ভিত্তিক প্রতিক্রিয়ার উপর ভিত্তি করে তৈরি হয়। যেখানে প্রযোজ্য, মূল উৎসের উদ্ধৃতিও দেওয়া হয়। প্রকাশের আগে একজন বৈজ্ঞানিক সম্পাদক দ্বারা যাচাই করা হয়। যদিও এগুলো বৈজ্ঞানিক জার্নাল নিবন্ধের মতো আনুষ্ঠানিক পিয়ার রিভিউ-এর মধ্য দিয়ে যায় না, তবে লগইন করা ব্যবহারকারীরা মন্তব্য করতে পারেন এবং সম্পাদকমণ্ডলী তা যাচাই করেন। এই প্ল্যাটফর্মের উদ্দেশ্য হলো গবেষণাগারে কার্যকর রাসায়নিক সংশ্লেষণ কীভাবে করা যায়, সে বিষয়ে ব্যবহারিক অভিজ্ঞতা সংগ্রহ করা। যেখানে সাধারণ একাডেমিক জার্নাল-এ পদ্ধতি সংক্ষিপ্ত ও আনুষ্ঠানিকভাবে লেখা হয়, সেখানে কেমস্পাইডার সিনথেটিকপেইজেস-এ তা আরও বিস্তারিতভাবে এবং অনানুষ্ঠানিকভাবে প্রকাশ করা হয়। মন্তব্যসহ বিস্তারিত প্রদান উৎসাহিত করা হয়। তুলনীয়ভাবে বিস্তারিত পদ্ধতির অন্য উদাহরণ হলো অর্গানিক সিনথেসিসইনঅর্গানিক সিনথেসিস

সাইটটি মূলত তৈরি করেছিলেন অধ্যাপক কেভিন বুকার-মিলবার্ন (ব্রিস্টল বিশ্ববিদ্যালয়), স্টিফেন ক্যাড্ডিক (ইউনিভার্সিটি কলেজ লন্ডন), পিটার স্কট (ওয়ারউইক বিশ্ববিদ্যালয়) এবং ম্যাক্স হ্যামন্ড। ২০১০ সালের ফেব্রুয়ারিতে ঘোষণা করা হয় যে এটি কেমস্পাইডার-এর সঙ্গে একীভূত হয়েছে এবং নতুন নাম হয়েছে ChemSpider|SyntheticPages (CS|SP)।[১৬]

অন্যান্য সেবা

[সম্পাদনা]

অনলাইনে আরও কিছু সেবা প্রদান করা হয়। এর মধ্যে রয়েছে রাসায়নিক নামকে রাসায়নিক গঠনে রূপান্তর, SMILESInChI স্ট্রিং তৈরির সুবিধা, বিভিন্ন ভৌত-রাসায়নিক পরামিতির পূর্বানুমান এবং ওয়েব সার্ভিসের মাধ্যমে এনএমআর পূর্বাভাসের সুবিধা।

ইতিহাস

[সম্পাদনা]

২০০৯ সালের মে মাসে রয়েল সোসাইটি অফ কেমিস্ট্রি (RSC) কেমস্পাইডার অধিগ্রহণ করে।[১৭] এই অধিগ্রহণের আগে কেমস্পাইডার ছিল একটি বেসরকারি প্রতিষ্ঠান, ChemZoo Inc.-এর নিয়ন্ত্রণে। এটি প্রথম চালু হয় ২০০৭ সালের মার্চ মাসে একটি বেটা রিলিজ হিসেবে এবং ২০০৮ সালের মার্চে পূর্ণাঙ্গ রিলিজ আকারে প্রকাশিত হয়।

ওপেন ফ্যাক্টস (Open PHACTS)

[সম্পাদনা]

কেমস্পাইডার Open PHACTS প্রকল্পের অংশ হিসেবে রাসায়নিক যৌগের তথ্যভান্ডার হিসেবে কাজ করে। এটি Innovative Medicines Initiative-এর একটি উদ্যোগ। ওপেন ফ্যাক্টস প্রকল্পটি উন্মুক্ত মানদণ্ড অনুসরণ করে এবং সেমান্টিক ওয়েব ভিত্তিক উন্মুক্ত প্রবেশাধিকার পদ্ধতিতে গঠিত, যার উদ্দেশ্য ছোট আণবিক ওষুধ আবিষ্কারে বিভিন্ন প্রতিবন্ধকতা দূর করা—যেমন বিচ্ছিন্ন তথ্যউৎস, মানের অভাব ও তথ্যের আধিক্য।[১৮]

আরও দেখুন

[সম্পাদনা]

সূত্র

[সম্পাদনা]
  1. Van Noorden, R. (২০১২)। "Chemistry's web of data expands"। Nature483 (7391): 524। ডিওআই:10.1038/483524aঅবাধে প্রবেশযোগ্যপিএমআইডি 22460877বিবকোড:2012Natur.483..524V 
  2. "ChemSpider Blog » Blog Archive » ChemSpider Adopts Creative Commons Licenses"www.chemspider.com। ২০১৫-০৪-০২ তারিখে মূল থেকে আর্কাইভ করা। সংগ্রহের তারিখ ২০১৪-০৩-২১ 
  3. Antony John Williams (জানু–ফেব্রু ২০০৮)। "ChemSpider and Its Expanding Web: Building a Structure-Centric Community for Chemists"Chemistry International30 (1)। 
  4. Williams, A. J. (২০০৮)। "Public chemical compound databases"। Current Opinion in Drug Discovery & Development11 (3): 393–404। পিএমআইডি 18428094 
  5. Brumfiel, G. (২০০৮)। "Chemists spin a web of data"। Nature453 (7192): 139। ডিওআই:10.1038/453139aঅবাধে প্রবেশযোগ্যপিএমআইডি 18464701বিবকোড:2008Natur.453..139B 
  6. Williams, A. J. (২০১১)। "Chemspider: A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases"। Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research। পৃষ্ঠা 363–386। আইএসবিএন 9781118026038ডিওআই:10.1002/9781118026038.ch22 
  7. Pence, H. E.; Williams, A. (২০১০)। "ChemSpider: An Online Chemical Information Resource"। Journal of Chemical Education87 (11): 1123। ডিওআই:10.1021/ed100697wবিবকোড:2010JChEd..87.1123P 
  8. "Data Sources"ChemSpider। সংগ্রহের তারিখ মে ১৬, ২০১৯ 
  9. "ChemSpider Blog » Blog Archive » The US EPA DSSTox Browser Connects to ChemSpider"। ChemSpider। আগস্ট ২৩, ২০০৮। ৭ নভেম্বর ২০১৭ তারিখে মূল থেকে আর্কাইভ করা। সংগ্রহের তারিখ ৭ নভেম্বর ২০১৭ 
  10. Hettne, K. M.; Williams, A. J.; Van Mulligen, E. M.; Kleinjans, J.; Tkachenko, V.; Kors, J. A. (২০১০)। "Automatic vs. Manual curation of a multi-source chemical dictionary: The impact on text mining"Journal of Cheminformatics2 (1): 3। ডিওআই:10.1186/1758-2946-2-3অবাধে প্রবেশযোগ্যপিএমআইডি 20331846পিএমসি 2848622অবাধে প্রবেশযোগ্য 
  11. "ChemSpider Blog » Blog Archive » Who Would Like to Have the Entire ChemSpider Database?"www.chemspider.com। ২০১৫-০৯-২৪ তারিখে মূল থেকে আর্কাইভ করা। সংগ্রহের তারিখ ২০১৪-০৪-১৮ 
  12. "ChemSpider on the App Store"App Store। নভেম্বর ১৩, ২০১১ তারিখে মূল থেকে আর্কাইভ করা। 
  13. "ChemSpider Mobile - Android Apps on Google Play"play.google.com 
  14. Welcome ChemMantis to ChemZoo and a Call for Contributions from the Community, 2008-10-23, A. Williams,blog post ওয়েব্যাক মেশিনে আর্কাইভকৃত ২০১৫-০৯-২৪ তারিখে
  15. "ChemSpider SyntheticPages"। Royal Society of Chemistry। সংগ্রহের তারিখ ২৬ জুন ২০১২ 
  16. "ChemSpider and SyntheticPages support synthetic chemistry"RSC Publishing। Royal Society of Chemistry। ২০১০-০২-০৫। ২৬ জুলাই ২০১২ তারিখে মূল থেকে আর্কাইভ করা। সংগ্রহের তারিখ ২০১২-০৬-২৬ 
  17. "RSC acquires ChemSpider"। Royal Society of Chemistry। ১১ মে ২০০৯। সংগ্রহের তারিখ ২০০৯-০৫-১১ 
  18. Williams, A. J.; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S.; Chichester, C.; Willighagen, E. L.; Evelo, C. T.; Blomberg, N.; Ecker, G.; Goble, C.; Mons, B. (২০১২)। "Open PHACTS: Semantic interoperability for drug discovery"। Drug Discovery Today17 (21–22): 1188–1198। ডিওআই:10.1016/j.drudis.2012.05.016অবাধে প্রবেশযোগ্যপিএমআইডি 22683805 

টেমপ্লেট:Royal Society of Chemistry